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基于分子分型的广泛期SCLC生物标记物探索方法
本发明涉及肿瘤分子分型及生物标记物技术领域,公开了基于分子分型的广泛期SCLC生物标记物探索方法,包括以下步骤:通过对患者肿瘤组织进行分子分型检测,并采集外周血样本;对所述外周血样本进行高通量免疫图谱数据获取;对所述免疫图谱高维数据进行生物...
一种药物-靶点相互作用预测方法及系统
本发明公开了一种药物‑靶点相互作用预测方法及系统,属于生物信息技术领域。本发明方法首先获取药物的分子结构数据与靶点的序列及结构数据;随后,分别提取药物的分子图结构特征与SMILES序列特征,以及靶点的氨基酸序列特征与三维空间结构特征;进而,...
一种基于演化算法的遗传育种策略优化方法
本发明公开了一种基于演化算法的遗传育种策略优化方法,包括:S1、采集并输出育种多源数据集,获取亲本群体的基因型与表型数据;S2、构建遗传育种的数学模型,设计染色体编码方案;S3、初始化初始种群,采用改进的DeepFM模型输出育种策略的适应度...
生物标志物筛选方法、系统、电子设备及介质
本发明提供了一种生物标志物筛选方法、系统、电子设备及介质,包括:对多模态生物样本数据进行初步筛选得到初筛数据,并对初筛数据进行预处理;基于预处理后的初筛数据训练多个机器学习模型,并从多个机器学习模型中选取最佳模型作为生物标志物筛选模型;基于...
一种基于双向Mamba架构的mRNA密码子序列语言建模方法
本发明涉及一种基于双向Mamba架构的mRNA密码子序列语言建模方法,包括:获取mRNA编码序列,将mRNA编码序列进行序列令牌化,并采用词表查询,得到嵌入特征;将嵌入特征依次输入双向Mamba模型的卷积特征提取模块和状态空间模块,生成协同...
面向多阶段细胞培养的自适应机理融合活细胞密度预测方法
本发明公开了一种面向多阶段细胞培养的自适应机理融合活细胞密度预测方法,具体为:获取样品细胞在多阶段培养过程中的过程变量序列,输入时序特征提取网络得到状态向量,再经三个多层感知机分支网络得到机理参数向量、门控权重、数据分支预测值,将机理参数向...
一种基于MALDI-MS的糖链解析系统
本发明涉及糖链解析技术领域,具体涉及一种基于MALDI‑MS的糖链解析系统。该系统执行的方法包括:获取糖链样本的质谱数据,并获得质谱检测信息;基于糖链数据库中糖链分子式结合加合离子计算理论质荷比与丰度分布为糖链母离子理论质谱数据特征;将理论...
一种基于近红外光谱和多模型融合的透明质酸发酵过程在线监测方法
本发明涉及生物制造领域,尤其是提供了一种基于近红外光谱和多模型融合的透明质酸发酵过程在线监测方法。该方法包括构建透明质酸发酵过程的近红外光谱在线采集系统;收集不同批次下不同发酵时间点的样本并进行分子量的测定;按照一定比例划分训练集和测试集;...
AAV血清型的筛选方法及装置
本发明公开了一种AAV血清型的筛选方法及装置,包括:构建训练数据集;基于训练数据集对多个初始筛选模型进行训练,得到多个目标筛选模型,其中,每个目标筛选模型对应一种性状;确定待筛选序列,并将待筛选序列分别输入各目标筛选模型,得到待筛选序列对于...
一种多维度肿瘤标志物联合检测装置及其使用方法
本发明涉及生物医学检测技术领域,具体涉及一种多维度肿瘤标志物联合检测装置及其使用方法,装置包括样本处理、测序、标志物提取、特征融合与检测和结果输出模块,其中标志物提取模块含六个检测单元,分别对应染色体拷贝变异、微卫星不稳定性等6类标志物的提...
