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一种用于UMI和Poly-A尾分析的文库构建方法及其应用
本发明涉及一种用于UMI和Poly‑A尾分析的文库构建方法及其应用。本发明设计新型的文库构建流程,搭建了UMI+Poly‑A尾的串连文库流程,可以完整得到Poly‑A尾的全部序列,可用于同时对UMI和Poly‑A尾测序分析,可以对原始转录本...
长读长测序基因组组装质量评估方法及系统
本发明涉及基因检测技术领域,具体为长读长测序基因组组装质量评估方法及系统,包括以下步骤:通过采集片段末端与相邻片段首端碱基计算匹配率标记断裂区域,统计突变密集度分析分布差异生成轨迹异常,向量化延伸方向进行主成分分析得到方向趋势,构建趋势曲线...
一种质谱组学模型的训练与分析方法、存储介质及设备
本发明实施例提供一种质谱组学模型的训练与分析方法、存储介质及设备,属于质谱组学技术领域。所述方法包括:获取质谱组学数据,并进行统一封装;基于选取的至少一种预处理方法,对所述质谱组学数据进行预处理;基于选取的至少一种特征选择方法,对预处理后的...
一种融合蛋白质伪三维结构的多模态特性预测方法
本发明涉及人工智能和生物信息学交叉技术领域,尤其涉及一种融合蛋白质伪三维结构的多模态特性预测方法。其主要针对现有处理方法对三维结构特征的利用不足的问题,提出如下技术方案包括以下步骤:步骤一、数据收集与筛选;步骤二:多模态原始特征提取;步骤三...
一种评价药物对糖尿病视网膜纤维化疾病治疗效果的方法、系统及设备
本发明公开了一种评价药物对糖尿病视网膜纤维化疾病治疗效果的方法、系统及设备。发明人首次发现EGFR激酶抑制剂或ROCK抑制剂通过调节YAP或CCN2的表达发挥治疗糖尿病视网膜纤维化疾病的作用;YAP抑制剂通过调节CCN2的表达表达发挥治疗糖...
一种基于大数据分析的杀鲑气单胞菌毒力预测方法
本发明公开了一种基于大数据分析的杀鲑气单胞菌毒力预测方法,该方法包括:通过从多个渠道搜集、整理并构建杀鲑气单胞菌数据库;对杀鲑气单胞菌数据进行清洗、基因组组装与注释,形成完整的注释数据集;通过生物信息学分析,构建杀鲑气单胞菌比较基因组学框架...
一种基于植物累积代谢特征的PBT新污染物危害筛查方法
本发明涉及环境科学和新污染物评估技术领域,公开了一种基于植物累积代谢特征的PBT新污染物危害筛查方法,包括获取新污染物的持久性特征、生物累积性特征及毒性特征;基于持久性特征、生物累积性特征及毒性特征,确定新污染物的初始综合危害评分,并利用动...
一种基于CITE-seq技术的单细胞多组学数据联合聚类方法
本发明提出一种基于CITE‑seq技术的单细胞多组学数据联合聚类方法,属于生物信息学技术领域,本发明为解决多组学中联合聚类稳定性差以及跨组学信息不能实现协同整合的问题,包括:S1:获取CITE‑seq多组学数据集;S2:对CITE‑seq多...
同时推断单细胞伪时间、速度场和基因相互作用的方法
一种同时推断单细胞伪时间、速度场和基因相互作用的方法,通过预处理具有多个分支的细胞发育的单细胞RNA测序数据集,对不同细胞类型聚类并构造分段线性模型,采用期望最大化算法优化分段线性模型,得到每个细胞的推断伪时间、动态网络的基因相互作用矩阵以...
一种评价肠道缺氧状态的方法、系统、设备、介质、程序产品
本发明公开了一种评价肠道缺氧状态的方法、系统、设备、介质、程序产品。本发明通过单细胞转录组测序首次发现了能够表征肠道缺氧状态的2个特异性杯状细胞亚群,包括由Sytl2基因、Sytl3基因、Sytl5基因、Rab27a基因、Rab27b基因、...
