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  • 本发明提供了一种蛋白质组学复杂翻译后修饰规模化快速鉴定方法,包括:对样本的原始蛋白质数据进行预处理,得到一级信号峰簇和每个一级信号峰对应的候选二级信号峰集合;基于一级信号峰簇和候选二级信号峰集合确定一级信号峰和二级信号峰峰对;基于预先训练好...
  • 本发明提供一种外泌体膜蛋白互作用网络分析方法,属于外泌体膜蛋白互作用网络技术领域,发明提出的外泌体膜蛋白互作用网络分析方法首先从数据库获取目标蛋白质的序列和结构信息,继而通过物化特征向量描述蛋白质属性并进行降维聚类。然后利用创新的蛋白质互作...
  • 本发明公开了一种基于AI的基因数据分析系统,通过多组学数据矩阵;通过1D‑CNN一维卷积神经网络对所述多组学数据矩阵进行局部关联模式挖掘,通过持续同调分析识别基因网络的拓扑结构,并利用动态注意力机制对序列特征和拓扑特征矩阵分配动态权重,输出...
  • 本公开提供了一种基于人工智能的变异点位预测筛选系统及方法,本公开中,文献检索模块用于抓取多源证据的数据,并基于抓取的数据构建用于变异点位预测的医学知识图谱;其中,利用训练好的图谱构建模型对抓取的数据进行实体识别、关系抽取,以及基于识别得到的...
  • 本发明公开了一种跨物种RBP‑RNA相互作用预测方法、系统及应用,涉及RNA转录后调控和深度学习技术领域。该方法包括步骤:获取待预测的RNA一级序列,并对RNA一级序列进行结构预测,得到RNA的二级结构序列;构建相互作用预测模型,利用多物种...
  • 本发明公开了一种基于基因作用方式的药用植物表型预测方法,首先根据基因对表型的影响方式构建基于基因作用方式的药用植物表型预测模型,针对关键基因对表型的影响,引入高斯噪声和稀疏正则化损失对关键基因特征进行提取,同时使用隐藏层进行数据降维保证模型...
  • 本发明公开了一种基于多模态融合与动态图胶囊网络的蛋白质特征提取方法,它包括如下步骤:步骤S1、接收批次蛋白质序列集合;步骤S2、对所述蛋白质序列分别进行One‑Hot编码操作及掩码生成操作;步骤S3、将所述蛋白质序列输入预训练蛋白语言模型并...
  • 本发明公开了一种基于16S rRNA高变区的菌种鉴定方法。本发明综合16S rRNA的多个高变区,通过分子进化树的方法,研究不同可变区的特定菌种和同属其他菌种的区分能力,最终可以找到不同高变区的组合,达到在种水平鉴定该特定菌种的目的。
  • 本申请提供一种AAV变体组织特异性筛选方法、装置、系统和存储介质,涉及生物工程和基因治疗技术领域。所述筛选方法包括:构建AAV变体文库;获取高通量测序数据;应用变化点检测算法处理高通量测序数据,并依据噪声过滤阈值对测序数据进行过滤;应用标准...
  • 本发明属于活性位点预测技术领域,具体涉及一种基于图神经网络的酶活性位点预测方法。为实现对活性位点的高精度预测,本发明的酶活性位点预测模型HFGN采用双分支架构:酶分支整合了三维结构、PLM嵌入、同源性得分与EC功能注释,并通过注意力机制实现...
  • 本发明涉及临床病原体领域,提供一种基于机器学习的临床病原体感染判读的方法,获取原始测序数据,去除低质量读段,使用生物信息学工具去除包括载体序列和接头序列的噪音,并将所有数据标准化为FASTQ格式,得到清洗后的数据;将清洗后的数据比对到参考基...
  • 本发明提供了一种复发性拷贝数变异的分析方法、分析装置、电子设备及存储介质,分析方法包括:获取复发性拷贝数变异数据集和复发性拷贝数变异检测过程中的检测数据;利用复发性拷贝数变异数据集与检测数据的比较,建立复发性拷贝数变异分析流程,以得到检测数...
  • 本发明公开了一种基于贝叶斯建模的单细胞测序数据分析方法,适用于低表达基因识别与生物异质性检测。该方法包括如下步骤:S1、数据采集与预处理;S2、建立贝叶斯层次模型,同时建模技术噪声与生物异质性;S3、引入泊松模型和泊松‑负二项模型相结合的策...
  • 本发明是面向纳米孔实时测序的耐药基因识别方法,包括在纳米孔测序过程中,通过检测原始电流信号中的非对称扰动特征,识别出存在惰性响应的信号区段,并对所述区段实施前向压缩性映射处理,以解除起始读取滞后对后续识别流程的影响;对经过处理的测序数据进行...
  • 本发明公开了一种高GC含量区域测序错误的矫正方法及装置,其中矫正方法包括:从测序平台获取原始FASTQ格式的测序数据,并对所述测序数据预处理得到包括训练集、验证集和测试集的样本;构建深度学习网络模型;利用所述训练集和验证集对所述深度学习网络...
  • 本发明提供了一种从食品和农业副产品中发现抗氧化肽并输出酶解推荐的方法及系统,涉及生物信息学与人工智能交叉技术领域。本发明的方法依次包括蛋白质序列采集与标准化、候选肽段截取、序列与结构表征融合预测抗氧化活性、酶切模拟生成可释放肽段、基于活性概...
  • 本发明公开了一种基于细胞内动态环境的CRISPR‑Cas13d gRNA设计方法、系统及应用,涉及RNA编辑和深度学习技术领域。该方法包括步骤:获取细胞系内靶标RNA的二级结构信息和RBP结合位点分布情况;基于深度学习算法构建gRNA设计模...
  • 本发明公开了一种mRNA序列评分方法和相关设备,方法包括:获取待评分的mRNA序列;从mRNA序列提取关键碱基序列,关键碱基序列包括起始密码子上下文和终止密码子上下文;将关键碱基序列输入目标评分模型,处理得到mRNA序列在目标指标的评分;其...
  • 本发明属于重组胶原蛋白序列分析技术领域,本发明公开了基于AI深度学习的重组胶原蛋白序列分析方法;包括提取天然III型胶原蛋白序列;将天然III型胶原蛋白序列应用训练好的模型,生成热力图;基于热力图生成优化后的天然III型胶原蛋白序列;使用微...
  • 本申请提供的真核生物水平基因转移的鉴定方法、装置、存储介质及计算机设备,当提取到目标真核生物高质量基因组的目标蛋白序列后,可以将目标蛋白序列与NR数据库中的蛋白序列进行序列比对后,按照预设的筛选条件对比对结果中的蛋白序列进行筛选,得到与目标...
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