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一种融合蛋白质伪三维结构的多模态特性预测方法
本发明涉及人工智能和生物信息学交叉技术领域,尤其涉及一种融合蛋白质伪三维结构的多模态特性预测方法。其主要针对现有处理方法对三维结构特征的利用不足的问题,提出如下技术方案包括以下步骤:步骤一、数据收集与筛选;步骤二:多模态原始特征提取;步骤三...
一种质谱组学模型的训练与分析方法、存储介质及设备
本发明实施例提供一种质谱组学模型的训练与分析方法、存储介质及设备,属于质谱组学技术领域。所述方法包括:获取质谱组学数据,并进行统一封装;基于选取的至少一种预处理方法,对所述质谱组学数据进行预处理;基于选取的至少一种特征选择方法,对预处理后的...
长读长测序基因组组装质量评估方法及系统
本发明涉及基因检测技术领域,具体为长读长测序基因组组装质量评估方法及系统,包括以下步骤:通过采集片段末端与相邻片段首端碱基计算匹配率标记断裂区域,统计突变密集度分析分布差异生成轨迹异常,向量化延伸方向进行主成分分析得到方向趋势,构建趋势曲线...
一种用于UMI和Poly-A尾分析的文库构建方法及其应用
本发明涉及一种用于UMI和Poly‑A尾分析的文库构建方法及其应用。本发明设计新型的文库构建流程,搭建了UMI+Poly‑A尾的串连文库流程,可以完整得到Poly‑A尾的全部序列,可用于同时对UMI和Poly‑A尾测序分析,可以对原始转录本...
一种菌株水平微生物群落动态分析方法及系统
本申请公开了一种菌株水平微生物群落动态分析方法及系统,涉及微生物领域:利用涵盖16S rRAN基因全长的引物对提取的DNA进行PCR扩增;利用PacBio CCS对扩增产物进行测序,得到测序数据;并对测序数据进行筛选和去噪处理;对目标菌株进...
基于对比学习的基因特征识别方法及其相关设备
本申请涉及医学领域以及机器学习领域,尤其是涉及一种基于对比学习的基因特征识别方法及其相关设备。该方法首先获取目标基因特征向量,再将目标基因特征向量输入预训练的卵巢癌基因特征识别模型中,以使卵巢癌基因特征识别模型输出对应的对应的基因特征识别结...
基于改进关系网络的蛋白质变构位点突变效应预测系统
本发明公开了一种基于改进关系网络的蛋白质变构位点突变效应预测系统,该系统通过蛋白质语言模型提取野生型变构蛋白与突变型变构蛋白的序列与结构特征,并利用跨模态注意力机制和门控网络融合生成综合特征矩阵。改进的关系网络采用引入混合注意力模块和在原来...
蛋白标志物组合的筛选方法、装置及存储介质
本发明公开了一种蛋白标志物组合的筛选方法,用于腹主动脉瘤或破裂腹主动脉瘤的风险预测,通过构建初始蛋白表达谱,优化蛋白表达谱的稳定性;采用统计学分析筛选差异表达蛋白,基于生存分析或风险回归模型,初步锁定与疾病终点显著关联的候选蛋白;联合稀疏约...
脑胶质瘤微环境形成关键分子机制解析方法
本发明涉及生物信息技术领域,具体为脑胶质瘤微环境形成关键分子机制解析方法,包括以下步骤:调用表达数据分析细胞标志物顺序构建分段区间,计算候选因子表达方向判断趋势一致性,识别表达聚集差异构建分裂节点区段,分析通路变化趋势生成漂移评分,评估多标...
植物性饲料遗传标记FTIR光谱筛选方法
本发明涉及农业生物技术领域,公开了植物性饲料遗传标记FTIR光谱筛选方法,该方法首先从具有遗传多样性的植物群体中获取多个植物个体的饲料样品并采集其FTIR光谱数据;接着对这些光谱数据进行预处理并提取量化的光谱特征参数,从而为每个植物个体建立...
