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一种反刍动物肝实质细胞亚型分析系统
本发明公开了一种反刍动物肝实质细胞亚型分析系统,属于生物信息学与动物遗传学技术领域,包括:数据处理模块,用于执行基于单细胞测序数据的细胞分型、细胞周期分析、拟时序分析和功能富集分析,基于加权决策规则整合上述多维分析结果对肝实质细胞亚型进行交...
一种利用转录组数据筛选InDel标记引物的方法及其应用
本发明涉及一种利用转录组数据筛选InDel标记引物的方法及其应用,属于遗传学和分子生物学技术领域。本发明提供了一种利用转录组数据筛选InDel标记引物的方法,包括如下步骤:(1)获取目标品种的转录组数据,无参组装生成转录本序列;(2)比对转...
基于多模态融合与动态标签网络的蛋白质功能预测方法
本发明公开了基于多模态融合与动态标签网络的蛋白质功能预测方法,属于生物信息技术领域,本申请的标签关联网络的邻接矩阵会在模型训练过程中平滑地更新,且本申请通过提取蛋白质多种模态信息,去除多种模态之间的冗余关系提高蛋白质功能的预测效果,同时使用...
用于确定甲基化标志物的方法、装置、设备和程序产品
本公开涉及用于确定癌症的甲基化标志物的方法、装置、设备和程序产品。该方法包括基于样本的测序读数的区域的甲基化单倍型的频率,确定甲基化单倍型的先验分布。该方法还包括基于区域的甲基化单倍型的频率和先验分布,确定区域的甲基化单倍型的后验概率。该方...
基于负样本选择策略的样本集构建方法及lncRNA-miRNA关联预测方法
基于负样本选择策略的样本集构建方法及lncRNA‑miRNA关联预测方法,属于生物信息技术领域。为了解决现有方法未能恰当地使用高质量的、高可信度的负样本数据的问题,本发明基于lncRNA和miRNA的序列信息,利用各自的序列相似性分别得到序...
生物样本数据的分析方法
本发明提供了一种生物样本数据的分析方法。应用于数据处理技术领域,所述方法包括获取泛基因组图和生物样本的测序读长数据,通过分层图分割将泛基因组图动态划分为多个子图,分割密度根据基因组区域的变异复杂度自动调整;将测序读长数据在每个子图内执行拓扑...
一种大豆耐盐碱性状改良方法
本发明涉及作物遗传改良领域,公开了一种大豆耐盐碱性状改良方法,该方法通过多个耐盐碱大豆品种及其对照品种的全基因组测序数据、基因表达数据、表型数据和环境数据,得到融合特征向量;之后基于融合特征向量,通过目标耐盐碱预测模型和SHAP分析,确定优...
基于叶绿体基因组揭示热带植物起源与扩散的分析方法
本发明提出了基于叶绿体基因组揭示热带植物起源与扩散的分析方法,涉及植物分析技术领域,获取待分析植物的未上传的完整叶绿体基因组数据;以已上传NCBI的待分析植物叶绿体基因组为参考,注释叶绿体基因组序列并检查注释结果;对叶绿体全基因组进行序列比...
一种基因导入驱动的抗病性作物育种方法
本发明属于植物育种技术领域,本发明公开了一种基因导入驱动的抗病性作物育种方法,包括采集目标作物种植环境中的病原群体信息,构建病原动态作用谱,识别诱导目标作物产生应激响应的遗传调控位点,联合分析病原胁迫下的转录激活位点,输出目标作物的应激表达...
空间多组学整合方法、装置、设备及存储介质
本申请提供一种空间多组学整合方法、装置、设备及存储介质。涉及空间多组学技术领域。该方法包括:获取双组学数据集,基于其构建含空间图和特征图的邻接图;借组学内整合模块,对空间图、特征图执行图卷积,拼接空间与特征潜在表示并输入多层感知机,得组学内...
