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一种基于深度学习的多组学细胞类型注释方法、设备及程序产品
本申请涉及智能医疗领域,具体涉及一种基于深度学习的多组学细胞类型注释方法、设备及程序产品。包括获取scRNA‑seq、scATAC‑seq数据;对scRNA‑seq数据进行预处理得到基因表达矩阵;将所述基因表达矩阵输至第一细胞类型分类模型得...
一种鉴定目标基因组区域大片段序列插入的方法及其应用
本发明公开了一种鉴定目标基因组区域大片段序列插入的方法及其应用,属于生物信息学技术领域。针对临床宏基因组测序中因测序读长短、覆盖度不足等因素难以准确识别大片段插入变异的问题,本发明提出通过人工构建可代表插入变异的参比序列,并结合基于短rea...
基于机器学习的临床高危精神病转归外周血RNA标志物筛选方法、装置、处理器及其介质
本发明涉及一种基于机器学习实现临床高危精神病转归外周血RNA标志物筛选的方法,包括以下步骤:进行数据收集,获取CHRP患者的血液RNA测序信息;进行数据预处理;对全标志物进行拟合,并对特征重要性进行打分并排序;筛选最优标志物;使用筛选后的标...
一种基于注意力网络的单细胞类型自动标注方法及系统
本发明公开了一种基于注意力网络的单细胞类型自动标注方法及系统,获取原始单细胞转录组数据并进行预处理,得到高变异基因数据;对得到的高变异基因数据进行低维特征映射和基因层对比学习,并基于注意力机制筛选关键基因特征;将得到的关键基因特征进行生物学...
一种基于多组学数据Memory引导的对比学习癌症亚型分型方法及系统
本发明提供一种基于多组学数据Memory引导的对比学习癌症亚型分型方法及系统,涉及生物信息的技术领域。首先基于多组学数据,构建高维遗传特征矩阵,通过预设的非线性多层编码器提取源特征向量。将源特征向量聚类为K个簇,并分配伪标签,得标记实例。构...
基于机器学习的湖库优势藻群落结构预测方法、系统及存储介质
本发明公开了一种基于机器学习的湖库优势藻群落结构预测方法、系统及存储介质,涉及水环境监测与生态预测技术领域。包括以下步骤:获取多源异构时空数据并融合,所述多源异构时空数据为目标水域的历史时序数据;将融合后的多源异构时空数据生成特征向量;构建...
一种多重微球荧光编码优化方法、介质及系统
本发明提供了一种多重微球荧光编码优化方法、介质及系统,属于多重微球荧光编码技术领域,包括:首先实时采集荧光染料的多维光谱数据,包括激发光谱、发射光谱、荧光强度、光谱重叠率、染料浓度和背景荧光等参数。通过多元混合分解计算分别得到激发光谱、发射...
一种基于主成分分析的抑制蛋白质糖基化及其诱导构象变化与聚集的活性物质综合评价方法
本发明公开了一种基于主成分分析(PCA)的综合评价方法,旨在系统评估候选活性物质对蛋白质非酶促糖基化及其诱导的构象变化与聚集的抑制作用。该方法首先建立蛋白质‑二羰基化合物的体外非酶促糖基化模型,在活性物质作用下,检测晚期糖基化终末产物(Ad...
一种基于微调DNABERT模型和卷积神经网络的益生菌筛选方法
本发明提供一种基于微调DNABERT模型和卷积神经网络的益生菌筛选方法,包括:获取参考基因组序列和目标序列样本;对参考基因组序列和目标序列样本进行预处理;对预处理后的参考基因序列进行分割,并输入到DNABERT模型中进行微调训练;对预处理后...
基因、细胞和药物在人类肿瘤中的生存相互作用分析系统
本发明公开了基因、细胞和药物在人类肿瘤中的生存相互作用分析系统,涉及生物信息学领域,用于解决使用单一工具会导致数据单一性增强,从而产生筛选和调整误差的问题,监控并采集样本测序质量信息以及样本特定问题出现次数,并建立数据分析模型,得到完整评估...
