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一种基于表型组学辅助山楂育种的方法
本发明公开了一种基于表型组学辅助山楂育种的方法,涉及表型组学辅助山楂育种技术领域。包括:S1、利用高通量成像系统和表型分析系统采集正常生长的山楂表型数据,对山楂多种性状进行检测和分析;S2、建立山楂多维表型组数据库,获取山楂育种关键性状量化...
林木智慧育种的自适应特征融合基因型-表型预测方法
本发明公开了林木智慧育种的自适应特征融合基因型‑表型预测方法,涉及林木育种与智能交叉技术领域,该方法的具体步骤为:多模态数据采集、数据预处理、自适应特征融合、表型预测模型构建和表型预测;本发明通过主成分分析与特征关联强化技术实现多模态数据的...
一种基于正常血液的全外显子测序数据的体细胞变异检测方法及装置
本发明涉及体细胞变异检测技术领域,公开了一种基于正常血液的全外显子测序数据的体细胞变异检测方法及装置,其中方法,包括:从正常血液中获取血液全外显子测序数据的变异位点;对变异位点依次进行过滤、单倍体分型、单倍型分类预处理;将预处理后的变异位点...
一种基于染色体互作的基因组结构变异检测方法和系统
本发明属于生物信息处理技术领域,具体涉及一种基于染色体互作的基因组结构变异检测方法和系统;包括:获取Hi‑C互作矩阵和测序比对文件;对Hi‑C互作矩阵标准化处理得到标准化矩阵;将Hi‑C互作矩阵划分为子矩阵窗口,对子矩阵窗口进行DETR过滤...
一种分析预测模型跨数据集的迁移能力的方法及相关设备
本申请实施例提供了一种分析预测模型跨数据集的迁移能力的方法及相关设备,用于使用降维算法可视化分析模型在不同的蛋白质热稳定性数据集间的迁移能力。本申请实施例方法包括:获取待分析热稳定性数据集;将目标热稳定性数据子集作为目标训练数据集,并确定目...
一种品种特异SNP位点筛选方法及其应用
本发明涉及一种品种特异SNP位点筛选方法及其应用,属于品种鉴定技术领域。本发明提供一种适用于多物种的品种特异SNP位点筛选方法及品种鉴定策略,结合特异SNP位点筛选和群体遗传结构模型分析,能够实现快速准确筛选品种特异性位点和品种鉴定,极大提...
一种针对三代全长转录本测序数据寻找新型可变剪接事件的方法
本发明涉及生物信息学领域的一种针对三代全长转录本测序数据寻找新型可变剪接事件的方法。本发明的检测待测样本三代全长转录本测序数据中新型可变剪接事件的方法,包含如下步骤:1)获得待测样本的三代全长转录本测序数据;2)将步骤1)所述的三代全长转录...
一种基于大数据的基因靶点筛选系统
本发明涉及数据分析技术领域,具体为一种基于大数据的基因靶点筛选系统,包括序列参数提取模块、表达峰值识别模块、定位区间匹配模块、靶点等级划分模块、筛选结构归集模块。本发明中,通过构建表达位点与索引的组合结构实现序列层级的精准表达信息提取,通过...
一种多组学基因组联合遗传评估方法及装置
本发明涉及生物信息技术领域,具体公开了一种多组学基因组联合遗传评估方法及装置。该方法通过构建多组学融合相似矩阵,将基因组、转录组、蛋白组、代谢组、微生物组及高通量表型等多源数据进行整合,并采用自适应二分法优化组学权重,引入网格搜索与交叉验证...
一种基于基因语言模型的同义突变有害性预测方法
本发明公开了一种基于基因语言模型的同义突变有害性预测方法,包括:(1) 数据获取与筛选:采用实验室已有的数据集,确保数据可靠性与任务针对性;(2) 特征注释:利用四种代表性基因语言模型GPN‑MSA、HyenaDNA、SpliceBERT、...
