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一种基于多模态特征与自动机器学习集成的蛋白质硫基化位点预测方法
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一种融合DNA序列语义与拓扑结构的转录因子结合位点预测方法
转录因子结合位点预测是解析基因调控网络的重要任务,但现有方法常因序列语义不足、结构信息缺失及跨尺度特征难以融合而受限。本研究提出多模态融合模型MSGSNet,通过协同建模DNA的序列与结构信息提升预测性能。模型在序列端融合核苷酸与密码子两级...
一种基于抗条锈病基因编辑与数字孪生控制的快速小麦育种方法及系统
本发明提供了一种基于抗条锈病基因编辑与数字孪生控制的快速小麦育种方法及系统,涉及数字育种技术领域。本发明通过获取Yr61所在基因组区段并定位抗性相关目标核苷酸序列,构建向导RNA与基因编辑载体获得多类型编辑群体;在多菌系、多环境条件下采集病...
一种内源性昼夜节律紊乱量化方法与相关基因簇检测方法
本发明公开了一种内源性昼夜节律紊乱量化方法与相关基因簇检测方法,通过采集数据并对数据进行归一化处理,计算基因样本上的平均表达、统计昼夜节律相关的基因出现频率、分配加权抽样概率,对归一化矩阵进行中心化处理、计算随机背景得分、计算观测得分,进而...
一种PLEKHA4基因表达水平与低级别胶质瘤放疗敏感性的相关性模型及预测方法
本发明提出了一种创新的基于PLEKHA4基因表达水平与低级别胶质瘤放疗敏感性相关性的模型及预测方法。该模型通过构建多因素Logistic回归分析框架,将PLEKHA4基因表达水平与关键临床病理参数有机结合,以建立放疗敏感性预测模型。该方法包...
一种土壤微生物群落对玉米生长影响评估方法及系统
本申请公开了一种土壤微生物群落对玉米生长影响评估方法及系统,涉及土壤微生物技术领域,本申请通过引入功能基因表达潜能指数对菌株功能进行量化,并结合带约束的优化算法进行群落设计,确保了目标功能的最大化,同时满足了发育多样性与功能冗余要求,提升了...
一种单细胞转录组批次效应识别方法及系统
本发明属于单细胞相关技术领域,提出一种单细胞转录组批次效应识别方法及系统,基于PERMANOVA和混淆检测机制的临床元数据重要性评估方法,从临床元数据中筛选出对批次效应识别最有价值的元数据信息;通过将细胞聚合为metacells来降低噪声、...
一种基于DFT理论指导的巯基类SERS探针的理性设计与筛选方法以及SERS传感器的构建方法
本发明具体涉及一种基于DFT理论指导的巯基类SERS探针的理性设计与筛选方法以及SERS传感器的构建方法。本发明方法包括:选巯基类分子;采用DFT计算优化其几何构型并获取其HOMO、LUMO能级与ESP分布图;提取HOMO‑LUMO能隙(Δ...
基因序列特征区分方法及设备
本发明的目的是提供一种基因序列特征区分方法及设备,通过建立不同的特征显示风格,其中,同一特显示风格下包括多个子显示风格,其中,同一特征显示风格下的各个子显示风格为各个相近色彩和各个相近图形的组合、或各个相近色彩、或各个相近图形,可以实现对不...
单细胞数据分析方法、装置、设备和存储介质
本申请涉及一种单细胞数据分析方法、装置、计算机设备、计算机可读存储介质和计算机程序产品。所述方法包括:获取目标细胞的基因表达数据;对基因表达数据进行排序处理,得到有序基因表达数据;根据预训练的单细胞基础模型对有序基因表达数据进行基因表达分析...
基于AI的河流沼蛤特异性引物设计及快速检测方法
本发明涉及水生生物分子检测与人工智能交叉技术领域,具体为基于AI的河流沼蛤特异性引物设计及快速检测方法,针对现有河流沼蛤检测技术中形态学鉴定准确率低、分子检测引物设计适配性差、使用成本高、检测效率低及场景适配单一等问题,本发明构建了数据、筛...
一种基于微生物全基因组测序的综合风险评估方法
本发明公开了一种基于微生物全基因组测序的综合风险评估方法,属于药品生产与微生物安全控制技术领域。该方法通过kmerfinder进行高精度物种鉴定,结合RGI识别耐药基因,并整合临床检出频率、疾病关联性、孢子/生物被膜形成能力及耐药基因公共卫...
一种基因突变的检测方法及装置、电子设备和存储介质
本公开公开了一种基因突变的检测方法,包括:获取与参考基因组比对后的序列读段;执行多次组装操作,以得到多次组装结果,每次组装操作包括:对比对后的序列读段进行组装,不同次组装操作的组装条件不同,组装条件包括:比对后的序列读段的数量达到阈值;对多...
一站式肿瘤RNA-seq分析系统
本发明公开了一站式肿瘤RNA‑seq分析系统,包括原始数据质控模块、序列比对与定量模块、融合基因分析模块、可变剪切分析模块、差异表达分析模块、功能富集分析模块、免疫通路模块、数据管理与可视化模块以及容器化安全部署模块,该系统接收原始RNA‑...
基于改进Transformer的碳循环相关蛋白质功能预测方法
本发明公开了一种基于改进Transformer的碳循环相关蛋白质功能预测方法,包括:获取待测的碳循环相关蛋白质氨基酸序列并预处理,生成标准的待测氨基酸序列;提取待测氨基酸序列的语义嵌入特征,并计算出物理化学性质特征;将语义嵌入特征、物理化学...
一种基于深度学习和多尺度特征融合的DNA甲基化识别方法
本发明公开了一种基于深度学习和多尺度特征融合的DNA甲基化识别方法,属于人工智能与生物科学交叉领域,该方法包括以下步骤:获取待测DNA序列的原始数据,对所述原始数据进行预处理和特征提取,得到时频特征矩阵;将所述时频特征矩阵输入至预先训练的多...
一种基于snakemake框架的基因水平DNA甲基化、转录组、蛋白组联合分析方法、系统及应用
本发明公开了一种基于snakemake框架的基因水平DNA甲基化、转录组、蛋白组联合分析方法,包括以下步骤:DNA甲基化和/或转录组和/或蛋白组原始数据的预处理,基因甲基化分析,基于基因甲基化分析数据、预处理后的转录组数据、预处理后的蛋白组...
一种预测测序质量的方法、系统和计算机可读存储介质
本发明公开了一种确定测序质量的方法、系统和计算机可读存储介质。确定测序质量的方法包括:获取指定流体通道内至少两种混合待测样本在当前次测序运行中的测序特征,测序特征能够根据在当前次测序运行中第A至B轮测序反应采集到的图像得到,其中至少两种待测...
一种癌症基因组图谱关键基因定位方法
本发明公开了一种癌症基因组图谱关键基因定位方法,其步骤包括:1)对于病例集合中的每一病例,生成该病例的病理图像嵌入、文本嵌入;对于该病例集合对应的基因表达矩阵中每一基因,将其标准化表达向量与各病例的病理图像嵌入、文本嵌入拼接为统一状态向量,...
一种基于免疫组库序列数据的分类模型构建方法、数据分类方法、MRD长期监测必要性评估方法及存储介质
本发明公开了一种基于免疫组库序列数据的分类方法、系统及存储介质。该方法包括:对免疫组库测序原始数据进行质量控制、序列比对和克隆注释的预处理;提取包括免疫多样性指数、免疫克隆性、克隆频率top10、基尼系数、VJ多样性、3‑mer基序数量及频...
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