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一种基于超高灵敏度突变负荷预测病症复发的装置
本发明属于生物医药领域,提供了一种基于超高灵敏度突变负荷预测病症复发的装置,本发明通过整合COSMIC等著名肿瘤公共数据库,设计了一款覆盖急性髓系白血病28个热点突变区域的MRD基因检测panel,结合定量阻断剂置换扩增QBDA技术,可检测...
一种乳腺癌辅助治疗预测模型及其应用
本发明公开了一种乳腺癌辅助治疗预测模型及其应用,属于乳腺癌技术领域。本发明利用基因对协同表征,构建基因对特征系统(Gene‑Pair Classification System,GPCS),克服了传统模型基于差异表达基因(DEGs)造成的受...
基于大规模表达图谱相关性的双硫死亡调控基因预测方法、系统、设备、介质及程序
本发明公开了基于大规模表达图谱相关性的双硫死亡调控基因预测方法、系统、设备、介质及程序,属于双硫死亡调控基因预测技术领域。利用PEER方法计算由人类大规模基因表达图谱数据转化形成的转录组基因表达矩阵的表达残差,并用其代替基因表达量,获得全基...
一种多组学分析肺癌脑转移驱动基因的识别方法和系统
本发明提供了一种多组学分析肺癌脑转移驱动基因的识别方法和系统,包括:数据质控,从公共数据源中获取单细胞RNA测序数据,通过标准化处理后进行初始细胞筛选,去除低质量数据并保证数据的可靠性;去批次效应,采用去批次效应算法,消除批次之间的技术偏差...
一种基于微生物群落演替监测的大曲发酵控制方法和系统
本发明涉及微生物群落监测领域,具体为一种基于微生物群落演替监测的大曲发酵控制方法和系统,根据大曲堆积物的表面属性数据,划分形成若干采样区域,并根据采样区域的物质结构,标定大曲样本采集空间参数;根据大曲样本的基因测序原始数据,确定大曲堆积物的...
基因组序列压缩方法及系统
本申请涉及生物信息学数据处理技术领域,尤其涉及一种基因组序列压缩方法及系统。本方法包括:获取基因组测序数据;将测序数据与参考基因组比对确定差异位点;通过时序差分神经网络模型区分差异位点为测序错误或真实变异;根据识别结果执行差异化压缩编码;构...
商品比较方法,商品交互方法及各自对应的装置
说明书实施例提供商品比较方法,商品交互方法及各自对应的装置,其中,商品比较方法,包括:显示购物车页面,所述购物车页面包括N个待交易商品,N为大于或者等2的正整数,基于针对所述N个待交易商品中M个待交易商品的选择操作,显示商品比较页面,所述商...
一种对类器官模型进行实时毒性预测的方法和系统
本发明公开了一种对类器官模型进行实时毒性预测的方法和系统,属于生物医药技术与人工智能交叉领域。该方法首先获取所述类器官模型的多模态时间序列数据,所述数据包括多通道图像数据与非图像数据;接着,对获取的数据进行融合预处理,形成统一的特征向量序列...
配体逃逸路径确定方法及装置、电子设备和存储介质
本公开涉及一种配体逃逸路径确定方法及装置、电子设备和存储介质,方法包括:获取蛋白质与配体在结合状态下的第一结构模型,所述第一结构模型包括蛋白质结构模型和配体结构模型;对所述配体结构模型进行解离操作,使所述配体结构模型与所述蛋白质结构模型解离...
一种嗜冷蛋白酶PETase的制备方法
本发明公开了一种嗜冷蛋白酶PETase的制备方法,所述方法包括:挖掘设计PETase候选序列集;以PET寡聚物BHET的衍生物为底物进行所述PETase候选序列集中每个候选酶的酶活测定获得酶活测定数据;基于所述酶活测定数据筛选所述PETas...
