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一种基于神经网络的全长基因序列建模方法及系统
本发明提供一种基于神经网络的全长基因序列建模方法及系统,该方法的步骤包括:对初始的单细胞RNA测序数据构建第一表达矩阵,对所述第一表达矩阵进行质量控制变换,得到第二表达矩阵;将所述第二表达矩阵输入到预设的分箱嵌入模块,得到分箱嵌入矩阵;通过...
一种基于协同建模的单细胞RNA测序数据恢复与特征提取方法及系统
本发明公开了一种基于协同建模的单细胞RNA测序数据恢复与特征提取方法及系统,涉及生物信息学与人工智能技术领域。本发明包括数据获取步骤、数据预处理、恢复步骤、优化步骤、第一提取步骤、筛选步骤、第二提取步骤。本发明有效提升了数据完整性与下游特征...
基于深度学习的复方补牌结肠缓释片有效部位筛选方法
本发明涉及中药复方制剂有效成分筛选技术领域,公开了基于深度学习的复方补牌结肠缓释片有效部位筛选方法,包括:构建时序药效通路库,记录复方补牌结肠缓释片各成分在多个时间点的生物通路活性数据;设计因果干预溯源网络,通过反事实干预分析量化各成分对通...
一种用于治疗抑郁症用药预测的SNP位点检测试剂盒
本发明涉及基因测定技术领域,具体涉及一种用于治疗抑郁症用药预测的SNP位点检测试剂盒,包括数据获取模块、基因限制分析模块、药物推荐分析模块和药物推荐生成模块,通过采集当前患者的SNP位点的基因解读数据,基因解读数据至少包括基因解读表和基因药...
具有时空特异性的药物靶点的筛选方法、系统和计算机设备
本发明公开一种具有时空特异性的药物靶点的筛选方法、系统和计算机设备,涉及生物信息学和计算生物学技术领域。所述筛选方法基于单细胞转录组测序数据,所述方法包括:(1)定量重构细胞在组织中的空间定位和功能模式,其包括:1.1)将所述单细胞转录组测...
基于表型匹配的罕见病信息录入与基因突变分析方法、系统及存储介质
本发明公开了一种辅助罕见病临床信息录入和基于表型分析基因突变的方法和系统。首先通过多源数据采集模块获取患者的语音、文本及图像形式的临床信息转换为文字,并进行实体识别与规范化处理,生成结构化的病历数据。其次,从结构化数据中提取临床表型。进一步...
基于大数据分析的羊肚菌菌株杂交选育优化方法
本发明公开了基于大数据分析的羊肚菌菌株杂交选育优化方法,涉及农业生物技术领域,包括以下步骤:获取纳秒级统一时间基线与跨链路相位残差谱,在多时序信号对齐条件下重构干扰脉冲指纹,构建初始化面;基于初始化面建立时间反演证据链,反向重演干扰脉冲指纹...
一种基因表达调控解析的神经网络计算方法及其装置
本申请一种基因表达调控解析的神经网络计算方法及其装置,涉及生物信息学技术领域,该方法包括:获取第一特征数据及第二特征数据;构建包含多个调控层级的输入特征;将多个调控层级的输入特征及第二特征数据输入至目标神经网络模型,输出对基因表达状态的预测...
细胞类型丰度预测方法、装置、设备及存储介质
本申请提供一种细胞类型丰度预测方法、装置、设备及存储介质。涉及细胞类型预测技术领域。该方法包括:获取组织病理图像并划分图像块;经病理基础模块提取图像块形态特征;以图像块为节点,基于空间位置构建超图,经超图神经网络卷积处理,聚合邻居节点特征得...
一种绒毛羊基因组选择育种的最优算法框架方法
本发明提供了一种绒毛羊基因组选择育种的最优算法框架方法,本发明在统一环境下采集标准化表型数据,采用不低于50万SNP密度的基因分型,结合严格的质量控制标准和Beagle高精度插补,显著提升基因型数据完整性与准确性。本发明构建包含个体ID、系...