基于簇级自监督对比学习的多组学癌症亚型识别方法
本发明公开了基于簇级自监督对比学习的多组学癌症亚型识别方法,具体按以下步骤实施:步骤1,数据预处理;步骤2,预训练深度图卷积网络;步骤3,基于跨组学簇级自监督对比学习模块;步骤4,待步骤3中完成网络优化后,利用优化后的参数计算样本的概率分布...
一种mRNA帽子结构表达效率的预测方法、预测系统和存储介质
本申请提供了一种mRNA帽子结构表达效率的预测方法、预测系统和存储介质。所述预测方法包括获取待预测的mRNA帽子结构相关分子的SMILES序列,基于SMILES序列生成DGL分子图,对DGL分子图进行第一编码得到图向量,对SMILES序列进...
蛋白质适应度预测方法、装置、终端及存储介质
本申请涉及蛋白质工程与生物信息学技术领域,具体提供一种蛋白质适应度预测方法、装置、终端及存储介质,方法包括:利用预训练的蛋白质语言模型提取野生型序列级表征和突变型序列级表征,并计算二者间的表征差值向量;从多序列比对信息中推断出共进化耦合信息...
基于生长周期时序编码的Transformer大豆品质评估方法
本发明涉及品质评估领域,具体涉及基于生长周期时序编码的Transformer大豆品质评估方法,包括获取多时相遥感数据,基于识别不同基因型大豆的关键物候转折点,构建具有基因型特异性的生长阶段序列;针对每个基因型特异性的生长阶段序列,提取多模态...
一种基于二代测序数据的突变背噪过滤算法
本发明公开了一种基于二代测序数据的突变背噪过滤算法,涉及高通量测序数据分析技术领域,以解决现有技术依赖基线、适配性差、假阳性高的问题。该算法先预处理测序数据获pileup文件,按序列上下文分类位点并计算错误率,构建分层背噪模型检验突变,结合...
用于检测干燥综合征的STAT4基因多态性位点组合及试剂盒
本发明属于生物医学领域临床检测技术中的基因检测技术,具体涉及用于检测干燥综合征的STAT4基因多态性位点组合,该组合为rs3771326、rs6715106、rs3024904、rs3024851、rs3024908、rs3771327、r...
一种基于注意力机制与图变分自编码器的单细胞多模态数据整合方法
本发明公开了一种基于注意力机制与图变分自编码器的单细胞多模态数据整合方法,所述方法包括如下步骤:步骤1、多模态数据预处理与细胞关系图构建;步骤2、基于多头注意力的跨模态邻接矩阵融合;步骤3、图变分自编码器训练与多目标优化;步骤4、多目标损失...
一种基于纳米孔自适应采样和深度学习的细菌病原体检测模型的构建方法、设备、介质和程序产品
本发明提供了一种基于纳米孔自适应采样和深度学习的细菌病原体检测模型的构建方法及应用该模型进行细菌病原体的检测方法、设备、介质和程序产品,涉及纳米孔测序技术领域。细菌病原体的检测方法包括:获取待检测水样;将待检测水样输入本申请构建的检测模型中...
一种通过分析减数分裂重组率评估男性生育力的方法及系统
本发明公开了一种通过分析减数分裂重组率评估男性生育力的方法及系统,包括:获取受试者的二倍体生物样本和多个单体精子细胞;通过测序分别确定其在杂合基因座上的二倍体及单倍体基因型;基于基因型数据,为每个精子细胞识别并过滤减数分裂交叉事件,从而计算...
基于转移熵和能量阻挫的预测蛋白质变构位点的集成模型方法
基于转移熵和能量阻挫的预测蛋白质变构位点的集成模型方法,属于蛋白质功能性位点预测技术领域。首先,收集整理了变构蛋白质数据集,构建训练集和独立测试集。然后,按照以下四个步骤进行:一是根据蛋白质变构数据库信息标记经实验验证的正构位点和变构位点;...
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