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一种单细胞类型识别方法、系统、设备及存储介质
本申请公开了一种单细胞类型识别方法、系统、设备及存储介质,单细胞类型识别方法包括获取第一单细胞数据集、第二单细胞数据集、第一类别权重值和第一聚焦参数;基于第一单细胞数据集,通过构建好的第一单细胞类型识别模型对第一类别权重值和第一聚焦参数进行...
一种基于层级变分自编码器的空间转录组数据特征提取方法及系统
本发明公开了一种基于层级变分自编码器的空间转录组数据特征提取方法及系统,包括:对待处理的基因表达矩阵进行预处理,获得预处理后的数据,并基于所述预处理后的数据构建稀疏图结构的邻接矩阵;将所述预处理后的数据输入层级变分自编码器模型进行处理,输出...
一种医疗生物芯片检测质量监控方法及系统
本发明提出了一种医疗生物芯片检测质量监控方法及系统,涉及检测质量监控技术领域,对生物芯片进行监控和对照的对应检测,对检测数据进行时序划分和对应,获得检测对应数据,根据检测对应数据获取干扰检测特征数据;获得时序划分后的监控检测数据和干扰检测数...
一种基于全基因组关联分析与机器学习的金黄色葡萄球菌耐药性预测方法
本发明提供了一种基于全基因组关联分析与机器学习的金黄色葡萄球菌耐药性预测方法,属于生物信息学与人工智能交叉技术领域。选取红霉素、环丙沙星、青霉素、夫西地酸和甲氧西林五种常见抗生素作为建模对象。以参考基因组对菌株基因组进行比对和SNP位点检测...
一种基于蛋白质语言模型和深度学习的卵菌效应蛋白预测方法
一种基于蛋白质语言模型和深度学习的卵菌效应蛋白预测方法,涉及生物信息学和机器学习领域。本发明方法为:一、卵菌效应蛋白数据与非效应蛋白数据收集;二、通过蛋白质语言模型获取蛋白质嵌入;三、对数据进行过采样处理;四、深度学习模型构建;五、模型训练...
一种生物数据分析处理方法及系统
本发明公开了一种生物数据分析处理方法及系统,包括:基于抗性表型预测模型和产量预测模型构建组合模型,获取燕麦不同基因型组合种植的当前种植数据,包括生长数据与基因型数据;将基因型数据输入至抗性表型预测模型,获得抗性表型预测输出;将抗性表型预测输...
一种玉米基因功能评估方法、系统、设备及存储介质
本申请公开了一种玉米基因功能评估方法、系统、设备及存储介质,玉米基因功能评估方法包括基于第一窗口长度和第一滑动步长,通过滑动窗口方法对第一训练数据集的历史玉米基因组序列进行切割,得到第二训练数据集;基于第二窗口长度和第二滑动步长,通过滑动窗...
一种乌苏里貉皮肤毛囊单细胞转录组图谱及其构建方法
本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种乌苏里貉皮肤毛囊单细胞转录组图谱及其构建方法。该构建方法包括:采集冬毛期雄性乌苏里貉背中部皮肤组织样本,解离并制成单细胞悬液,构建cDNA文库及测序;将原始测序数据比对到参考基因组,对高通量单细胞转录组数...
基于标准样品的菌种基因检测方法及系统
本发明提供了基于标准样品的菌种基因检测方法及系统,涉及菌种基因检测技术领域,所述方法包括:分别对多个标准样品和待测样品进行实时荧光定量PCR检测,获得多个标准检测数据和样品检测数据,根据多个标准检测数据对样品检测数据进行菌种基因检测,获得菌...
一种雌核发育大黄鱼基因组中父本黄姑鱼DNA片段的鉴定方法
本发明公开了一种雌核发育大黄鱼基因组中父本黄姑鱼DNA片段的鉴定方法,本方案以大黄鱼基因组为参考坐标系,通过鉴定黄姑鱼特异变异位点及分析雌核发育大黄鱼在黄姑鱼特异变异位点处的基因型筛选雌核发育大黄鱼基因组中的父本阳性位点,再多序列比对、计算...
