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一种利用血清蛋白质组数据开发评估肺癌检测诊断方法
本发明公开了一种利用血清蛋白质组数据开发评估肺癌检测诊断方法,涉及计算模型领域,该利用血清蛋白质组数据开发评估肺癌检测诊断方法包括以下步骤:步骤S1,整合GEO数据库的蛋白组学样本和TCGA数据库的肺癌组织样本,构建数据集,其中GEO数据库...
识别肿瘤生物标志物的方法、系统、设备及介质
本发明公开了一种识别肿瘤生物标志物的方法、系统、设备及介质。该方法包括:检索和分析TCGA数据库,获取目标肿瘤样本和健康人样本的circRNA数据集;将在目标肿瘤样本中表达但不在健康样本中表达的所有circRNA标记为第一类,将在目标肿瘤样...
一种结构学习与谱图递推算法的代谢组学数据注释方法
本发明公开了一种结构学习与谱图递推算法的代谢组学数据注释方法,属于代谢组学数据分析领域。所述方法针对现有组学数据分析瓶颈,开发了一种结合代谢反应规律建模、组学数据联合处理与代谢网络智能注释的方法,通过引入结构特征学习模型与谱图递推算法,融合...
一种未知病原微生物的鉴定分析方法
本发明公开了一种未知病原微生物的鉴定分析方法,包括以下步骤:过滤掉低完整度、污染、标签错误的基因组序列,建立高质量的病毒鉴定数据库;通过机器学习算法,构建病毒宿主预测模型;对未知病原微生物进行鉴定分析,鉴定未知微生物的潜在宿主或致病性,进一...
一种病毒宏基因组测序数据的分析方法及系统
本发明提供一种病毒宏基因组测序数据的分析方法及系统,涉及生物信息领域,所述方法包括:对原始测序数据进行质量过滤,得到过滤后的数据;根据过滤后的数据,通过De Bruijn图和重叠布局对序列进行组装,构建病毒宏基因组草图;将病毒宏基因组草图与...
一种基于MoE的单细胞测序数据预训练模型构建方法
本申请提供了一种基于MoE的单细胞测序数据预训练模型构建方法,包括:利用表达值分箱机制将基因表达矩阵中的连续表达值离散化为具有排序意义的整数值标记,得到每个细胞分箱后的基因表达值序列;获取每个细胞的基因标记序列、条件标记序列,并构建出每个细...
体外培养细胞炎症水平的定量评估系统及评估方法
本发明公开了一种体外培养细胞炎症水平的定量评估系统和评估方法,所述系统采用模块化设计,由数据收集与预处理模块、特征基因选择模块、神经网络建模模块和炎症指数计算模块;所述评估方法包括数据准备、原始数据处理、特征基因筛选、机器学习模型筛选、神经...
一种绘制脓毒症免疫细胞动态变化图谱的方法及应用
本发明提供了一种绘制脓毒症免疫细胞动态变化图谱的方法及应用,属于脓毒症治疗技术领域。本发明在scRNA‑seq技术的基础上,进行免疫文库构建,采用scVDJ‑seq测序技术对免疫微环境进行更加全面的分析,能够精准监测单个细胞的克隆来源,重建...
鸡饲料利用率性状分子检测试剂盒配套数据管理系统
本发明公开了鸡饲料利用率性状分子检测试剂盒配套数据管理系统,具体涉及家禽遗传检测领域,用于解决饲料利用率分型结果偏差问题,是通过在加样瞬间冻结全板光温栅格并递推热光场校准模板,空间漂移与时间漂移在信号源头同步剥离;实时校正后生成的曲线又经机...
用于听力损失有关变异分类和预测的方法和设备
本发明涉及一种用于关联基因突变点与特定生理特征的方法。该方法包括:从人类基因数据库接收经过测序的测试基因序列;采用具有窗口长度的滑动窗口从测试基因序列中取出基因长度等于窗口长度的测试序列片段;使用预测模型,分析测试序列片段;基于分析,判断测...
