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基于Fast-Ridge的快速多群体基因组预测方法
本发明提供了基于Fast‑Ridge的快速多群体基因组预测方法,是面向多群体基因组预测的高效Ridge回归求解方法(FAST‑Ridge‑MP)。通过协同设计算法架构创新与超参数自适应调优,基于共轭梯度法(CG)的高效稀疏矩阵求解器将传统算...
一种新型酶挖掘的EnzyForge AI深度学习筛选方法
本发明首次构建并提出了一种面向新型酶分子挖掘的 EnzyForge AI 深度学习筛选方法。针对传统酶筛选依赖序列同源性、难以有效发现低同源但功能相似酶的技术瓶颈,本发明的方法创新性地将序列同源性搜索与结构相似性搜索相结合,并以局部催化关键...
基于Argo Workflows的肿瘤全外显子测序全景式变异图谱分析方法及系统
本发明公开了一种基于Argo Workflows的肿瘤全外显子测序全景式变异图谱分析方法及系统,包括:利用Argo Workflows将肿瘤样本及其配对正常样本的全外显子测序原始数据的变异类型分析流程中所涉及的各分析工具均封装为独立的Doc...
一种筛选基因组特异性序列的方法及相关装置
本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种筛选基因组特异性序列的方法及相关装置。该方法通过整合高精度重测序数据与长片段基因组数据,显著提升近缘品系间结构变异检测的准确性,有效降低假阳性,大幅节省验证成本,适用于多物种品系鉴定及分子标记开发,在精准...
传递关于移植物的供体与受体的相容性的信息
示例性方法包括获得关于移植物的受体和移植物的潜在供体的信息,其中信息包括受体的HLA(人白细胞抗原)分型和潜在供体的HLA分型;基于该信息获得多个数据集,其中每个数据集包括基于潜在供体与移植物的受体的相容性的指标;将多个数据集存储在数据库中...
一种预测突变蛋白质性质的方法、装置和设备
本申请公开一种预测突变蛋白质性质的方法、装置和设备,方法包括:对原始蛋白质的嵌入特征和理化特征、原始蛋白质突变产生的突变蛋白质的嵌入特征和理化特征、突变蛋白质残基的相互作用特征进行融合处理,得到突变蛋白质的初始节点特征;相互作用特征表征突变...
肿瘤新抗原的公共价值评估方法及装置、设备、存储介质
本发明属于生物信息学技术领域,公开了一种肿瘤新抗原的公共价值评估方法及装置、设备、存储介质,通过获取泛癌样本突变数据进行错义突变分析,获得多个错义突变位点与人类基因组比对获得候选突变位点,提取每个候选突变位点对应的新生肽段输入预测模型,预测...
硫酸乙酰肝素-α-葡萄糖苷N-乙酰转移酶的人工智能设计与表达体系构建方法及系统
本发明涉及酶的人工设计技术领域,具体为针对具有11个跨膜区域的溶酶体膜蛋白型N‑乙酰转移酶的人工智能设计与表达体系构建方法及系统,包括以下步骤:采集酶与底物反应速率信息,关联结构模型与速率参数,比对残基三维差异,设计替换氨基酸组合与调控元件...
一种基于多模态鲜味强度特征识别的牡蛎呈味肽筛选方法
本发明提供一种基于多模态鲜味强度特征识别的牡蛎呈味肽筛选方法,涉及食品科学与生物信息学交叉技术领域,包括:构建牡蛎鲜味肽多模态特征数据集;构建ACTM模型,ACTM模型包括集成氨基酸性质感知注意力机制APAA和受体结合位点预测模块RBSP的...
基于单细胞聚类结果的细胞亚群划分优化方法和装置
本申请实施例提供一种基于单细胞聚类结果的细胞亚群划分优化方法和装置。应用于医疗数据分析技术领域,该方法通过根据预设的初始聚类分辨率对单细胞RNA测序数据进行聚类分析,得到初步聚类后的多个细胞亚群;对初步聚类得到的每个细胞亚群进行差异表达分析...