一种基于近红外光谱的小麦蛋白质定量预测方法及系统
本发明提供一种基于近红外光谱的小麦蛋白质定量预测方法及系统,涉及小麦检测技术领域,该方法包括:获取小麦近红外光谱数据并进行预处理;利用双向门控循环单元提取时序特征;通过投影层进行维度映射;将投影特征输入至基于高斯径向基函数改进的KAN模型进...
一种生物医学知识发现方法和系统
本发明提供了一种生物医学知识发现方法和系统,通过多种可解释人工智能方法并采用波达计数融合法,对生物医学三元组进行排序,获得生物医学三元组候选集,再采用基于大语言模型多智能体的生物医学假设生成系统基于生物医学三元组候选集生成生物医学候选假设,...
基于血浆rDNA序列的甲基化信号癌症检测与溯源方法
本发明公开了基于血浆rDNA序列的甲基化信号癌症检测与溯源方法,属于生物信息学和癌症诊断技术领域。本方法通过两次映射提取血浆中的rDNA序列,获取CpG甲基化信息和丰度信息作为输入,采用两层机器学习模型,模拟甲基化信号与癌症类型之间的关联关...
食用菌生长状态智能监测与生长预测方法及系统
本发明公开了食用菌生长状态智能监测与生长预测方法及系统,属于食用菌生长监测技术领域,包括:采集食用菌的多维数据,进行实景质量筛选,生成区域时序数据,并进行菌种代谢解析,计算代谢指标值,构建代谢判定基准,结合单个分子的异常情况,判定生理预测状...
一种基于自注意力模型编码器的蛋白质组质谱数据质量评估方法
本发明提供了一种基于机器学习自注意力模型编码器的蛋白质组串联质谱质量评估方法,用于评估蛋白质组质谱实验数据的质量。该方法能够识别由于数据分析原因而未被鉴定的高质量质谱(如搜索参数未优化、未指定的翻译后修饰和不完整的序列数据库),也可以用来评...
一种铁离子代谢异常的神经损伤预警方法及系统
本发明属于生物医学检测技术领域,具体公开提供的一种铁离子代谢异常的神经损伤预警方法及系统,本发明通过同步获取铁离子稳态的实时动态数据和铁蛋白自噬活性的多维度生物标志物数据,构建了一个全面反映铁代谢状态的数据基础;通过铁代谢异常耦合解析模型深...
一种基于糖脂代谢极化的肝癌分型方法
本发明适用于生物医学技术领域,提供了一种基于糖脂代谢极化的肝癌分型方法,包括以下步骤:获取肝癌患者的转录组数据;基于KEGG代谢通路计算单样本基因集富集分析评分;对代谢通路富集评分进行无监督共识聚类分析;根据聚类结果将肝癌分为聚糖代谢‑HC...
基于无监督噪声对比学习的DNA语言模型优化方法及系统
本发明公开了基于无监督噪声对比学习的DNA语言模型优化方法及系统,涉及利用DNA条形码进行物种鉴定技术领域;将来自同一序列的嵌入向量作为正样本,不同序列的嵌入向量作为负样本;为了增加样本多样性,引入全局和局部特征噪声层,对正样本嵌入向量进行...
一种基于Trans-SAE的药物和通路关联预测方法
本发明公开了一种基于Trans‑SAE的药物和通路关联预测方法,首先利用所有的药物‑通路样本对堆叠自编码器进行无监督预训练获得SAE模块的初始参数,然后利用Trans Block模块编码药物的SMILES序列特征向量,最后拼接SAE的深层相...
一种河蟹亲本选育数据管理系统及方法
本申请公开了一种河蟹亲本选育数据管理系统及方法,涉及数据库与育种信息技术领域。该方法主要包括:响应于新增个体,按照预设位运算规则生成包含世代、批次、家系及序列号的时空调配位点编码;将该编码作为数据库主键与个体基础信息关联存储,形成唯一标识的...
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