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基于机器学习的香水椰子香气物质2AP全基因组选择育种方法
本发明属于椰子育种领域,具体涉及基于机器学习的香水椰子香气物质2AP全基因组选择育种方法。本发明提出了一种基于全基因组变异位点和机器学习算法的香水椰子2AP含量预测方法,并最终筛选出了21个分子标记位点作为关键特征构建2AP含量预测模型,用...
脑区-基因网络基于生成对抗网络的演化方法及系统
本发明涉及人工智能技术领域,公开一种脑区‑基因网络基于生成对抗网络的演化方法及系统,为研究、预测和预防疑难杂症提供新的技术指引。方法包括:获取各样本演化前后所分别对应的第一和第二脑区‑基因网络;将演化前的第一脑区‑基因网络的邻接矩阵和单纯形...
一种联合解卷积域识别与对齐的方法、系统、终端及介质
本申请涉及数据处理技术领域,公开了一种联合解卷积域识别与对齐的方法、系统、终端及介质,所述联合解卷积域识别与对齐的方法包括:获取多切片基因转录组数据和参考数据;根据所述多切片基因转录组数据,得到变分分布;根据所述多切片基因转录组数据进和所述...
基于多任务深度学习的蛋白突变耐药性预测方法及系统
本发明提供了一种基于多任务深度学习的蛋白突变耐药性预测方法及系统,包括从CIViC/PharmGKB库获证据条目,预处理后补致病性标签建双标签语料;蛋白用突变位点邻域局部一位编码和进化比对位点特异打分矩阵PSSM双路径表征,并标准化长度,药...
一种花生数量性状基因快速挖掘的方法
本发明公开一种花生数量性状基因快速挖掘的方法。基于育种不完整群体构建巢式关联作图群体,结合分离群体分组分析法定位到一个显著影响花生籽仁大小的位点,开发出连锁的竞争性等位基因特异性PCR(KASP)功能性分子标记,进一步缩小区间,通过基因序列...
一种基于高通量单端测序的基因融合检测方法
本发明公开了一种基于高通量单端测序的基因融合检测方法,步骤包括:将测序数据比对到参考基因组上;提取含有5bp以上软剪切片段的读段序列,比对到融合基因的第一基因上;再次提取片段长度在5bp以上的软剪切片段的读段序列,比对到融合基因的第二基因上...
一种多源异构数据融合的奶山羊母畜智能选育方法
本发明提供了一种多源异构数据融合的奶山羊母畜智能选育方法,该方法包括:采集奶山羊母畜的体型性状、谱系信息、基因组分子标记数据和养殖环境参数,构建奶山羊母畜育种多源异构数据库;根据该数据库对奶山羊母畜进行育种分析,得到估计育种值;构建奶山羊母...
一种面向跨平台异构性数据的动态分位数标准化方法及系统、及其应用
发明属于生物信息学和计算生物学技术领域,具体是一种面向跨平台异构性数据的动态分位数标准化方法、系统及其应用。通过基因表达评分算法,本方法能够有效整合不同平台、批次、格式的RNA表达数据。以及对基因表达值进行排序和评分处理,消除不同数据集间的...
基于深度学习的引导编辑效率预测方法及系统
本发明涉及核酸序列分析技术领域,尤其涉及基于深度学习的引导编辑效率预测方法及系统。本发明通过获取引导编辑过程中的多条关键核酸序列,构建多序列对齐矩阵作为输入;利用词嵌入与旋转位置编码技术生成融合序列特征与位置信息的潜矩阵;通过轴向注意力编码...
一种NIPT参照样本集的构建方法及其应用
本发明属于产前无创诊断领域,公开了一种NIPT参照样本集的构建方法及其应用。通过计算得到染色体唯一比对序列百分比,统计得到原始样本集S1,针对染色体j,对样本集S1的二维数据集进行线性回归分析,计算得到拟合数据及偏差值);根据偏差值中位数和...
