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用于高通量生物合成喷墨打印控制方法及控制装置
本发明涉及合成生物学领域,尤其是指用于高通量生物合成喷墨打印控制方法及控制装置,所述方法包括:从获取的DNA碱基序列文件中按序提取碱基数据,形成一维原始数组;根据预设打印宽度,将一维原始数组转换为二维阵列,同时进行可视化处理,为不同碱基赋予...
一种蛋白质序列性质预测方法、装置、设备和存储介质
本申请涉及一种蛋白质序列性质预测方法、装置、设备和存储介质,其中,所述方法包括:基于ESM蛋白质语言模型和多任务分类器,构建多任务分类模型;将蛋白质序列数据集输入至多任务分类模型中进行训练,蛋白质序列数据集包括多个指定蛋白质序列以及对应的标...
一种基于微生物活性监测的开郁曲发酵过程动态控制方法
本申请提供一种基于微生物活性监测的开郁曲发酵过程动态控制方法,包括:根据数据集,提取显著变化趋势特征,确定酸碱度偏移的时间窗口和幅度范围,以及相应的产物组分偏离程度;根据目标菌群组合的特性,从预设的调控策略库中匹配对应的酸碱度调整方案,获取...
利用中介序列MSA与扩散掩码机制的肽序列生成模型及生成方法
本发明涉及一种利用中介序列MSA与扩散掩码机制的肽序列生成模型及生成方法,具体为包含进化信息的肽序列AI模型训练方法。创新性引入中介序列,解决肽因序列过短而无法直接获取进化信息的问题。首先对肽数据集构建MSA,对于其中无法构建有效MSA的,...
一种基于简易基因组组装的无参考基因组物种个体识别方法
本发明涉及一种简易基因组组装的无参考基因组物种个体识别方法,属于生物信息学和遗传学技术领域。针对缺乏参考基因组的物种,本发明提供了一种完整的个体识别流程,包括简易基因组的组装、群体SNP位点库的构建以及低深度测序数据的个体识别验证。本发明的...
基于多维基因修剪的生成对抗网络微阵列数据缺失值填补方法
本发明涉及一种基于多维基因修剪的生成对抗网络微阵列数据缺失值填补方法,包括以下步骤:将含有缺失值的原始数据分成两大类,含有缺失值的基因集合,完整的基因集合;将缺失率最高的缺失基因从中挑出记为目标基因;剩余基因与完整基因集一起进行基因修剪;采...
基于多智能体协同的零代码生物信息分析方法及装置
本发明提出一种基于多智能体协同的零代码生物信息分析方法和装置,包括:通过提示词将大语言模型设定为多个智能体,利用多个智能体,共同对工具库里的工具进行打分和重排,经过讨论找到最佳的匹配工具;利用多个探索者的智能体,根椐不同工具的输入输出参数进...
数据处理方法、生物数据表征模型训练方法以及计算设备
本说明书实施例提供数据处理方法、生物数据表征模型训练方法以及计算设备,该生物数据表征模型训练方法包括:确定至少两类生物训练数据,并确定待训练的生物数据表征模型;基于所述至少两类生物训练数据,确定至少两类生物训练样本、以及所述至少两类生物训练...
一种生物反应器输入性波动预测预报方法与系统
本发明涉及一种生物反应器输入性波动预测预报方法与系统,包括:基于反应器外生变量以及外部环境变量的历史样本,生成历史样本特征数据集;提取外生变量与外部环境变量之间基于copula熵的关联关系特征,生成重构序列特征数据集;运用基于概率编程框架的...
一种基于深度学习的蛋白质功能预测方法及系统
本发明涉及生物信息学领域,提供一种基于深度学习的蛋白质功能预测方法及系统。该方法包括:构建蛋白质的多模态数据集;通过编码器对所述多模态数据集进行特征提取,获得多模态特征;通过所述多模态特征训练神经网络,获得预测模型;通过所述预测模型对待测的...
