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基于加权集成卷积神经网络噬菌体宿主预测方法
本发明公开一种基于加权集成卷积神经网络噬菌体宿主预测方法,包括:对输入的噬菌体蛋白序列和宿主受体蛋白序列获得联合特征向量;将噬菌体‑宿主对作为正样本,对每个噬菌体随机选择非宿主细菌生成负样本,划分为M个子集,每个子集与全部正样本合并形成M个...
一种基于蛋白质语言模型和深度学习的真菌效应蛋白预测模型
一种基于蛋白质语言模型和深度学习的真菌效应蛋白预测模型,涉及生物信息学和深度学习技术领域,本发明方法为:一、真菌效应蛋白数据与非效应蛋白数据收集;二、通过蛋白质语言模型获取蛋白质嵌入;三、对数据进行过采样处理;四、深度学习模型构建;五、模型...
一种基于线性回归模型鉴定中性粒细胞亚群的分群方法
本发明公开了一种基于线性回归模型鉴定中性粒细胞亚群的分群方法,通过现有的中性粒细胞库筛选得到最佳特征基因集,并通过皮尔逊相关系数方法,计算得到未知亚群的中性粒细胞与G5a亚群、G5b亚群和G5b亚群的相关系数,基于相关系数计算得到每个中性粒...
一种基于选择性状态空间模型与半正定规划求解的RNA二级结构预测方法
本发明提出了一种基于选择性状态空间模型(SSM)与半正定规划(SDP)求解的RNA二级结构预测方法,旨在解决现有方法计算复杂度高、效率低以及长程依赖建模困难的问题。该方法通过选择性状态空间模型提取RNA序列的全局特征,以解决长程依赖问题。通...
一种糖基化点位预测的方法、装置、介质及设备
本发明公开了一种糖基化点位预测的方法、装置、介质及设备。该方法首先遍历待预测蛋白质序列,找出其中符合天冬酰胺‑X‑丝氨酸或苏氨酸序列基序的待评估点位,然后通过对对应天冬酰胺点位和丝氨酸或苏氨酸点位标记化处理,输入至蛋白质语言模型得到对应嵌入...
一种基于生物网络融合的致病驱动基因预测方法及相关设备
本发明提供了一种基于生物网络融合的致病驱动基因预测方法及相关设备,通过获取多种训练用驱动基因数据;基于蛋白质相互作用、基因序列相似性、KEGG通路共现、基因共表达模式及基因本体的语义相似性构建初始基因关系图谱,并将多种训练用人类驱动基因数据...
一种基于对比学习的抗氧化肽预测方法及系统
本发明涉及多肽序列识别技术领域,尤其涉及一种基于对比学习的抗氧化肽预测方法及系统;通过构建标准数据集和多模态对比学习模型,显著提升了抗氧化肽预测的准确性与可靠性,通过融合序列特征、理化性质特征和结构特征三大模态特征,结合对比学习机制在潜在空...
基于多分支深度卷积神经网络的蛋白质棕榈酰化转移酶预测方法及系统
本发明公开了一种基于多分支深度卷积神经网络的蛋白质棕榈酰化转移酶预测方法及系统,属于生物信息学与人工智能技术领域。该方法包括:S1、获取待测蛋白序列;S2、将蛋白序列输入预先训练的 iPalmT 模型;S3、根据模型输出结果判断目标蛋白是否...
一种基于注意力机制的抗癌药物反应预测方法
本发明属于生物信息学领域,涉及一种基于注意力机制的抗癌药物反应预测方法。首先,通过多层感知机捕获统一维度的药物和癌细胞系特征;其次,采用Transformer编码器融合药物特征,构建细胞编码器用于癌细胞系特征聚合;然后,设计跨模态交叉融合模...
一种基于动态基线法确定PCR扩增曲线Ct值的方法及系统
本发明公开了一种基于动态基线法确定PCR扩增曲线Ct值的方法及系统,涉及分子生物学技术领域,方法包括确定起势点;基于起势点确定基线起点和基准终点;确定基线;进行归一化处理;确定Ct值;输出扩增曲线与Ct值。本发明通过自动化计算基线阈值,无需...
