中国科学院计算技术研究所张倍宁获国家专利权
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龙图腾网获悉中国科学院计算技术研究所申请的专利一种用于分子动力学模拟的加速系统、模拟方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120412763B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510331211.1,技术领域涉及:G16C10/00;该发明授权一种用于分子动力学模拟的加速系统、模拟方法是由张倍宁;元国军;康宁;王展;谭光明设计研发完成,并于2025-03-20向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种用于分子动力学模拟的加速系统、模拟方法在说明书摘要公布了:本发明提供了一种用于分子动力学模拟的加速系统,加速系统包括数据处理模块、特征提取模块和目标模型,加速系统被配置为对分子系统的每一次运动过程进行如下模拟计算:数据处理模块用于基于前一次模拟计算更新的分子系统中原子的位置信息获取位置矩阵,并采用预设的模型处理位置矩阵以获取嵌入矩阵;以及基于特征提取模块得到的融合矩阵的导矩阵按照已有的计算方式计算分子系统受力以更新分子系统中原子的位置信息;特征提取模块包括正向计算子模块和反向计算子模块,其中,正向计算子模块用于计算对称描述矩阵,反向计算子模块用于计算融合矩阵的导矩阵;目标模型用于处理对称描述矩阵以获取分子系统的分子势能和对称描述矩阵的导矩阵。
本发明授权一种用于分子动力学模拟的加速系统、模拟方法在权利要求书中公布了:1.一种用于分子动力学模拟的加速系统,分子动力学模拟用于模拟分子系统的动力学行为,分子系统包括多个由原子构成的分子,其特征在于,加速系统包括数据处理模块、特征提取模块和目标模型,加速系统被配置为对分子系统的每一次运动过程进行如下模拟计算: 数据处理模块用于基于前一次模拟计算更新的分子系统中原子的位置信息获取位置矩阵,并采用预设的模型处理位置矩阵以获取嵌入矩阵;以及基于特征提取模块得到的融合矩阵的导矩阵按照已有的计算方式计算分子系统受力以更新分子系统中原子的位置信息; 特征提取模块包括正向计算子模块和反向计算子模块,其中: 正向子模块包括输出固定的第一脉动线和权重固定的第二脉动线;其中,第一脉动线用于计算位置矩阵和嵌入矩阵的乘积以获取融合矩阵,第一脉动线包括第一拆分器、第一计算单元阵列和第一多路选择器;第二脉动线用于计算融合矩阵与融合截取矩阵的乘积以获取对称描述矩阵,第二脉动线包括第一多路分解器、第二计算单元阵列以及第一合并器;其中,融合截取矩阵由融合矩阵的前预设列数构成; 反向计算子模块包括缓存单元、权重固定的第三脉动线、输出固定的第四脉动线和求和单元;其中,缓存单元用于存储融合矩阵;第三脉动线用于计算融合截取矩阵与对称描述矩阵的导矩阵的乘积以获取第一矩阵,第三脉动线包括第二多路分解器、第三计算单元阵列以及第二合并器;第四脉动线用于计算对称描述矩阵的导矩阵与融合矩阵的乘积以获取第二矩阵,第四脉动线包括第二拆分器、第四计算单元阵列和第二多路选择器;求和单元用于将第一矩阵与第二矩阵对应列向量的元素相加以获取融合矩阵的导矩阵; 其中,输出固定表示脉动线将计算得到的矩阵拆分为尺寸固定的列向量输出,权重固定表示脉动线在计算时将参与计算的一个矩阵中的列向量或行向量固定为自身的权重; 目标模型用于处理对称描述矩阵以获取分子系统的分子势能和对称描述矩阵的导矩阵。
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