一种用于肺结节良恶性鉴别诊断的甲基化标志物的筛选方法、试剂盒及应用
本发明公开了一种用于肺结节良恶性鉴别诊断的甲基化标志物的筛选方法、试剂盒及应用。通过对本地构建的肺结节甲基化数据集和TCGA中肺腺癌DNA甲基化数据集进行甲基化差异分析、反向筛选、以及候选标志物在组织与配对血浆一致的分析和过滤等操作,本发明...
测序数据处理方法、装置、设备、介质及产品
本申请提供一种测序数据处理方法、装置、设备、介质及产品,涉及核酸测序技术领域。该方法包括:获取目标样本的测序读段,测序读段包括第一标记码和第二标记码;基于校验位编码确定信息位编码是否正确;确定信息位编码错误,采用预设RS算法确定信息位编码中...
蛋白质翻译后修饰位点的多光谱智能识别系统
本发明公开一种蛋白质翻译后修饰位点的多光谱智能识别系统,包括:光谱数据获取模块,控制不同光谱分析仪器并行地对蛋白质样品进行光谱扫描并进行模数转换和格式化,得到多种蛋白质多光谱原始数据;智能分析模块,对每种蛋白质多光谱原始数据进行预处理与特征...
处理游离DNA单分子多模态特征的方法、设备和程序产品
本公开涉及用于处理样本的游离脱氧核糖核酸cfDNA的测序读数的方法、装置、电子设备和程序产品。该方法可以通过提取、整合和理解单个cfDNA分子的多种生物特征,来进行cfDNA和样本的类型检测。其中该方法包括获取cfDNA的测序读数,其中cf...
肠道菌群生物标记物及其在制备多囊卵巢综合征诊断产品中的应用
本发明公开了肠道菌群生物标记物及其在制备多囊卵巢综合征诊断产品中的应用,属于微生物及内分泌学领域。本发明筛选到20种与PCOS显著相关的肠道微生物,并基于这20种微生物丰度和机器学习LASSO算法构建得到用于诊断PCOS的风险估算公式。本发...
一种特征编辑方法、装置及设备
本发明提供一种特征编辑方法、装置及设备,所述方法包括:获取基因特征的调整参数;对所述基因特征进行调整并实时获取所述基因特征的提示信息;当所述提示信息中的内容与所述调整参数相匹配时,结束调整并形成对应的目标基因特征。本发明可以非常快速地调整特...
机器学习的MST引物推荐方法、装置、设备及介质
本申请涉及机器学习的MST引物推荐方法、装置、设备及介质。所述方法包括:获取包括引物序列、宿主来源类型及扩增性能参数的历史MST引物数据集;并提取每条引物序列的GC含量、熔解峰锐度和Ct值波动系数等多维特征向量,生成结构化特征矩阵;随后基于...
一种引物设计方法、装置及设备
本发明提供一种引物设计方法、装置及设备,引物设计方法包括:获取目标碱基序列的双链结构;从所述双链结构的一个单链中获取待定引物;对所述待定引物进行修饰并实时确定所述待定引物的提示界面中的引物参数是否符合预设条件;当所述引物参数符合预设条件时,...
一种基于多模态的抗原特异性T细胞鉴定方法及系统
本发明属于生物信息学领域,公开了一种基于多模态的抗原特异性T细胞鉴定方法及系统,该方法将单细胞测序获得的基因表达、CDR3序列、TCR的V/D/J基因以及T细胞亚型多模态特征进行融合,以提升抗原特异性T细胞的识别与分类精度,采用新型预处理策...
基于双路类注意力机制与动态门控融合的基因组选择方法
本发明公开了一种基于双路类注意力机制与动态门控融合的基因组选择方法,属于基因组选择技术领域。所述方法包括以下步骤:获取基因遗传多态性位点的012编码矩阵,使用独立效应模块和协同效应模块分别捕获SNP位点的独立效应和协同效应,并通过动态门控将...
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