一种mRNA靶点敏感性预测模型构建方法及预测方法
本发明涉及深度学习技术领域,公开了一种mRNA靶点敏感性预测模型构建方法及预测方法,该方法包括:获取mRNA样本数据集;基于三维结构数据,构建待训练mRNA的分子图;对分子图中的每个原子进行等变几何特征初始化,获得初始等变几何特征;采用等变...
一种基于二代单细胞转录组的内含子剪接效率分析方法
本发明提供了一种基于二代单细胞转录组的内含子剪接效率分析方法,包括鉴定不同样本中每个内含子的内含子剪接效率,将所有内含子剪接效率整合为剪接效率矩阵。从所有内含子中筛选出高变异内含子,结合剪接效率矩阵与基因表达矩阵对细胞亚群重新聚类,得到多个...
基于药物反应预测器的空间转录组细胞反应确定方法及装置
本申请公开了一种基于药物反应预测器的空间转录组细胞反应确定方法及装置,涉及生物信息技术领域,主要目的在于解决现有空间转录组细胞药物反应确定精准差的问题。包括:获取细胞组织的单细胞基因表达矩阵以及空间转录组学基因表达矩阵;基于所述单细胞基因表...
AISNP标记组合与多维度祖源和地理推断模型
本发明提供AISNP标记组合与多维度祖源和地理推断模型,涉及法医学技术领域。本发明首先筛选了七组东亚及东南亚人群的祖源推断SNP位点(Ancestry Informative SNPs, AISNPs),基于主成分分析、ADMIXTURE和...
一种基于多模态深度学习的蛋白质翻译后修饰预测方法
本发明属于生物信息学领域,涉及一种基于多模态深度学习的蛋白质翻译后修饰预测方法。首先,通过输入蛋白质序列与三维结构数据进行多模态特征提取,得到序列特征向量与结构特征向量;其次,采用交叉模态注意力机制与自适应门控网络进行特征融合;然后,将融合...
一种用于生物工程的致病基因变异位点精准识别方法
本发明公开了一种用于生物工程的致病基因变异位点精准识别方法,涉及基因诊断技术领域,包括:得到取样基因的取样序列,得到样本基因的样本序列;确定取样片段的长度和相邻取样片段的间距;将取样片段分类为取样变异片段和取样未变异片段;从样本基因中筛选出...
外显子拷贝数确定方法、装置、设备及存储介质
本申请提供了外显子拷贝数确定方法、装置、设备及存储介质。前述方法包括:获取待测样本和参照样本的测序比对数据;基于所述待测样本的测序比对数据,确定所述待测样本预定外显子平均测序深度和基因组平均测序深度的比值,获得第一比率值;基于所述参照样本的...
一种自动处理宏基因组高通量测序数据分箱得到病毒基因组的分析方法、分析系统及应用
本发明公开了一种自动处理宏基因组高通量测序数据分箱得到病毒基因组的分析方法,包括如下步骤:获取二代测序原始数据,进行数据质控,获得待分析Reads;获得由多个Reads通过片段的重叠组装成重叠群,对重叠群进行统计并绘制长度分布图;基于重叠群...
一种揭示药物靶点隐藏结合口袋的分析方法及系统
本申请属于医药技术分析领域,公开了一种揭示药物靶点隐藏结合口袋的分析方法及系统,该方法包括:首先通过常规分子动力学模拟和聚类分析获得靶点蛋白的代表性构象亚稳态;其次构建马尔科夫状态模型以分析构象间的动力学转变规律;然后采用元动力学进行增强采...
基于AI预测的工程菌基因编辑靶点优先级排序系统
本发明公开了基于AI预测的工程菌基因编辑靶点优先级排序系统,涉及工程菌基因编辑技术领域。本发明显著提升工程菌基因编辑靶点优先级排序的效率与准确性,通过AI预测引擎整合多维生物信息数据,精准预测编辑效率、脱靶风险及功能扰动程度,输出概率置信区...
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