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适用于多测序平台抗生素耐药基因端对端检测系统及方法
本发明公开了一种适用于多测序平台的抗生素耐药基因端对端检测方法和系统,检测方法包括多平台宏基因组数据一站式分析步骤和基于深度学习的抗生素耐药基因检测步骤,多平台宏基因组数据一站式分析包括,根据输入测序数据格式,自适应判定测序平台,选择相应的...
基因调控网络的推断方法、装置、设备及存储介质
本申请公开了一种基因调控网络的推断方法、装置、设备及存储介质,涉及生物信息学技术领域,通过双边自表征模型提供的矩阵分解框架求解细胞间调控关系矩阵,能够为细胞间调控提供更准确的因果关系推断。其中方法包括:获取第一基因表达矩阵和第二基因表达矩阵...
一种基于PDX模型的空间转录组数据分析系统
本申请提供了一种基于PDX模型的空间转录组数据分析系统,涉及生物信息分析技术领域。包括以下步骤:提取测序序列中的坐标标识符、分子标识符和样本转录本序列;分析样本转录本序列,将测序序列初步归类为第一序列、第二序列、不确定序列和丢弃序列;计算每...
基孔肯雅病毒基因型及关键突变位点的分析方法及系统
本申请是关于一种基孔肯雅病毒基因型及关键突变位点的分析方法及系统,包括:获取CHIKV基因组序列数据,通过预处理得到高覆盖率数据集与低覆盖率数据集,并对高覆盖率数据集进行进化多样性分析确定非保守位点;根据高覆盖率数据集及非保守位点构建位置权...
一种小核酸药物与KRAS突变蛋白结合亲和力分析筛选方法
本发明公开了一种小核酸药物与KRAS突变蛋白结合亲和力分析筛选方法,包含KRAS突变体和野生型的靶标蛋白组及小核酸初始文库;进行多轮结合正筛选与负向筛选的循环,其中所述负向筛选特定地使用KRAS野生型蛋白作为反选择靶标,以主动富集对突变体具...
一种基于TBR1定点突变体的抗肿瘤药物细胞筛选模型建立方法及应用
本发明提供了一种基于TBR1定点突变体的抗肿瘤药物细胞筛选模型建立方法及应用,属于生物医药技术领域。本发明通过分析南京医科大学儿童医院髓母细胞瘤(MB)患者和EGA数据库MB临床患者数据,发现Group4亚型MB占比最高,且TBR1突变特异...
基于DNA大模型与时频域深度学习融合的必需基因预测方法
本发明属于必需基因预测技术领域,具体涉及基于DNA大模型与时频域深度学习融合的必需基因预测方法,以领域化DNA大模型为核心表征层,经跨物种语料预训练与任务化微调获取专用基因表征;采用T‑Block与F‑Block双通道时频融合结构,通过扩展...
一种基于图像表型的小麦籽粒花青素相关基因的检测方法
本发明公开了一种基于图像表型的小麦籽粒花青素相关基因的检测方法,其包括如下步骤:S1、采集小麦籽粒样品图像,并对图像进行自动化处理;S2、提取图像的RGB颜色空间特征,并将其转换至Lab颜色空间,获得L值、a值和b值;S3、获取SNP基因型...
一种亚铁血红素结合位点预测方法、系统、介质和设备
本发明公开了一种亚铁血红素结合位点预测方法、系统、介质及设备,涉及位点预测领域,包括获取蛋白质序列及结构信息; 根据蛋白质序列及结构信息,提取多个理化属性特征、氨基酸嵌入特征和蛋白质二级结构特征;对多个理化属性特征进行融合操作,确定全局进化...
一种判别单基因纯、杂合缺失的方法及装置
本公开提供了一种检测基因外缺失的方法及装置。该方法包括:S1,获得测序数据;S2,将所述杂交捕获的区域进行分区,分别得到每一个bin分区内的测序覆盖度的log2值;S3,计算步骤S2得到的所有bin分区的log2值的中位数作为median值...