一种体外受精胚胎培养囊胚形成率预测方法及系统
本说明书实施例公开了一种体外受精胚胎培养囊胚形成率预测方法及系统,包括:获取待评价的体外受精胚胎的参数信息;将所述参数信息作为输入,输入至预训练的预测模型,获得所述待评价的体外受精胚胎的形成率预测结果,所述预训练的预测模型是基于LightG...
宫颈癌神经侵犯状态的预测方法、装置、设备及存储介质
本发明公开了一种宫颈癌神经侵犯状态的预测方法、装置、设备及存储介质,涉及人工智能技术领域。该方法包括:分别获取目标患者的癌组织样本,以及血液样本;对各癌组织样本,以及血液样本进行测序分析,得到变异数据及表达谱数据;基于变异数据以及表达谱数据...
靶点确定方法、电子设备、存储介质及程序产品
本申请实施例提供一种靶点确定方法、电子设备、存储介质及程序产品。该方法包括:接收未知生物分子的生物分子信息;对生物分子信息进行上下文解析处理,得到多个有效文本段,文本段为支撑未知生物分子的靶点确定的关键相关性信息;通过重排序模块,对多个有效...
一种基于人工智能的空间转录组数据分析方法
本发明公开了一种基于人工智能的空间转录组数据分析方法,属于空间转录组学数据分析技术领域,首先对原始基因表达数据进行自适应归一化及高变基因筛选预处理;随后构建整合空间邻近性与转录相似性的层级化图谱,通过动态半径剪枝与邻域继承策略确保图谱连通性...
一种应用于真菌检测的方法、系统、设备及介质
本申请提供了一种应用于真菌检测的方法、系统、设备及介质,其中,所述方法包括:对获取到的待检测样本进行多维度数据识别,得到初步识别结果,其中,初步识别结果包括形态特征数据、分子标记序列和时空信息;基于形态特征数据和分子标记序列进行交叉验证,得...
一款糖组快速精准定量系统
本发明涉及糖组定量分析技术领域,具体涉及一款糖组快速精准定量系统。该系统所执行的方法包括:获取质谱数据,基于所述质谱数据提取质谱信息;获取糖链鉴定信息,所述糖链鉴定信息包括糖链编码、分子式和保留时间;基于糖链分子式获得多电荷态和加合物形式的...
一种基于混合深度学习模型的RNA二级结构预测方法
本发明公开了一种基于混合深度学习模型的RNA二级结构预测方法,属于生物信息学与人工智能交叉领域。本发明包括:获取待预测的RNA序列数据集并转换为序列特征向量,输入双分支深度神经网络模型,所述模型包括主分支网络和侧分支网络,实现对RNA序列信...
基于测序读段的CpG甲基化单细胞全基因组分析方法和相关设备
本申请公开了一种基于测序读段的CpG甲基化单细胞全基因组分析方法和和相关设备,方法包括:获取待分析单细胞数据,对待分析单细胞进行甲基化数据测序读段比对,得到甲基化位点统计结果;基于随机抽样策略和测序读段的甲基化汉明距离筛选甲基化特异区间;根...
一种食用植物油原料真菌数据库的构建方法
本发明涉及微生物分析技术领域,并具体公开了一种食用植物油原料真菌数据库的构建方法,其方法包括:采集多种食用植物油的食用植物油原料数据,确定每种食用植物油的多个原料外观结构聚类集合,以及每个原料外观结构聚类集合的真菌分离方法;确定每种食用植物...
基于机器学习的噬菌体内溶素预测方法、系统、存储介质及电子设备
本发明公开了一种基于机器学习的噬菌体内溶素预测方法、系统、存储介质及电子设备,属于生物信息学技术领域。方法包括:获取噬菌体蛋白序列并进行预处理;采用氨基酸熵、氨基酸指数、二元位置编码、组成‑转换‑分布、二肽组成及基因三联体组成六种方法组合提...
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