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  • 本发明涉及生物医药技术领域,公开了一种融合多组学数据的肺纤维化药物靶点筛选方法。该方法从公共数据库和实验数据源采集肺纤维化相关的多组学原始数据;对数据进行质量控制和归一化处理,生成标准化多组学数据集;通过数据融合技术将该数据集整合为统一的多...
  • 本发明公开了一种基于多维数据选择指数的植物基因组预测方法、产品及设备,属于植物育种技术领域。该方法包括:S1.数据准备:获取目标物种的物种数据,确保每个个体的多组学数据与表型一一对应;S2.模型构建:采用包含内层和外层两个循环的5折交叉验证...
  • 本发明提出一种用于 circRNA–miRNA 相互作用预测的方法及系统 TGrKCMI。该方法利用预训练模型提取 circRNA 与 miRNA 的序列特征,并通过 PCA 降维以减少冗余信息;随后引入带门控机制的多头注意力模块对序列特征...
  • 本发明属于生物信息学技术领域,更具体地,涉及一种基于单细胞大模型与图注意网络的空间域识别方法。该方法包括以下步骤:S1、数据预处理;S2、采用scGPT全人类模型提取隐藏特征;S3、从预处理后的数据中筛选出排名前3000的高变异基因,并将其...
  • 本发明公开一种图脉冲神经计算的circRNA‑miRNA‑mRNA互作用预测系统及方法。所述方法包括:以复杂疾病的高通量测序组学数据为基础,构建疾病、蛋白质、基因、lncRNA、miRNA、mRNA和circRNA的异质生物信息网络;然后,...
  • 本发明提供的基于代谢导向聚类的肿瘤相关巨噬细胞代谢分型方法,通过收集并整理用于分析的单细胞RNA测序数据集,再从中识别并提取肿瘤相关巨噬细胞群体,消除了技术偏差;基于肿瘤相关巨噬细胞群体构建核心代谢基因集合,再进行核心代谢基因的权重分配与优...
  • 本公开涉及用于确定血液标志物的方法、血液标志物和试剂盒。该方法包括获取针对癌症血液样本中的第一区域的片段集合,第一区域包括多个甲基化位点。该方法还包括确定与片段集合相关联的一个或多个甲基化单倍型的第一分布。该方法还包括响应于确定第一分布与健...
  • 本发明公开了一种潜在功能寡肽的快速筛选方法,所述筛选方法包括:步骤一、从功能相关蛋白质的氨基酸序列中提取固有无序区域IDRs;步骤二、使用word2vec模型分析所述固有无序区域IDRs的特征,评估其中氨基酸之间的相关性;步骤三、计算寡肽之...
  • 本发明属于生物信息学和蛋白质组学领域,具体涉及一种用于高灵敏度单细胞蛋白质组研究的靶向性轻量化谱图库构建系统及其应用。该系统以单细胞DIA数据为基础,通过高置信度肽段提取、功能蛋白优先导入、目标导向谱图推演、表达评分驱动的条目压缩以及结构降...
  • 本发明公开了一种基于深度学习模型的磷酸胆碱胞苷酰转移酶挖掘方法。该方法突破传统同源比对的限制,能够在数亿级蛋白序列空间中以更高的筛选效率与预测精度识别出具有高催化活性、优异可溶性且适于工程化应用的 CCT 候选酶。在此基础上结合理性设计与零...
  • 本发明公开了一种增强三阴性乳腺癌放疗敏感性的方法、系统、计算机设备及存储介质,属于智能医疗技术领域,本发明首次报道了CITED1促进剂可显著增强三阴性乳腺癌放疗敏感性,该方案通过诊断数据信息采集器获取待诊者肿瘤组织中CITED1基因表达水平...
  • 本发明提供了融合基因型与高通量表型的基因组预测方法及系统,通过构建G2PFormer模型,包括采用多维空间特征提取器提取材料内SNP位点间的特征,融合材料间的遗传特征;采用时序性DLinear方法捕获全生育期高通量表型组数据时序性变化的趋势...
  • 本发明涉及生物技术领域,尤其涉及多重核酸扩增熔解曲线的分析方法。本发明提供了用熔解曲线二阶求导的多重核酸扩增熔解曲线的分析方法,所述方法与传统判读方法相比较,减少了避免了因阴性对照异常导致的误判,同时提高了复杂样本和低丰度的样本检测的准确性...
  • 本发明涉及细胞生物学、再生医学领域,尤其涉及一种脐带间充质干细胞代次判定及最优代次评估方法,包括如下步骤:S1.获取待判定代次的hUC‑MSCs,进行体外培养至对数生长期末期;S2.采用全基因组重亚硫酸盐甲基化测序检测所述hUC‑MSCs中...
  • 本发明公开了一种用于免疫状态分析的集成式计算机系统,属于免疫检测技术领域。本发明通过获取待检测用户的T细胞受体的第一测序数据,并获取当前时刻之前的历史用户的T细胞受体的第二测序数据,根据第一测序数据构建的第一无向加权图,其中,第一无向加权图...
  • 本发明公开了用于癌症基因组和临床数据综合分析的多组学搜索引擎,搜索引擎由计算机系统实现,包括处理器、存储器以及存储在所述存储器中并可由处理器执行的程序指令,程序指令被配置为使处理器执行如下步骤:构建并维护一个动态的多组学语义索引结构,在持续...
  • 本发明提出了一种基于基因组数据的无谱系动物配对评估方法,属于生物信息学和保护遗传学技术领域,首先获取种群中所有个体的全基因组测序数据,经质量控制后得到高质量SNP位点集;针对种群中所有可能的雌雄配对组合,计算亲本间亲缘系数deepKin、亲...
  • 本发明公开了一种基于长读长测序的CAR定点整合模式定量分析方法,包括建立包含目标位点上下游的参考序列,利用长片段PCR获取覆盖整合区域的片段并进行三代测序;通过结构解析算法识别reads的HA完整性、位置一致性与拷贝结构特征,将测序读段分为...
  • 本发明涉及亲子鉴定技术领域,具体涉及一种流产物亲子关系鉴定的方法、设备及存储介质,首先获取流产物样本、疑父及孕母三方基因组DNA,经测序质控比对和分型得到各自基因分型数据;接着判断流产物样本是否为混合物,若为混合物且母源DNA占比超预设值,...
  • 本发明提出了基于全基因组测序法检测动物近交水平的指导方法和系统,属于基因组学与分子生物学领域。解决了低质量数据在进行ROH检测时误差大的的问题。方法包括:获取真实参考基因组数据和全基因组测序数据,并进行预处理,包括筛选无碱基缺失序列的常染色...
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