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一种特征编辑方法、装置及设备
本发明提供一种特征编辑方法、装置及设备,所述方法包括:获取基因特征的调整参数;对所述基因特征进行调整并实时获取所述基因特征的提示信息;当所述提示信息中的内容与所述调整参数相匹配时,结束调整并形成对应的目标基因特征。本发明可以非常快速地调整特...
机器学习的MST引物推荐方法、装置、设备及介质
本申请涉及机器学习的MST引物推荐方法、装置、设备及介质。所述方法包括:获取包括引物序列、宿主来源类型及扩增性能参数的历史MST引物数据集;并提取每条引物序列的GC含量、熔解峰锐度和Ct值波动系数等多维特征向量,生成结构化特征矩阵;随后基于...
一种引物设计方法、装置及设备
本发明提供一种引物设计方法、装置及设备,引物设计方法包括:获取目标碱基序列的双链结构;从所述双链结构的一个单链中获取待定引物;对所述待定引物进行修饰并实时确定所述待定引物的提示界面中的引物参数是否符合预设条件;当所述引物参数符合预设条件时,...
一种基于多模态的抗原特异性T细胞鉴定方法及系统
本发明属于生物信息学领域,公开了一种基于多模态的抗原特异性T细胞鉴定方法及系统,该方法将单细胞测序获得的基因表达、CDR3序列、TCR的V/D/J基因以及T细胞亚型多模态特征进行融合,以提升抗原特异性T细胞的识别与分类精度,采用新型预处理策...
基于双路类注意力机制与动态门控融合的基因组选择方法
本发明公开了一种基于双路类注意力机制与动态门控融合的基因组选择方法,属于基因组选择技术领域。所述方法包括以下步骤:获取基因遗传多态性位点的012编码矩阵,使用独立效应模块和协同效应模块分别捕获SNP位点的独立效应和协同效应,并通过动态门控将...
一种多聚体氟化酶的协同工程化改造方法
本申请涉及生物工程技术领域,尤其是涉及一种多聚体氟化酶的协同工程化改造方法,其包括对目标酶的N端序列、远端区域和核心区进行分步协同修饰。通过祖先序列重建或疏水性分析优化N端序列,利用多重序列比对与自由能计算筛选远端突变位点,并结合保守性分析...
基于图因果学习的单细胞多组学三元组预测方法及系统
本发明涉及生物信息学与人工智能技术领域,提供一种基于图因果学习的单细胞多组学三元组预测方法及系统,方法包括获取多组学原始数据并进行预处理,构建异构图,根据异构图生成单细胞多组学三元组节点;通过图神经网络对三元组节点进行多层传播与特征聚合并拼...
一种从头预测RNA结合蛋白结合偏好的方法及系统
本发明提供一种从头预测RNA结合蛋白结合偏好的方法及系统,涉及生物信息分析技术领域,包括:获取目标RNA结合蛋白的氨基酸序列;将所述氨基酸序列输入至RNA生成模型,所述RNA生成模型基于Transformer解码器架构,通过注意力机制整合由...
一种基于全基因组SNP位点集鉴定水稻实质性派生品种的方法
本发明涉及农业生物技术领域,公开了一种基于全基因组SNP位点集鉴定水稻实质性派生品种的方法。该方法通过对水稻待测品种和对照品种进行全基因组测序与基因型分析,利用一套预先筛选的15, 772个核心SNP位点集计算品种间遗传相似度,并基于该位点...
一种面向奶牛育种的高效SNP标记自动筛选系统
本发明公开了一种面向奶牛育种的高效SNP标记自动筛选系统,涉及奶牛育种筛选技术领域,用于解决筛选结果的科学性与稳定性降低,遗传改良效率与标记利用率误差增大的问题,通过从基因型‑表型数据库提取奶牛育种性状信息和基因点位数据,计算各性状遗传力并...
