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  • 本发明公开了一种基于长纯合片段的虾类个体近交系数最优评估参数构建方法,属于水产动物分子育种技术领域,其包括以下步骤:(1)将虾类样本的重测序数据利用对应虾类参考基因组进行SNP的筛查与分型,获得对应个数的全基因组SNP标记;(2)非基因组特...
  • 本发明公开了一种基于特征重要性选择单核苷酸多态性进行表型预测的方法,该方法先对SNP数据进行缺失填充,并在与表型相关的筛选前将样本划分为训练集与测试集以避免数据泄漏;随后以基因为单位,对位于启动子、外显子与内含子的SNP采用回归模型拟合表型...
  • 本发明属于基因编辑靶点设计技术领域,特别是一种基因编辑靶点设计的方法及装置和设备,包括:设置靶点设计参数,然后输入相关分析文件;根据输入的变异位点文件,通过提取特定样本的变异位点信息,然后对目标序列进行靶点序列设计;或根据各变异位点在群体内...
  • 本发明提供了一种面向种鸡选育过程的多性状协同决策支持方法及系统,涉及计算机技术领域,包括:获取肉用种鸡个体的基因组序列数据、不同生理阶段的生产性状时序数据以及拮抗性状数据;根据基因组序列数据和拮抗性状数据进行遗传基础解析,得到遗传拮抗图谱;...
  • 本发明公开了一种基于纳米孔长读长测序数据的序列精确分析方法及系统。该方法通过minimap2算法将纳米孔测序数据与参考基因组比对,筛选出目标区域及上下游特定范围的高质量长读长序列;提取各读长的目标区域局部序列,计算编辑距离矩阵并进行Box‑...
  • 本发明公开了一种通过游离DNA评估组织和器官损伤的方法。该方法包括:提取健康人群血浆游离DNA,获取DNA片段末端信息,计算健康人群DNA功能元件的功率谱;获取健康人群各组织或器官中各细胞类群的标准化基因表达信息,形成参考数据集;以同样的方...
  • 基于转移熵和能量阻挫的预测蛋白质变构位点的集成模型方法,属于蛋白质功能性位点预测技术领域。首先,收集整理了变构蛋白质数据集,构建训练集和独立测试集。然后,按照以下四个步骤进行:一是根据蛋白质变构数据库信息标记经实验验证的正构位点和变构位点;...
  • 本发明公开了一种通过分析减数分裂重组率评估男性生育力的方法及系统,包括:获取受试者的二倍体生物样本和多个单体精子细胞;通过测序分别确定其在杂合基因座上的二倍体及单倍体基因型;基于基因型数据,为每个精子细胞识别并过滤减数分裂交叉事件,从而计算...
  • 本发明提供了一种基于纳米孔自适应采样和深度学习的细菌病原体检测模型的构建方法及应用该模型进行细菌病原体的检测方法、设备、介质和程序产品,涉及纳米孔测序技术领域。细菌病原体的检测方法包括:获取待检测水样;将待检测水样输入本申请构建的检测模型中...
  • 本发明公开了一种基于注意力机制与图变分自编码器的单细胞多模态数据整合方法,所述方法包括如下步骤:步骤1、多模态数据预处理与细胞关系图构建;步骤2、基于多头注意力的跨模态邻接矩阵融合;步骤3、图变分自编码器训练与多目标优化;步骤4、多目标损失...
  • 本发明属于生物医学领域临床检测技术中的基因检测技术,具体涉及用于检测干燥综合征的STAT4基因多态性位点组合,该组合为rs3771326、rs6715106、rs3024904、rs3024851、rs3024908、rs3771327、r...
  • 本发明公开了一种基于二代测序数据的突变背噪过滤算法,涉及高通量测序数据分析技术领域,以解决现有技术依赖基线、适配性差、假阳性高的问题。该算法先预处理测序数据获pileup文件,按序列上下文分类位点并计算错误率,构建分层背噪模型检验突变,结合...
  • 本发明涉及品质评估领域,具体涉及基于生长周期时序编码的Transformer大豆品质评估方法,包括获取多时相遥感数据,基于识别不同基因型大豆的关键物候转折点,构建具有基因型特异性的生长阶段序列;针对每个基因型特异性的生长阶段序列,提取多模态...
  • 本申请涉及蛋白质工程与生物信息学技术领域,具体提供一种蛋白质适应度预测方法、装置、终端及存储介质,方法包括:利用预训练的蛋白质语言模型提取野生型序列级表征和突变型序列级表征,并计算二者间的表征差值向量;从多序列比对信息中推断出共进化耦合信息...
  • 本申请提供了一种mRNA帽子结构表达效率的预测方法、预测系统和存储介质。所述预测方法包括获取待预测的mRNA帽子结构相关分子的SMILES序列,基于SMILES序列生成DGL分子图,对DGL分子图进行第一编码得到图向量,对SMILES序列进...
  • 本发明公开了基于簇级自监督对比学习的多组学癌症亚型识别方法,具体按以下步骤实施:步骤1,数据预处理;步骤2,预训练深度图卷积网络;步骤3,基于跨组学簇级自监督对比学习模块;步骤4,待步骤3中完成网络优化后,利用优化后的参数计算样本的概率分布...
  • 本发明涉及农业生物技术领域,公开了植物性饲料遗传标记FTIR光谱筛选方法,该方法首先从具有遗传多样性的植物群体中获取多个植物个体的饲料样品并采集其FTIR光谱数据;接着对这些光谱数据进行预处理并提取量化的光谱特征参数,从而为每个植物个体建立...
  • 本发明涉及生物信息技术领域,具体为脑胶质瘤微环境形成关键分子机制解析方法,包括以下步骤:调用表达数据分析细胞标志物顺序构建分段区间,计算候选因子表达方向判断趋势一致性,识别表达聚集差异构建分裂节点区段,分析通路变化趋势生成漂移评分,评估多标...
  • 本发明公开了一种蛋白标志物组合的筛选方法,用于腹主动脉瘤或破裂腹主动脉瘤的风险预测,通过构建初始蛋白表达谱,优化蛋白表达谱的稳定性;采用统计学分析筛选差异表达蛋白,基于生存分析或风险回归模型,初步锁定与疾病终点显著关联的候选蛋白;联合稀疏约...
  • 本发明公开了一种基于改进关系网络的蛋白质变构位点突变效应预测系统,该系统通过蛋白质语言模型提取野生型变构蛋白与突变型变构蛋白的序列与结构特征,并利用跨模态注意力机制和门控网络融合生成综合特征矩阵。改进的关系网络采用引入混合注意力模块和在原来...
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