一种基于加权syncmer的泛基因组长读长比对方法
本发明涉及基因序列比对技术领域,具体为一种基于加权syncmer的泛基因组长读长比对方法;本发明方法首先基于分频降权的加权syncmer采样对参考泛基因组图的segment进行处理,过滤高频冗余k‑mer、保留高特异性k‑mer,再构建哈希...
一种基于机器学习的单细胞密度预测方法
本发明公开了一种基于机器学习的单细胞密度预测方法,涉及机器学习和细胞量化分析技术领域,该方法的实施包括:通过光诱导介电技术产生的介电泳力控制细胞在微流控的环境中运动;收集待测细胞在沉降过程中的运动状态变化数据;对数据进行数据清洗和归一化;提...
基于删失深度学习的水源水总大肠菌群快速测算方法
本发明公开了基于删失深度学习的水源水总大肠菌群快速测算方法,包括以下步骤:S1、收集水源地长时序水质日检数据及对应时序的水源地所在区县逐日气象数据,并对水质日检数据和气象数据进行预处理;S2、合成涵盖水质指标和气象指标的综合数据集,并对综合...
一种基于上下文融合的KAN驱动型抗菌肽溶血活性预测方法
本发明公开了一种融合ESM2、胶囊网络、Transformer Encoder与Kolmogorov‑Arnold Network(KAN)的抗菌肽溶血活性预测模型。ESM2生成氨基酸级语义嵌入,胶囊网络提取局部关键残基,Transform...
一种联合推断动态细胞通讯和细胞状态转变速率的方法
本发明提供一种联合推断动态细胞通讯和细胞状态转变速率的方法。涉及生物信息技术领域。该方法包括:从待处理空间转录组数据中提取候选配体、候选受体和特征基因;基于从预构建的先验数据库中筛选出与候选配体、候选受体和特征基因存在相互作用关系的节点,构...
一种基于最小特征等位基因组合的鳙鱼地理群体溯源方法
本发明公开了一种基于最小特征等位基因组合的鳙鱼地理群体溯源方法,属于水产食品溯源和种群遗传学技术领域。该方法首先构建已知地理来源鳙鱼群体的微卫星初始数据库;然后通过一种结合等位基因频率过滤、Fst值筛选和以特定F值阈值(进入3.84,删除2...
融合改进TabPFN和SHAP的多聚腺苷酸化信号突变预测方法
本发明公开了一种融合改进TabPFN网络和SHAP可解释性的多聚腺苷酸化信号突变有害性预测方法,包括:1、收集人类多聚腺苷酸化信号突变样本并进行预处理;2、使用计算生物学工具对突变样本进行特征注释;3、使用特征选择框架对特征进行选择;4、构...
一种用于辅助诊断小细胞肺癌的生物标志物的筛选方法
本发明公开了一种用于辅助诊断小细胞肺癌的生物标志物的筛选方法,涉及生物医学技术领域。该方法获取多组样本;多组样本包括多名SCLC患者和多名健康对照者的外泌体RNA转录组测序数据;每个外泌体RNA转录组测序数据包括多个RNA特征;对所有外泌体...
一种基于多组学的慢性肾病糖酵解-免疫调节分析方法
本发明公开一种基于多组学的慢性肾病糖酵解‑免疫调节分析方法,包括:获取GSE209781单细胞及GSE37171转录组数据,经预处理、细胞聚类注释后,分析糖酵解通路活性及差异基因;通过共识聚类、免疫浸润评估明确分子亚型;结合三种机器学习筛选...
一组与儿童急性淋巴细胞白血病预后相关的生物标志物及其应用
本发明涉及临床分子诊断与个体化肿瘤医学技术领域,特别是涉及一组与儿童急性淋巴细胞白血病预后相关的生物标志物及其应用。本发明旨在提供一种基于ApopScore生物标志物以及预后风险评估模型,量化儿童B‑ALL患者的抗凋亡活性,用于预测复发风险...
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