抗体测序方法和装置
本发明属于生物分析技术领域,涉及一种抗体测序方法和装置,具体地,涉及一种基于束搜索的抗体肽序列组装的方法和装置。具体地,本发明涉及一种抗体测序方法,包括如下步骤:S1,获得待测抗体的同源模板;S2,对肽段从头测序数据进行清洗,得到清洗后的肽...
一种基于靶向测序的TP53基因杂合性缺失及拷贝数变异检测方法
本申请适用于生物信息学与分子诊断技术领域,提供了一种基于靶向测序的TP53基因杂合性缺失及拷贝数变异检测方法,本申请通过定制化探针设计、动态参考集校正、改进HMM模型及KDE双峰判定等核心技术创新,实现了TP53基因LOH/CNV与突变的同...
一种基于生成对抗网络的代谢组学数据批次效应校正方法
本申请提供了一种基于生成对抗网络的代谢组学数据批次效应校正方法,涉及生物信息学与分析化学交叉技术领域,所述方法包括:生成代谢组学数据训练集和代谢组学数据测试集;构建基于注意力机制的神经网络模型;构建生成对抗网络模型;根据代谢组学数据训练集构...
一种基于DLGapCloser模型的小型基因组Gap填充方法
本发明涉及一种基于DLGapCloser模型的gap填充方法。包括如下步骤:1:在传统组装工具Sealer上识别出gaps,使用比对工具将gap两侧的基因序列提取出来作为待映射数据,然后将该数据在原始基因序列和同源基因组上进行映射并提取作为...
一种基于多模态融合的抗体药物偶联物性质预测方法
本发明提出一种基于多模态融合的抗体药物偶联物性质预测方法,属于生物信息学领域。首先,通过正弦位置编码显式建模序列位置信息;其次,引入双向交叉注意力机制建立轻链与重链交互及抗原与抗体对齐;再次,集成图神经网络依据注意力权重重建邻接关系提取拓扑...
一种PROTAC三元复合物的模拟方法及其筛选系统
一种PROTAC三元复合物的模拟方法及其筛选系统,提出基于构象系综的工作流程:对POI与E3进行分子动力学采样,生成多构象系综;基于多构象系综进行蛋白‑蛋白对接并结合多参量初筛/聚类;在筛选得到的代表性二元复合物上自动构建linker并精筛...
基于网络药理学和分子对接技术分析虾青素治疗神经退行性疾病的方法
本发明属于网络药理学和分子对接技术领域,公开了一种基于网络药理学和分子对接技术分析虾青素治疗神经退行性疾病的方法。包括获取虾青素活性成分对应的靶点、神经退行性疾病相关靶点的收集、虾青素‑神经退行性靶点PPI网络构建、核心靶点GO与KEGG富...
一种基于多维度表征的药物诱导抑郁风险的预测方法
本发明提供一种基于多维度表征的药物诱导抑郁风险的预测方法。本发明利用Louvain算法建立抑郁症的疾病发病簇,以及网络邻近算法计算疾病发病簇与药物靶标在生物网络中的相对平均最短距离以表征疾病发生发展特征;同时识别抑郁症的结构警报并计算药物分...
乙肝病毒抗原表位肽的筛选方法、计算机设备及存储介质
本申请公开了一种乙肝病毒抗原表位肽的筛选方法、计算机设备及存储介质,该方法包括:基于乙肝病毒的全部蛋白组序列,生成初始筛选库,初始筛选库包括多个待筛选后的抗原表位肽;构建每个抗原表位肽对应的抗原表位肽‑MHC复合物;基于抗原表位肽‑MHC复...
一种用于NK细胞培养的免疫活性预测方法及系统
本发明涉及生物信息学技术领域,公开了一种用于NK细胞培养的免疫活性预测方法及系统,包括:在NK细胞培养过程中采集表面受体信号强度、细胞因子分泌速率、培养液代谢特征参数及细胞群体形态学指标;对参数进行归一化与时间序列重构,形成受体激活趋势、分...
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