病原真菌泛基因组分析方法、装置、设备和可读存储介质
本申请涉及一种病原真菌泛基因组分析方法、装置、设备和可读存储介质。所述方法包括:通过获取待分析的包含多个contig序列测序基因组数据,去除测序基因组数据中人类和细菌的contig序列,得到清洗后的测序基因组数据,对清洗后的测序基因组数据进...
一种膀胱癌干细胞检测试剂盒在筛选和鉴定膀胱癌干细胞中的应用
本发明提供了一种膀胱癌干细胞检测试剂盒在筛选和鉴定膀胱癌干细胞中的应用,试剂盒中包括细胞膜蛋白GPNMB。筛选细胞膜蛋白GPNMB的方法为:对膀胱癌组织单细胞测序数据EPCAM+的肿瘤细胞进行重新聚类,得到多个细胞群。拟时序分析研究各群细胞...
一种细胞特异性遗传变异扰动的评估方法、系统、设备及存储介质
本发明公开了一种细胞特异性遗传变异扰动的评估方法、系统、设备及存储介质,利用整合后的单细胞数据集训练变分自编码器,通过变分自编码器的编码器将高维基因表达谱映射为低维隐空间内的细胞状态向量;冻结编码器的参数,利用带有单核苷酸变异标签的训练数据...
一种回交育种区块化遗传背景精准评估方法、设备及程序产品
本申请涉及植物育种领域,具体涉及一种回交育种区块化遗传背景精准评估方法、设备及程序产品。通过获取回交群体中单株及其双亲基因型数据,建立基因型到单倍型的标准化染色体片段回复状态判定和转化流程;计算回交单株染色体回复片段与未回复片段比例,形成遗...
调控元件识别方法、装置、设备、存储介质和程序产品
本申请涉及一种调控元件识别方法、装置、设备、存储介质和程序产品,本申请涉及生物信息技术领域,能够提高复杂调控场景调控元件的识别准确性和效率。该方法包括:获取单细胞染色质可及性测序数据和单细胞表达量测序数据,获取待调整的调控关系集合;根据调控...
一种基于蛋白抑制率的信号通路功能富集分析方法、系统、设备及介质
本发明涉及计算毒理学与生物信息学技术领域,公开一种基于蛋白抑制率的信号通路功能富集分析方法、系统、设备及介质,通过训练抑制概率预测模型,学习活性/非活性抑制剂与目标信号通路关键蛋白的相互作用关系,进而预测待测化合物对关键蛋白的抑制概率,并将...
一种识别脑出血预后相关基因靶点的生物信息学分析方法
本发明一种识别脑出血预后相关基因靶点的生物信息学分析方法,通过获取脑出血转录组表达数据并实施质量过滤与批次校正生成标准化表达矩阵;依据标准化表达矩阵实施差异表达分析并结合生存回归筛选预后关联差异基因;构建加权共表达网络识别预后关键基因簇并通...
基于图神经网络的激酶抑制剂虚拟筛选及耐药性预测方法
本发明公开了基于图神经网络的激酶抑制剂虚拟筛选及耐药性预测方法,属于计算机辅助药物设计技术领域,通过引入拓扑数据分析技术,构建包含激酶蛋白节点、激酶抑制剂节点和活性残基节点的三元关系图,利用持久同调理论提取高维拓扑特征,并基于拓扑特征权重设...
一种闪存颗粒筛选分级方法
本发明公开了一种闪存颗粒筛选分级方法,包括S1将多个闪存颗粒集成在同一印刷电路板上,设置包括坏块阈值、IO速率阈值和新增坏块标记的测试参数;S2执行数据写入操作,采用并行写入方式向每个闪存颗粒的多个实体块中写入数据;S3执行数据读取操作,采...
带电固态硬盘的测试方法、装置、设备及存储介质
本申请公开一种带电固态硬盘的测试方法、装置、设备及存储介质,所述测试方法包括:将处于带电状态的固态硬盘置于高低温湿热试验箱;基于第一温度和第一湿度调节试验箱达到测试环境,并配置试验箱达到温度平衡和湿度平衡;将固态硬盘放置第一预设时长,并实时...
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