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一种整合蛋白质结构特征的密码子序列质量评估方法
本发明提供了一种整合蛋白质结构特征的密码子序列质量评估方法。核心思想是,密码子序列的“优劣”不应仅由其与宿主平均偏好的符合程度来衡量,更应考虑其是否服务于最终的功能目标——即高效、正确地翻译并折叠成具有特定结构的蛋白质。本发明开创性地整合了...
一种MSI下机数据的全自动处理方法及系统
本发明涉及数据处理技术领域,具体涉及一种MSI下机数据的全自动处理方法及系统,方法包括:读入imzml文件;将待分析的每个代谢物分别构建为一个列表,列表的每一元素存储一个空间位点的质谱成像数据,计算整体质荷比偏移量;基于整体质荷比偏移量获取...
一种基于改进张量岭回归的快速多组学预测方法及系统
本发明提供了一种基于改进张量岭回归的快速多组学预测方法及系统针对现有多组学数据分析中存在的计算效率低、特征融合不充分等问题,通过整合基因组、转录组、代谢组等多维组学数据,融合张量代数与统计学习技术,基于重要性投影(importance sk...
一种基于交互式知识图谱问答的药物相互作用探索方法
本发明涉及人机交互与可视化技术领域,公开了一种基于交互式知识图谱问答的药物相互作用探索方法,首先获取药物相互作用相关生物实体关联数据,构建药物相互作用知识图谱;然后解析用户输入的自然语言,提取实体、关系和属性,并通过可视化视图展示;再将结构...
一种基于图神经网络的lncRNA亚细胞定位方法及系统
本发明提供一种基于图神经网络的lncRNA亚细胞定位方法及系统,涉及生物信息学技术领域,该方法包括:获取lncRNA序列数据;将lncRNA序列数据构建为图结构,图结构中的节点代表lncRNA序列的k‑mer片段,图结构中的边代表k‑mer...
一种基于免疫原性细胞死亡相关基因的肝细胞癌预后模型构建方法及应用
本发明涉及肝细胞癌技术领域,具体涉及一种基于免疫原性细胞死亡相关基因的肝细胞癌预后模型构建方法及应用,本发明通过整合免疫原性细胞死亡相关基因(IRGs)与肝细胞癌的分子特征,构建了一个精准的预后预测模型。利用TCGA和ICGC数据库提供的训...
一种基于多组学特征的肿瘤IncRNA识别方法及系统
本发明提供了一种基于多组学特征的肿瘤IncRNA识别方法,该方法包括:构建肿瘤lncRNA训练集;构建lncRNA的多组学特征;通过已知的肿瘤lncRNA、肿瘤lncRNA训练集和多组学特征对分类器进行训练,得到训练后的模型,并通过训练后的...
一种探讨牙周炎中铁死亡相关分子机制及潜在治疗靶点的方法
本发明公开了一种探讨牙周炎中铁死亡相关分子机制及潜在治疗靶点的方法,涉及牙周炎治疗技术领域,包括以下步骤:S1、数据集初步筛选牙周炎差异基因;S2、WGCNA分析:进行加权基因共表达网络分析WGCNA,将基因表达数据导入R语言的WGCNA包...
一种利用血清蛋白质组数据开发评估肺癌检测诊断方法
本发明公开了一种利用血清蛋白质组数据开发评估肺癌检测诊断方法,涉及计算模型领域,该利用血清蛋白质组数据开发评估肺癌检测诊断方法包括以下步骤:步骤S1,整合GEO数据库的蛋白组学样本和TCGA数据库的肺癌组织样本,构建数据集,其中GEO数据库...
识别肿瘤生物标志物的方法、系统、设备及介质
本发明公开了一种识别肿瘤生物标志物的方法、系统、设备及介质。该方法包括:检索和分析TCGA数据库,获取目标肿瘤样本和健康人样本的circRNA数据集;将在目标肿瘤样本中表达但不在健康样本中表达的所有circRNA标记为第一类,将在目标肿瘤样...