一种基于最大精确匹配的多序列并行比对方法
本发明公开了一种基于最大精确匹配的多序列并行比对方法,涉及生物信息学与计算生物学交叉技术领域。该方法包括:将多个序列的字符串进行拼接,得到长序列,采用分桶策略和诱导排序结合的方式,确定长序列的后缀数组和最长公共前缀数组;根据后缀数组,从最长...
基于单细胞多组学预测非编码突变功能的方法、设备和介质
本申请公开了一种基于单细胞多组学预测非编码突变功能的方法、设备和介质,属于单细胞多组学技术领域。本申请提供了一种统一的深度学习框架,能够直接从DNA序列出发,在单细胞分辨率下联合预测染色质可及性与基因表达水平。本申请提出了调控效应得分和表达...
一种基于大语言模型的功能性蛋白筛选方法
本发明公开了一种基于大语言模型的功能性蛋白筛选方法,属于蛋白筛选技术领域,具体包括:获取蛋白质三维结构与功能文献,利用编码器将其转换为多模态特征向量并构建领域专用向量数据库;在接收筛选指令后,通过向量检索算法调取语义匹配的关联特征数据;随后...
高发疾病基因分析与预测方法、系统及存储介质
本发明提供了一种高发疾病基因分析与预测方法、系统及存储介质,所述方法通过多维度数据融合提供全面数据基础,多层级特征挖掘精准捕捉疾病关联特征,因果不变性驱动的集成预测模型提升预测精准度,双重验证保障泛化能力,既增强了预测可靠性,又具备强生物学...
基于全基因组选择的水稻耐极端低温分子标记及其育种应用
本发明涉及水稻耐极端低温育种,通过整合北京深冷水池与云南自然低温环境下816份MCC核心种质的结实率数据,结合基因组选择模型筛选出6份耐极端低温种质及2486个候选SNP标记。进一步利用东北地区664份现代品种的基因型与低温表型验证,经随机...
一种苜蓿产量性状最优预测体系及其构建方法和应用
本发明公开了一种苜蓿产量性状最优预测体系及其构建方法和应用。本发明基于全基因组关联分析,鉴定与苜蓿产量性状显著相关的SNP位点,在此基础上,针对不同统计模型和不同数量SNP标记对全基因组选择预测精度的影响进行了比较,并建立了一种基于机器学习...
一种三阴性乳腺癌免疫治疗耐药人群的筛选方法
本发明涉及生物医学检测技术领域,具体为一种三阴性乳腺癌免疫治疗耐药人群的筛选方法,获取三阴性乳腺癌患者基因表达数据运算生成免疫基质评分对比数据集,处理单细胞样本mRNA序列数据聚类注释细胞并筛选耐药关联亚群,提取特定亚群基因建立耐药特征基因...
外显子拷贝数变异检测方法、装置和设备
本发明提供一种外显子拷贝数变异检测方法、装置和设备,涉及高通量测序技术领域,该方法包括:将待检测样本在各个靶标区间的特征信息输入目标混合专家模型,输出待检测样本在各个靶标区间的拷贝数变异的可靠性评分;根据各个靶标区间的拷贝数变异的可靠性评分...
基于锌稳态相关基因标志物组及其应用
本发明涉及生物诊断技术领域,尤其涉及基于锌稳态相关基因标志物组及其应用。基于锌稳态相关基因标志物组,包括如下基因中的任意一种或至少两种的组合:CCDC74B、ELOVL2、FAM234B、FUT3、KCNJ11、NXPH4、RIBC1、UP...
一种基于机器学习伪靶向筛查识别环境中PFAS的方法
本发明提供了一种基于机器学习伪靶向筛查识别环境中PFAS的方法,包括:从预设质谱数据库中调取包含PFAS化合物的质谱数据,并对质谱数据进行干扰峰剔除处理,得到模型训练数据集;基于特征提取标准从模型训练数据集中提取用于模型训练的特征数据集;基...
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