一种基于多种代谢模型的香紫苏醇生产菌株的优化方法及应用
本申请公开了一种基于多种代谢模型的香紫苏醇生产菌株的优化方法及应用。所述方法包括整合底盘菌株的表型数据与转录组数据构建整合模型,并基于代谢模型在基因组范围内预测内源改造靶点;所述宿主菌株选自酿酒酵母。本发明采用酶约束模型及非直观基因编辑靶点...
一种甘蔗杂交组合智能选配效果评价方法
本发明涉及甘蔗培育技术领域,尤其涉及一种甘蔗杂交组合智能选配效果评价方法,包括以下步骤:采集与甘蔗亲本及杂交后代相关的多源数据,所述多源数据包括表型数据、环境数据和遗传谱系数据;对所述多源数据进行格式统一与特征归一化处理,得到标准化数据集;...
三阴性乳腺癌新辅助化疗达到pCR的预测方法、装置、设备及介质
本申请公开了一种三阴性乳腺癌新辅助化疗达到pCR的预测方法、装置、设备及介质,涉及医学数据处理技术领域,该方法包括:获取待检测对象的临床病理特征和新辅助化疗前的外围血计数数据;外围血计数数据包括:中性粒细胞计数、淋巴细胞计数、血小板计数和单...
一种蛋白质热稳定性的预测方法及相关设备
本申请实施例提供了一种蛋白质热稳定性的预测方法及相关设备,用于准确预测蛋白质的热稳定性。本申请实施例方法包括:获取待预测蛋白质序列,将待预测蛋白质序列输入至预设的蛋白质热稳定性预测模型,得到对应于待预测蛋白质序列的蛋白质序列特征和氨基酸残基...
一种基于混合深度学习架构的嗜盐蛋白预测方法及系统
本发明提供一种基于混合深度学习架构的嗜盐蛋白预测方法及系统,涉及生信分析技术领域,该方法包括:获取待预测的蛋白质序列;利用蛋白质语言模型提取其全局语义嵌入特征;同时,基于特定的约化氨基酸字母表对序列重编码,并统计三种间隔模式下的约化二肽频率...
一种无创预测乳腺癌分子分型的方法及其应用
本发明涉及肿瘤分子诊断领域,涉及一种无创预测乳腺癌分子分型的方法及其应用。具体地,本发明以LTR重复序列区域的信号强度作为提取的cfDNA特征之一,提供了一种乳腺癌分子分型的无创预测模型的构建方法,并提供了该模型在乳腺癌分子分型的无创预测中...
一种潜在病原微生物检测方法及系统、电子设备和存储介质
本发明公开了一种潜在病原微生物检测方法及系统、电子设备和存储介质,其特点是检测方法包括 : 毒力因子谱生成步骤和致病性分级预测等步骤,得到非致病菌、机会致病菌和专性病原菌的三级分类预测结果;系统包括:毒力因子谱生成模块和致病性分级预测模块;...
蛋白质表达水平的预测方法、装置和设备
本发明提供一种蛋白质表达水平的预测方法、装置和设备,其不仅利用蛋白质语言模型提取蛋白序列的理化属性和结构折叠特征,深度挖掘蛋白质氨基酸的独特特点,通过综合分析序列信息,全面揭示蛋白质的内在特性,为后续的预测和应用提供了坚实的基础,而且混合网...
一种人类单倍群层级追踪与宏单倍群归一化的方法
本发明公开了一种人类单倍群层级追踪与宏单倍群归一化的方法,涉及群体遗传学与生物信息学软件方法领域;包括以下步骤:建立基于权威系统发育树的邻接表数据结构;构建同义词归一化字典,用于处理单倍群命名的异构性问题;实现层级路径回溯算法,基于深度优先...
基于多组学数据的家族性高胆固醇血症外泌体靶向递送系统
本发明公开了基于多组学数据的家族性高胆固醇血症外泌体靶向递送系统,涉及生物医学技术领域,该系统包括:多组学数据整合模块,收集处理患者及公共数据库数据构建多组学数据集;靶向配体筛选模块提取特征、筛选验证高效靶向配体;外泌体制备模块培养细胞、分...
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