一种基因编辑羊目标性状遗传稳定性评估方法
本发明提供了一种基因编辑羊目标性状遗传稳定性评估方法,涉及基因编辑与动物遗传育种技术领域。本发明通过构建F0至F3代基因编辑羊群体,结合CRISPR/Cas9技术精准编辑目标基因,在F0代严格筛选高编辑效率、低嵌合度、低脱靶风险个体;通过多...
一种绒毛羊基因组选择育种技术体系构建方法
本发明提供了一种绒毛羊基因组选择育种技术体系构建方法,本发明涉及绒毛羊基因组选择育种技术领域,本发明先构建参考群体,从多地区、多遗传背景的绒毛羊中挑选样本,收集表型数据并进行基因分型;接着建立基因组选择模型,对基因型和表型数据处理后用GBL...
一种反刍动物肝实质细胞亚型分析系统
本发明公开了一种反刍动物肝实质细胞亚型分析系统,属于生物信息学与动物遗传学技术领域,包括:数据处理模块,用于执行基于单细胞测序数据的细胞分型、细胞周期分析、拟时序分析和功能富集分析,基于加权决策规则整合上述多维分析结果对肝实质细胞亚型进行交...
一种利用转录组数据筛选InDel标记引物的方法及其应用
本发明涉及一种利用转录组数据筛选InDel标记引物的方法及其应用,属于遗传学和分子生物学技术领域。本发明提供了一种利用转录组数据筛选InDel标记引物的方法,包括如下步骤:(1)获取目标品种的转录组数据,无参组装生成转录本序列;(2)比对转...
基于多模态融合与动态标签网络的蛋白质功能预测方法
本发明公开了基于多模态融合与动态标签网络的蛋白质功能预测方法,属于生物信息技术领域,本申请的标签关联网络的邻接矩阵会在模型训练过程中平滑地更新,且本申请通过提取蛋白质多种模态信息,去除多种模态之间的冗余关系提高蛋白质功能的预测效果,同时使用...
用于确定甲基化标志物的方法、装置、设备和程序产品
本公开涉及用于确定癌症的甲基化标志物的方法、装置、设备和程序产品。该方法包括基于样本的测序读数的区域的甲基化单倍型的频率,确定甲基化单倍型的先验分布。该方法还包括基于区域的甲基化单倍型的频率和先验分布,确定区域的甲基化单倍型的后验概率。该方...
基于负样本选择策略的样本集构建方法及lncRNA-miRNA关联预测方法
基于负样本选择策略的样本集构建方法及lncRNA‑miRNA关联预测方法,属于生物信息技术领域。为了解决现有方法未能恰当地使用高质量的、高可信度的负样本数据的问题,本发明基于lncRNA和miRNA的序列信息,利用各自的序列相似性分别得到序...
生物样本数据的分析方法
本发明提供了一种生物样本数据的分析方法。应用于数据处理技术领域,所述方法包括获取泛基因组图和生物样本的测序读长数据,通过分层图分割将泛基因组图动态划分为多个子图,分割密度根据基因组区域的变异复杂度自动调整;将测序读长数据在每个子图内执行拓扑...
一种大豆耐盐碱性状改良方法
本发明涉及作物遗传改良领域,公开了一种大豆耐盐碱性状改良方法,该方法通过多个耐盐碱大豆品种及其对照品种的全基因组测序数据、基因表达数据、表型数据和环境数据,得到融合特征向量;之后基于融合特征向量,通过目标耐盐碱预测模型和SHAP分析,确定优...
基于叶绿体基因组揭示热带植物起源与扩散的分析方法
本发明提出了基于叶绿体基因组揭示热带植物起源与扩散的分析方法,涉及植物分析技术领域,获取待分析植物的未上传的完整叶绿体基因组数据;以已上传NCBI的待分析植物叶绿体基因组为参考,注释叶绿体基因组序列并检查注释结果;对叶绿体全基因组进行序列比...
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