一种结构学习与谱图递推算法的代谢组学数据注释方法
本发明公开了一种结构学习与谱图递推算法的代谢组学数据注释方法,属于代谢组学数据分析领域。所述方法针对现有组学数据分析瓶颈,开发了一种结合代谢反应规律建模、组学数据联合处理与代谢网络智能注释的方法,通过引入结构特征学习模型与谱图递推算法,融合...
一种未知病原微生物的鉴定分析方法
本发明公开了一种未知病原微生物的鉴定分析方法,包括以下步骤:过滤掉低完整度、污染、标签错误的基因组序列,建立高质量的病毒鉴定数据库;通过机器学习算法,构建病毒宿主预测模型;对未知病原微生物进行鉴定分析,鉴定未知微生物的潜在宿主或致病性,进一...
一种病毒宏基因组测序数据的分析方法及系统
本发明提供一种病毒宏基因组测序数据的分析方法及系统,涉及生物信息领域,所述方法包括:对原始测序数据进行质量过滤,得到过滤后的数据;根据过滤后的数据,通过De Bruijn图和重叠布局对序列进行组装,构建病毒宏基因组草图;将病毒宏基因组草图与...
一种基于MoE的单细胞测序数据预训练模型构建方法
本申请提供了一种基于MoE的单细胞测序数据预训练模型构建方法,包括:利用表达值分箱机制将基因表达矩阵中的连续表达值离散化为具有排序意义的整数值标记,得到每个细胞分箱后的基因表达值序列;获取每个细胞的基因标记序列、条件标记序列,并构建出每个细...
体外培养细胞炎症水平的定量评估系统及评估方法
本发明公开了一种体外培养细胞炎症水平的定量评估系统和评估方法,所述系统采用模块化设计,由数据收集与预处理模块、特征基因选择模块、神经网络建模模块和炎症指数计算模块;所述评估方法包括数据准备、原始数据处理、特征基因筛选、机器学习模型筛选、神经...
一种绘制脓毒症免疫细胞动态变化图谱的方法及应用
本发明提供了一种绘制脓毒症免疫细胞动态变化图谱的方法及应用,属于脓毒症治疗技术领域。本发明在scRNA‑seq技术的基础上,进行免疫文库构建,采用scVDJ‑seq测序技术对免疫微环境进行更加全面的分析,能够精准监测单个细胞的克隆来源,重建...
鸡饲料利用率性状分子检测试剂盒配套数据管理系统
本发明公开了鸡饲料利用率性状分子检测试剂盒配套数据管理系统,具体涉及家禽遗传检测领域,用于解决饲料利用率分型结果偏差问题,是通过在加样瞬间冻结全板光温栅格并递推热光场校准模板,空间漂移与时间漂移在信号源头同步剥离;实时校正后生成的曲线又经机...
用于听力损失有关变异分类和预测的方法和设备
本发明涉及一种用于关联基因突变点与特定生理特征的方法。该方法包括:从人类基因数据库接收经过测序的测试基因序列;采用具有窗口长度的滑动窗口从测试基因序列中取出基因长度等于窗口长度的测试序列片段;使用预测模型,分析测试序列片段;基于分析,判断测...
一种mRNA靶点敏感性预测模型构建方法及预测方法
本发明涉及深度学习技术领域,公开了一种mRNA靶点敏感性预测模型构建方法及预测方法,该方法包括:获取mRNA样本数据集;基于三维结构数据,构建待训练mRNA的分子图;对分子图中的每个原子进行等变几何特征初始化,获得初始等变几何特征;采用等变...
一种基于二代单细胞转录组的内含子剪接效率分析方法
本发明提供了一种基于二代单细胞转录组的内含子剪接效率分析方法,包括鉴定不同样本中每个内含子的内含子剪接效率,将所有内含子剪接效率整合为剪接效率矩阵。从所有内含子中筛选出高变异内含子,结合剪接效率矩阵与基因表达矩阵对细胞亚群重新聚类,得到多个...
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