一种面向菌种开发的智能检索推理方法及系统
本发明属于人工智能与合成生物学交叉技术领域,公开一种面向菌种开发的智能检索推理方法及系统,该方法包括:从开放获取数据库中采集便携式文档格式文档,经过文档解析处理,生成轻量级标记语言文件,并通过语义拆分成文本段落,形成数据集;以拆分后的文本段...
适用于低深度测序的目的性状的预测方法、适用于低深度测序的全基因组选择模型
本发明提供了一种适用于低深度测序的目的性状的预测方法、适用于低深度测序的全基因组选择模型,涉及生物技术领域。本发明提供的适用于低深度测序的目的性状的预测方法和全基因组选择模型,利用低深度全基因组重测序数据结合机器学习技术,能够在有限数据量下...
一种抗氧化肽的计算设计方法及系统
本发明公开了一种抗氧化肽的计算设计方法及系统,属于生物信息学与多肽设计技术领域。该方法及系统包括:基于经过适配的语言模型,构建抗氧化肽活性预测模型和抗氧化肽序列生成模型;利用活性预测模型的输出,通过包含强化学习的目标导向优化过程,指导序列生...
利用AI驱动PCA与随机森林结合鉴定桑树品种的方法
本发明公开了利用AI驱动PCA与随机森林结合鉴定桑树品种的方法,包括:先获取待鉴定桑树种子构建DNA文库,经双末端测序、数据预处理及比对等步骤得到注释后的SNP数据;再对数据编码,结合PCA和奇异值分解提取主SNP位点,通过机器学习算法训练...
一种预测靶肽分类和裂解位点的方法及系统
本发明公开一种预测靶肽分类和裂解位点的方法,获取数据集;将数据集中序列输入DeepMaT模型进行训练,所述训练包括:通过ISM模块中提取序列的进化信息并隐式地融入三维结构信息,获得肽序列特征;将所述肽序列特征输入依次连接的Mamba2模块、...
一种基于多模态拓扑一致性的空间域识别方法及装置
本发明公开了一种基于多模态拓扑一致性的空间域识别方法及装置,本发明属于转录组空间域识别领域,该方法包括:基于生物组织的空间转录组学数据,构建与其包含的各模态信息一一对应的多层网络;提取多层网络共享的共识性结构特征与各层网络特有的特异性结构特...
特异性序列分级数据库及其构建方法、筛选特异性序列的方法、装置
本申请属于生物信息学技术领域,具体涉及一种特异性序列分级数据库及其构建方法、筛选特异性序列的方法、装置。本申请提供一种特异性序列分级数据库的构建方法,包括构建K‑mer特异性分类级别数据库,以及采用所述数据库筛选目标分类级别的特异性基因组序...
细胞类型的注释方法及注释系统
本发明公开了一种细胞类型的注释方法及注释系统。其中,注释方法包括:确认单细胞数据和空间转录组数据的共同基因,提取单细胞数据与共同基因对应的第一基因表达、以及空间转绿组数据与共同基因对应的第二基因表达;利用共同编码器对第一基因表达进行特征提取...
一种针对DNA测序数据的压缩及解压缩方法
一种针对DNA测序数据的压缩及解压缩方法,属于生物信息技术领域。为了解决现有技术在压缩三代测序数据时灵活性差、压缩率低的技术问题。本发明提供的一种针对DNA测序数据的压缩方法,在压缩前可动态选择全局压缩或分块压缩,针对不同类型的数据采取不同...
一种湖泊水动力水质模型的边界条件概化方法
本发明涉及一种湖泊水动力水质模型的边界条件概化方法,通过数据驱动约束机制对流量、水位和污染物浓度等参数进行自适应分组,能较好地反映上述物理量的非恒定过程,从而更加准确地反映污染物在湖泊中的运动。该方法相比人工梯级概化具有更高的精度和效率,且...
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