鸭抗甲肝病毒感染生存状态的预测方法
本发明公开了鸭抗甲肝病毒感染生存状态的预测方法,包括:(1)以鸭血液IFN‑α以及IFN‑β的含量为变量构建PCA预测模型;(2)测定待测鸭血液IFN‑α以及IFN‑β的含量;(3)将所测定的鸭血液IFN‑α以及IFN‑β的含量代入到预测模...
用于发现新编码区的蛋白质基因组学分析方法及系统
本发明提供了一种用于发现新编码区的蛋白质基因组学分析方法,分别对基因组序列进行DNA六框翻译以及对转录组序列进行RNA三框翻译,并将对应的翻译结果合并以构建为定制数据库;通过多步数据库搜索策略对质谱数据进行搜索,得到新肽段鉴定结果;将鉴定到...
牙髓血运重建中EDTA诱导细胞分化的多组学数据融合分析方法
本申请属于牙髓血运重建技术领域,涉及牙髓血运重建中EDTA诱导细胞分化的多组学数据融合分析方法,本发明通过设置EDAT处理组与对照组及多个时间点,同步采集多组学原始数据和定量表型数据,为解析动态规律提供了时空匹配的多层面数据基础;再通过标准...
一种疾病标志物功能域解析方法
一种疾病标志物功能域解析方法,属于疾病标志物领域,包括以下步骤:获取待测疾病标志物的一级结构序列,采用多序列比对方法进行多维数据分解,得到保守序列片段与可变序列片段,计算序列片段的横向关联度和纵向关联度;基于所述保守序列片段与所述可变序列片...
一种心肌干细胞的分化潜能评估方法及系统
本发明公开了一种心肌干细胞的分化潜能评估方法及系统,涉及生物识别技术领域。用于高效、精准预测细胞分化潜能。在低氧环境下,通过活细胞工作站对单个心肌干细胞线粒体网络进行连续动态成像,并利用形态计量学算法量化网状连接度及嵴膜重构状态,建立单细胞...
一种基于深度学习的扇贝裙边ACE抑制肽活性的方法及系统
本发明公开了一种基于深度学习的扇贝裙边ACE抑制肽活性的方法及系统,涉及生物工程技术领域,包括:基于不同肽的模拟体内试验数据与肽水平特征数据得到综合数据集,筛选关键特征并划分训练集和测试集;初始化随机森林、SVM、逻辑回归三种模型并使用训练...
一种基于离子电流与隧穿电流特征的碱基测序校验方法及系统
本申请涉一种基于离子电流与隧穿电流特征的碱基测序校验方法,包括:测得离子电流及隧穿电流;将离子电流的降幅与标准离子电流降幅进行比对,得到离子电流对应的碱基属于该标准离子电流降幅对应的碱基的分类概率;将隧穿电流与标准隧穿电流进行比对,得到该隧...
一种信号降噪处理方法及系统
本申请涉生物技术领域,尤其涉及一种信号降噪处理方法及系统,包括:收集原始离子电流信号,并构建原始离子电流信号片段和与之对应的纯净离子电流信号片段关联的训练集;构建降噪神经网络模型,并为该降噪神经网络模型定义损失函数;通过训练集和损失函数,训...
图神经网络与特征融合的马铃薯基因组选择方法及系统
本发明涉及农业信息技术与生物技术领域,且公开了图神经网络与特征融合的马铃薯基因组选择方法及系统,S1:获取马铃薯的基因型数据和表型数据,并进行预处理,包括数据清洗、标准化和降维;S2:将降维后的基因型数据构建为图结构数据,其中节点表示样本,...
基于深度学习归因分析和束式组合优化的特征基因选取方法及系统
本发明提供一种基于深度学习归因分析和束式组合优化的特征基因选取方法及系统,涉及生信分析技术领域,包括:获取单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据;基于单细胞RNA测序数据,通过融合XGBoost多维度重要性度量与深度学习SHAP归因分析的...
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