一种基于快速质谱技术的血流感染致病菌快速检测方法
本发明公开了一种基于快速质谱技术的血流感染致病菌快速检测方法,属于医疗检测技术领域。利用UVP‑TOFMS分析血流感染致病菌代谢气体,获得致病菌代谢轮廓谱图;对获得的致病菌代谢轮廓谱图数据进行预处理;利用堆叠算法集成预处理后的致病菌代谢轮廓...
一种用于质谱数据自动化分析与可视化的基于R脚本的网络分析系统及方法
本申请公开了一种用于质谱数据自动化分析与可视化的基于R脚本的网络分析系统及方法,涉及质谱数据分析领域,该系统中的用户交互模块用于提供图形化用户交互界面;数据上传模块用于接收原始质谱数据文件、校验文件格式、记录文件状态并将文件存储于本地指定目...
肝细胞癌血管生成拟态相关恶性细胞亚群分子标志物的筛选系统及方法
本发明涉及肿瘤分子生物学与精准医学技术领域,具体为一种肝细胞癌血管生成拟态相关恶性细胞亚群分子标志物的筛选系统及方法,该筛选系统包括:单细胞转录组分析模块,借AUCell、CytOTRACE算法及双重阈值筛选VMAMCs亚群;特征筛选建模模...
一种基于人工智能的杂粮中刺激GLP-1分泌功能因子的筛选方法
本发明公开了一种基于人工智能的杂粮中刺激GLP‑1分泌功能因子的筛选方法,包括以下步骤:步骤一、杂粮样本预处理;步骤二、多维度特征数据获取;步骤三、人工智能筛选模型构建与训练;步骤四、功能因子筛选与验证,本发明的优点:本发明通过梯度溶剂提取...
一种基于细胞空间转录组数据的细胞互作识别方法
本发明公开了一种基于细胞空间转录组数据的细胞互作识别方法,包括:根据细胞空间邻近性构建细胞对,并结合配体‑受体数据库计算每对细胞的互作信号矩阵及空间信息;随后利用图神经网络生成细胞对嵌入表示,并计算细胞对间相似度,同时基于基因表达矩阵计算细...
免疫相关基因在黑色素瘤预后预测中的应用
本发明提供了免疫相关基因在黑色素瘤预后预测中的应用。本发明基于大规模黑色素瘤样本的测序数据,系统筛选出一组与总生存期密切相关的免疫相关基因,并构建风险评分模型。该模型可准确对黑色素瘤患者进行生存风险分层,为临床治疗策略制定和个体化管理提供可...
一种基于表征学习的DNA测序读段聚类方法及系统
本发明属于DNA数字存储与生物信息学交叉领域,公开了一种基于表征学习的DNA测序读段聚类方法及系统,方法包括:对原始DNA测序读段进行预处理,得到测序读段本身以及对应的变体1、变体2集合;基于测序读段本身以及对应的变体1、变体2集合,通过深...
一种基于混合专家模型的DNA测序读段重构方法及系统
本发明属于DNA数字存储与生物信息学交叉领域,公开了一种基于混合专家模型的DNA测序读段重构方法及系统,对原始DNA测序读段进行聚类,将聚类后的读段通过核苷酸‑颜色映射转换为图像形式,并进行长度归一化和聚类大小调整,得到标准化的3通道图像;...
一种树木生物量的计算方法及系统
本申请提供的一种树木生物量的计算方法及系统,包括:获取用户选择的数据库文件和输入的树木参数;其中,数据库文件预先根据用户选择的数据文件进行创建并存储得到;树木参数至少包括胸径、树高和树种;从数据库文件中提取树种对应的生物量模型和计算参数;将...
UO2燃料在高燃耗条件下裂变气体肿胀行为的建模方法
本申请一些实施例中公开了一种UO2燃料在高燃耗条件下裂变气体肿胀行为的建模方法,通过耦合晶粒细化和气泡演化,准确确定UO2燃料中高燃耗结构中的辐照气泡引起的辐照肿胀的规律。方法包括构建总自由能密度函数;基于再结晶晶粒形核理论,建立晶粒细化的...
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