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一种基于因果图嵌入与条件细胞网络的基因调控推断方法
一种基于因果图嵌入与条件细胞网络的基因调控推断方法,涉及预测基因调控网络技术领域,包括:1、从scRNA‑seq中获取基因表达矩阵,并生成因果图;2、基于因果图和已知的基因调控网络图,利用图神经网络模型生成基因的局部特征嵌入矩阵;3、基于s...
一种基于大语言模型的抗体序列优化方法
一种基于大语言模型的抗体序列优化方法,涉及信息技术与人工智能领域。包括:构建融合抗体序列、结构特征与自然语言描述的多模态训练数据集;利用该数据集对选定的基础大语言模型进行监督微调,以使其学习抗体的语言模式与结构功能关系;输出微调后的抗体领域...
用于生物空间转录组切片的空间域识别方法及装置
本发明公开了一种用于生物空间转录组切片的空间域识别方法及装置,包括:根据带噪空间转录组切片中细胞的空间位置信息构建空间近邻细胞网络;根据预处理后的带噪空间转录组切片中的基因表达数据构建基因表达细胞网络;通过非负矩阵分解对空间近邻细胞网络和基...
基于类内散度矩阵的随机向量函数链网络用于GPCR-蛋白质相互作用的预测方法
本发明涉及一种基于类内散度矩阵的随机向量函数链网络用于GPCR‑蛋白质相互作用的预测方法。它解决了现有技术中预测方法容易导致少数类样本的识别能力不足,影响预测准确性,且类别间的区分性较弱,影响分类性能的问题。它包括S1、数据集构建:从数据库...
一种基于多模态特征处理及融合的circRNA-miRNA关系预测方法
一种基于多模态特征处理及融合的circRNA‑miRNA关系预测方法,它属于circRNA与miRNA关系预测技术领域。本发明解决了现有方法无法提取到深层次的结构信息、获得的生物学信息不完善,关注的模态特征少且不同模态特征之间存在信息冗余的...
基于多模态GAT与GAN的非编码RNA结构功能解析方法
本发明公开了一种基于多模态GAT与GAN的非编码RNA结构功能解析方法,经消化道肿瘤患者的非编码RNA数据和互作分子数据构建图结构数据并进行特征提取,得到序列特征、结构特征和表达量分布;计算出特征对应的相似度;利用相似度和特征构建序列模态图...
一种分析非甾体抗炎药的肝毒性与肾毒性共同作用机制的方法
本发明提供一种分析非甾体抗炎药的肝毒性与肾毒性共同作用机制的方法。本方法包括以下步骤:NSAIDs的初步毒性预测与毒性作用靶点收集、肝肾疾病靶点收集,然后通过靶点的交叉和筛选得到NSAIDs诱导肝肾疾病的核心靶点以及共同核心靶点,进而构建共...
用于鉴别hvKP和cKP菌株的预测模型、系统、构建方法及应用
本发明公开了一种用于鉴别hvKP和cKP菌株的预测模型、系统、构建方法及应用。该构建方法基于预设的候选生物标志物,对训练集进行LASSO回归分析,筛选出初始生物标志物;再对初始生物标志物进行logistics回归分析,获得目标生物标志物;采...
基于Graph Transformer的空间转录组学组织空间域智能识别方法
本发明提供一种基于Graph Transformer的空间转录组学组织空间域智能识别方法,包括:读取空间转录组学数据文件;采用预训练深度学习模型提取组织学图像数据中的特征;设定空间距离阈值;根据设定空间距离阈值获取各采样点的空间位置数据,并...
一种工程藻株重组蛋白表达的培养基优化方法
本发明提供一种工程藻株重组蛋白表达的培养基优化方法,属于生物信息学和合成生物学技术领域,本发明提出一种工程藻株重组蛋白表达的培养基优化方法,通过构建培养基组分特征库,将组分与目的蛋白进行配对编码,采用深度神经网络建立关联分析模型。该方法首先...