基于多通道序列结构融合的酶等电点与最适条件预测方法
本发明涉及基于多通道序列结构融合的酶等电点与最适条件预测方法,从酶学记录获取包括目标变量的多源数据,对多源数据进行对齐和标准化处理,并按照指定比例划分为训练集与测试集;通过构建的蛋白质语言模型对训练集进行多通道特征提取,分别得到各通道的特征...
一种用于宏基因组的基因丰度计算的方法、装置及设备
本申请提供了一种用于宏基因组的基因丰度计算的方法、装置及设备,其方法包括:对样本进行处理,得到clean reads及contigs;遍历clean reads,与contigs中相关的contig进行mapping处理,将得分满足第一预设...
多机制分子胶可诱导性预测方法
本申请公开了一种多机制分子胶可诱导性预测方法,涉及计算机辅助药物设计技术领域,公开的多机制分子胶可诱导性预测方法,通过联合编码小分子与两类蛋白质的一维序列、二维图结构和三维结构等多模态特征,并引入三元跨实体特征交互机制,实现了对不同E3、底...
基于结构先验评估的抗体可变区结构预测方法
本发明涉及人工智能领域,具体公开了基于结构先验评估的抗体可变区结构预测方法,包括:S1、从PDB筛选含完整抗原与抗体H/L链的高分辨率、高完整性复合物,处理后提取原子坐标;S2、计算分子结构几何特征及相邻残基相对球极坐标;S3、依物理先验与...
一种用于预测酶的方法、设备、介质及程序产品
本申请的目的是提供一种用于预测酶的方法、设备、介质及程序产品,通过待催化的目标反应的反应类型编号在宿主内找到与待催化的目标反应相匹配的酶,引入反应类型编号作为先验,实现反应类型驱动的酶设计,确保设计的酶能够催化目标反应,通过保留非核心区域的...
一种基于图卷积网络的蛋白质-配体结合亲和力预测方法
本发明提出一种基于图卷积网络的蛋白质‑配体结合亲和力预测方法。首先基于蛋白质口袋三维结构构建蛋白质图,并利用 ESM3 对序列残基进行特征编码;同时对配体构建含几何信息的分子图,并结合分子指纹提取化学特征。随后采用多层消息传递图神经网络实现...
一种基于大模型的神经细胞再生药物靶点圈定方法
本发明提供一种基于大模型的神经细胞再生药物靶点圈定方法,所述方法包括:获取并融合至少两种反映神经细胞再生过程的多模态生物医学数据,构建动态知识图谱;基于动态知识图谱,构建模拟目标神经细胞再生的数字孪生模型;基于数字孪生模型识别潜在药物靶点,...
一种肾脏巨噬细胞铁稳态调控方法、系统及存储介质
本发明涉及医疗数据处理技术领域,尤其涉及一种肾脏巨噬细胞铁稳态调控方法、系统及存储介质。包括 : 通过从生物数据库中获取巨噬细胞在疾病环境下的铁代谢数据,分析酶系统老化特征,得到酶系统功能减弱指标;评估肾小球损伤样本中的铁积累水平,并计算铁...
一种内存条老化测试装置及方法
本发明涉及内存条测试技术领域,尤其涉及一种内存条老化测试装置及方法,包括测试箱,所述测试箱内部开设有测试腔,所述测试腔内部设置有测试板,所述测试板内部插入有内存条。本发明通过双轴电机配合电磁离合器分别驱动均热机构与热回收机构,其中往复螺杆带...
一种存储电路验证系统及存储电路验证方法
本发明涉及一种存储电路验证系统及存储电路验证方法,存储电路验证系统包括:存储电路,其用于存储数据;存储模型,其与所述存储电路相连,所述存储模型用于模拟存储电路的功能,并验证存储电路的数据以及初始化存储电路;以及验证环境,其与所述存储模型相连...
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