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  • 本申请涉及生物信息技术领域,提供图神经网络的全基因组选择方法、装置、设备及存储介质,图神经网络的全基因组选择方法包括:将单核苷酸多态性SNP映射到基因水平,并转换为基因嵌入向量;基于预设的多源生物学先验知识,构建基因交互网络;将目标性状输入...
  • 本发明公开一种基于NGS技术的微卫星不稳定检测标志物组合筛选方法及应用,属于基因检测技术领域,该方法先以MSS正常样本为基础,通过滑动窗口算法筛选高一致性样本构建覆盖度基线,结合肿瘤纯度校正MSI‑H肿瘤样本信号,采用二项分布与二分法计算假...
  • 本申请涉及生物医药技术领域,公开了基于液体活检的肿瘤标志物微量检测与分析方法。该方法包括:提取外周血游离DNA并进行双端测序;从测序数据中联合提取ctDNA片段长度分布、末端序列偏好、核小体定位信号及CpG甲基化状态等多维特征;通过时空对齐...
  • 本申请公开了一种生物系统临界状态的预警方法、装置、设备及存储介质,涉及生物信息学技术领域,通过网络拓扑指标来量化局部网络扰动程度,能够在疾病症状显现前敏锐捕捉到细胞网络拓扑结构的异常转折信号,为疾病早期预警提供判定依据。其中方法包括:获取细...
  • 本申请提供一种预测空间基因表达的方法、电子设备及介质,所述方法包括:获取待检测病理组织学图像;提取所述待检测病理组织学图像的第一视觉特征;基于预设投影模型,将所述第一视觉特征转换为第一视觉特征向量;基于所述第一视觉特征向量,根据预设匹配模型...
  • 本发明提供了空间域识别的多头双路径注意力方法、系统、设备及介质,属于生物信息与计算机技术领域。该方法包括:首先基于空间转录组坐标与基因表达构建局部邻接图和增广邻接图;随后以视图级注意力动态融合双路径特征,再并行施加多头图注意力,捕获多子空间...
  • 本发明提供一种鉴定梭梭和白梭梭中抗旱关键AGO基因的方法,涉及基因鉴定技术领域。该鉴定梭梭和白梭梭中抗旱关键AGO基因,通过hmmscan筛选、同源比对及CDD/PFAM结构域验证,分别鉴定出梭梭中45个HaAGO基因和白梭梭中30个HpA...
  • 本发明涉及生物技术领域,且公开了一种胃‑肿瘤新靶点发现的方法及系统建立方法;本发明通过整合单细胞二代测序与三代全长转录组技术,并采用CopyKat与Infercnv双重算法模型,克服了传统批量测序无法解析肿瘤异质性及常规单细胞测序难以准确鉴...
  • 本发明涉及数据分析技术领域,特别是涉及一种多来源单细胞转录组数据的整合分析方法及系统。所述方法包括:将不同来源单细胞转录组数据的所有基因名称转换为统一版本,过滤来源特异性基因;构建特异性背景基因池并进行污染基因鉴定,消除背景RNA污染;计算...
  • 本发明公开一种密码子使用偏好性分析方法和装置、系统、存储介质,包括:步骤S1、对原始转录组测序数据进行预处理,得到可靠的比对reads集;步骤S2、对可靠的比对reads集进行基因组装,获得潜在基因序列集;步骤S3、对潜在基因序列集进行序列...
  • 本发明提供了一种肺腺癌免疫细胞亚群网络标志物筛选方法。本发明的肺腺癌免疫细胞亚群网络标志物筛选方法通过构建兼具特异性和准确性的肺腺癌免疫细胞亚群网络标志物筛选模型,筛选出能精准表征免疫细胞亚群特征的网络标志物;同时,通过建立基于网络标志物的...
  • 本发明涉及生物信息分析技术领域,特别是涉及一种剪接因子对单细胞水平功能干扰程度的评估方法及系统。所述方法包括:获取单细胞转录组的细胞‑基因表达谱并提取出剪接因子对应的基因表达量,计算出每个细胞中剪接因子的活跃分数;确定剪接因子扰动基因集,计...
  • 一种基于离散扩散模型的T细胞受体序列设计方法,它涉及一种T细胞受体序列设计方法。本发明为了解决传统 TCR 发现方法依赖实验筛选,存在成本高、周期长、靶点覆盖有限的问题。本发明通过 BLOSUM 转移矩阵确保生成序列符合 TCR 自然进化规...
  • 本发明涉及一种基于深度自动编码器与自适应光谱移位的拉曼光谱生化成分解混方法,包括:采集单细胞的拉曼光谱,构建数据集;对所述数据集进行预处理;构建深度自动编码器神经网络模型,并利用预处理后的数据集对所述深度自动编码器神经网络模型进行训练;其中...
  • 本发明提供了基于铁死亡相关miRNA的癌症亚型分类的方法、系统、设备及程序产品,属于智能医疗领域。本发明基于铁死亡相关miRNA将乳腺癌划分成四个亚型,并基于铁死亡活性鉴定出乳腺癌FAP+亚型,通过建立FAPscore衡量个体乳腺癌患者的F...
  • 本发明公开了一种水处理工艺的微生物综合指标构建与智能预测方法及系统,所述方法包括:获取不同类型水处理生物系统中的微生物样本,利用16S rRNA高通量测序获得相对丰度矩阵,建立微生物存在与丰度分布之间映射关系的深度学习模型;利用深度学习模型...
  • 本申请实施例公开了一种基因表达分析方法、装置、电子设备及可读存储介质,属于生物信息学技术领域以及数据处理领域。其中,方法包括 : 基于待测样本的目标细胞类型中基因的聚合表达值,以及参考样本的目标细胞类型中基因的基准表达值,确定目标细胞类型中...
  • 本申请实施例公开了一种基于单细胞测序数据的分析方法、装置及电子设备,属于生物信息学技术领域以及数据处理领域。其中,方法包括 : 获取基于单细胞测序数据的注释结果,所述注释结果包括单细胞转录组注释结果和单细胞VDJ注释结果;根据所述注释结果确...
  • 本发明涉及基因检测技术领域,公开了一种结核分枝杆菌耐药基因检测数据分析系统,包括:数据导入模块、信号校正模块、特征提取模块、多级判读模块、结果融合模块和报告生成模块。系统对检测仪输出的荧光强度值进行基线漂移修正、异常点检测与非线性归一化,提...
  • 本发明属于生物信息学领域,具体涉及一种基于低覆盖度基因组测序与多模型融合的病原微生物检测方法、系统及其应用。针对传统流程低丰度病原检出难、假阴假阳率高、无群体预警能力的不足,流程经预处理(质量过滤、接头修剪、去宿主)后,并行用参考数据库比对...
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