分子标记辅助选育的基因组优化配置分析系统及方法
本发明公开了分子标记辅助选育的基因组优化配置分析系统及方法,涉及生物信息技术领域。用于解决多基因协同优化中遗传互作失真、环境响应滞后及育种执行脱节的问题。该系统包括冲突消解模块、环境适配模块、互作压缩模块和配置生成模块:冲突消解模块通过表型...
基于细粒度信息引导大模型推理的蛋白质属性预测方法
本发明公开一种基于细粒度信息引导大模型推理的蛋白质属性预测方法,涉及人工智能技术领域。方法包括:构建基于蛋白质属性预测模型架构;获取用户输入的蛋白质氨基酸序列和自然语言提示词;将蛋白质氨基酸序列输入预训练好的蛋白质语言模型中进行编码,获得蛋...
帕金森病认知障碍早期生物标志物及其应用、帕金森病智能分析系统
本发明提供了帕金森病认知障碍早期生物标志物及其应用、帕金森病智能分析系统。生物标志物为GALC基因。帕金森病认知障碍早期生物标志物的智能分析系统包括数据整合模块和数据分析模块。数据整合模块用于获取帕金森病生物标志物的基因检测结果、嗅觉测试得...
基于微生物群落的工业废水毒性快速评估方法
本发明公开了基于微生物群落的工业废水毒性快速评估方法,具体涉及毒性评估技术领域,包括S1:胁迫评估平台构建、S2:胁迫响应数据采集、S3:群落功能冗余度量化、S4:代谢通量扰动追踪、S5:动态网络毒性指数生成。本发明通过动态胁迫反应器模拟废...
宏基因组病原微生物一站式检测的方法和装置
本发明提供了一种宏基因组病原微生物一站式检测的方法和装置,涉及生物技术领域。该方法包括识别每个样本的测序数据属于单端测序或属于双端测序;然后根据识别结果差异处理测序数据;然后对样本进行不同生物学层次的物种注释和相对丰度估算;然后合并注释结果...
基于可扩展精度混沌和强化学习的DNA辅助乳腺癌的检测方法
本发明提供一种基于可扩展精度混沌和强化学习的DNA辅助乳腺癌的检测方法,具体为:1.诊断系统的初始化,包括:初始化DNA基因数据库、强化学习模型参数、可扩展精度混沌和哈希参数,DNA基因片段的聚类和散列;2.提取病人基本信息和DNA基因训练...
一种克氏原螯虾精氨酸激酶与鲨源纳米抗体的相互作用分析方法
本发明提出了一种克氏原螯虾精氨酸激酶与鲨源纳米抗体的相互作用分析方法,包括:对VNAR序列进行三维结构预测并用拉氏图筛选出高置信度的VNAR模型;将VNAR模型所对应的氨基酸序列与精氨酸激酶序列对接,获得最优复合物模型,解析精氨酸激酶表位区...
一种基于强化学习的T细胞受体结构优化方法
一种基于强化学习的T细胞受体结构优化方法,它属于人工智能生物医药技术领域。本发明解决了现有方法收敛效率低、缺乏目标导向性、生成的TCR的特异性弱的问题。本发明基于获取的TCR‑pMHC复合物结构数据构建TCR的结构片段库,并设定几何约束规则...
一种神经网络增强的碱基漂移式DNA存储纠错编码方法
本发明涉及编码技术领域,具体公开了一种神经网络增强的碱基漂移式DNA存储纠错编码方法;该方法首先将二进制数据映射为满足GC含量、均聚物长度、正交性及重复子串等多维生物学约束的DNA编码单元,并建立编码字典(Codebook)。模拟DNA合成...
评估衰老程度的系统
本申请涉及一种用于评估衰老程度的系统,其通过考虑细胞的代谢组学数据来计算细胞代谢组状态的评分,从而评估细胞的衰老程度。本申请的系统特别适用于化妆品功效评价、抗衰老药物筛选等场景,在实际应用中可缩短研发周期,具有显著的产业化应用价值。
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