RNA二级结构预测方法和装置、系统、存储介质
本发明公开一种RNA二级结构预测方法和装置、系统、存储介质,基于卷积神经网络模型和启发式算法结合预测RNA二级结构;其中,卷积网络部分采用AlexNet作为前置基础网络,后续网络使用上采用反卷积后跟对应的正向特征矩阵进行叠加输出,训练过程中...
一种基于One-hot编码的质谱数据分析方法及系统
本发明通过One‑hot编码简化了质谱数据的复杂性,并通过质谱熵相似性匹配算法实现了对化合物质谱数据的高效且精确的评估,充分展示了其在处理MS2数据方面的可行性与优势,利用One‑hot编码技术,对质谱数据中质荷比(m/z)进行转换,通过将...
一种基于时序碱基图结构的纳米孔测序电流预测方法
本发明提供了一种基于时序碱基图结构的纳米孔测序电流预测方法,用于从核苷酸化学结构直接预测k‑mer特征离子电流。时序碱基图结构融合原子级结构信息与时序信息,将k‑mer中的每个碱基单独编码成一个原子级图结构,并根据碱基在纳米孔中的通过顺序,...
一种基于纳米孔系统的多肽序列差异及其翻译后修饰的检测方法
本发明公开一种基于纳米孔系统的多肽序列差异及其翻译后修饰的检测方法,所述方法中构建了一种纳米孔系统,包括α‑溶血素纳米孔和嵌入所述纳米孔内的八氨基修饰γ‑环糊精;所述α‑溶血素纳米孔的氨基酸序列包含突变位点M113R和T145R;所述检测方...
一种藻类细胞染色体整合外源基因的方法
本发明提供一种藻类细胞染色体整合外源基因的方法,属于生物信息学和合成生物学技术领域,本发明提出的藻类细胞染色体整合外源基因方法首先采集细胞状态特征并通过卷积神经网络优化培养条件,进行细胞收集和外源基因导入,经电穿孔处理后进行恢复培养和抗生素...
一种基于自适应路径选择的circRNA和疾病关联关系的高效预测方法、系统及应用
本发明公开了一种基于自适应路径选择的circRNA和疾病关联关系的预测方法,包括如下步骤:下载获取circRNA、疾病、miRNA相互之间关联关系的数据库,构建关联矩阵;下载疾病描述信息,计算并获得疾病语义相似度矩阵并平均,得到疾病融合相似...
一种基于知识增强图对比学习的蛋白质复合物识别方法
本发明公开了一种基于知识增强图对比学习的蛋白质复合物识别方法,属于生物信息学的技术领域,本发明通过利用基因表达谱和亚细胞定位数据来修剪边,构建了一个知识增强的PPI网络,并将分子功能和生物过程作为网络属性纳入其中作为增强网络的属性。对知识增...
一种生物信息分析流程自动化构建系统
本发明公开一种生物信息分析流程自动化构建系统,包括:意图理解与语义解析模块,将用户输入的自然语言文本,解析成符合生物信息分析任务要求的结构化任务描述;知识图谱与检索模块,负责构建生物信息学领域专用知识图谱,以提供知识检索与推荐服务;流程生成...
一种基于关键标记基因的智能细胞类型注释方法
本发明公开了一种基于关键标记基因的智能细胞类型注释方法,该方法利用参考数据库中已知的标记基因构建静态知识库,通过TF‑IDF方法为标记基因赋予细胞特异性权重,从而提高注释的准确性与可解释性。同时,在静态匹配不充分的情形下,本发明通过大语言模...
基于TEE服务器集群的蛋白质功能域重编方法、装置
本申请涉及一种基于TEE服务器集群的蛋白质功能域重编方法、装置。所述方法包括:接收客户端发送的含已知功能域的待重编蛋白质数据;基于TED数据库,对已知功能域进行相似域检索,获取结构相似的目标功能域;从蛋白质数据库中获取目标功能域对应的目标替...
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