江苏沿江地区农业科学研究所周广飞获国家专利权
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龙图腾网获悉江苏沿江地区农业科学研究所申请的专利玉米穗腐病抗性显著相关SNP分子标记组合、及其筛选方法和应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116334285B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310281723.2,技术领域涉及:C12Q1/6895;该发明授权玉米穗腐病抗性显著相关SNP分子标记组合、及其筛选方法和应用是由周广飞;张舒钰;章慧敏;宋旭东;张振良;陆虎华;陈国清;郝德荣;冒宇翔;石明亮;薛林;黄小兰设计研发完成,并于2023-03-20向国家知识产权局提交的专利申请。
本玉米穗腐病抗性显著相关SNP分子标记组合、及其筛选方法和应用在说明书摘要公布了:本发明提供一种玉米穗腐病抗性显著相关SNP分子标记组合,包括SNP1~SNP69,其中:SNP1~SNP13、SNP14~SNP19、SNP20~SNP25、SNP26~SNP31、SNP32~SNP39、SNP40~SNP42、SNP43~SNP55、SNP56~SNP60、SNP61~SNP64和SNP65~SNP69分别位于玉米的第1染色体~第10染色体。还提供了相关筛选方法和应用。本发明的玉米穗腐病抗性显著相关SNP分子标记组合能够用于构建玉米穗腐病抗性全基因组选择数据模型,从而显著提高玉米穗腐病抗性预测准确性,进而提高育种效率,降低育种成本,适于大规模推广应用。
本发明授权玉米穗腐病抗性显著相关SNP分子标记组合、及其筛选方法和应用在权利要求书中公布了:1.玉米穗腐病抗性显著相关SNP分子标记组合在构建玉米穗腐病抗性全基因组选择数据模型中的应用,所述玉米穗腐病抗性显著相关SNP分子标记组合包括SNP1~SNP69,其中: 所述SNP1、所述SNP2、所述SNP3、所述SNP4、所述SNP5、所述SNP6、所述SNP7、所述SNP8、所述SNP9、所述SNP10、所述SNP11、所述SNP12和所述SNP13分别位于玉米的第1染色体的第43645851位碱基、第49802535位碱基、第59419876位碱基、第69429811位碱基、第81312482位碱基、第163156463位碱基、第183882633位碱基、第190231452位碱基、第197499264位碱基、第199720627位碱基、第199916785位碱基、第213511580位碱基和第278099674位碱基,所述第43645851位碱基为A或G,所述第49802535位碱基为A或G,所述第59419876位碱基为T或C,所述第69429811位碱基为T或G,所述第81312482位碱基为A或C,所述第163156463位碱基为A或G,所述第183882633位碱基为T或C,所述第190231452位碱基为T或C,所述第197499264位碱基为A或G,所述第199720627位碱基为A或G,所述第199916785位碱基为A或G,所述第213511580位碱基为T或C,所述第278099674位碱基为A或C; 所述SNP14、所述SNP15、所述SNP16、所述SNP17、所述SNP18和所述SNP19分别位于所述玉米的第2染色体的第6422884位碱基、第10149988位碱基、第40362374位碱基、第200079778位碱基、第206597745位碱基和第239867263位碱基,所述第6422884位碱基为T或G,所述第10149988位碱基为A或C,所述第40362374位碱基为C或G,所述第200079778位碱基为T或C,所述第206597745位碱基为T或C,所述第239867263位碱基为A或G; 所述SNP20、所述SNP21、所述SNP22、所述SNP23、所述SNP24和所述SNP25分别位于所述玉米的第3染色体的第629072位碱基、第16413990位碱基、第160126277位碱基、第185399398位碱基、第212721112位碱基和第225639028位碱基,所述第629072位碱基为T或C,所述第16413990位碱基为T或C,所述第160126277位碱基为T或C,所述第185399398位碱基为T或G,所述第212721112位碱基为A或G,所述第225639028位碱基为A或C; 所述SNP26、所述SNP27、所述SNP28、所述SNP29、所述SNP30和所述SNP31分别位于所述玉米的第4染色体的第80308919位碱基、第165573983位碱基、第166840292位碱基、第214745547位碱基、第216218588位碱基和第227982406位碱基,所述第80308919位碱基为A或C,所述第165573983位碱基为A或G,所述第166840292位碱基为T或C,所述第214745547位碱基为A或G,所述第216218588位碱基为A或G,所述第227982406位碱基为A或C; 所述SNP32、所述SNP33、所述SNP34、所述SNP35、所述SNP36、所述SNP37、所述SNP38和所述SNP39分别位于所述玉米的第5染色体的第2444523位碱基、第67326175位碱基、第118284375位碱基、第174142666位碱基、第184890420位碱基、第199518834位碱基、第221353359位碱基和第223581183位碱基,所述第2444523位碱基为T或C,所述第67326175位碱基为T或C,所述第118284375位碱基为T或G,所述第174142666位碱基为A或C,所述第184890420位碱基为A或G,所述第199518834位碱基为A或G,所述第221353359位碱基为T或C,所述第223581183位碱基为T或C; 所述SNP40、所述SNP41和所述SNP42分别位于所述玉米的第6染色体的第94243988位碱基、第159543194位碱基和第163565455位碱基,所述第94243988位碱基为T或C,所述第159543194位碱基为A或G,所述第163565455位碱基为T或G; 所述SNP43、所述SNP44、所述SNP45、所述SNP46、所述SNP47、所述SNP48、所述SNP49、所述SNP50、所述SNP51、所述SNP52、所述SNP53、所述SNP54和所述SNP55分别位于所述玉米的第7染色体的第9654032位碱基、第22231435位碱基、第23766644位碱基、第30366330位碱基、第41809741位碱基、第84902618位碱基、第103037600位碱基、第121214812位碱基、第位124925724碱基、第159951197位碱基、第162528814位碱基、第164524282位碱基和第180741651位碱基,所述第9654032位碱基为T或C,所述第22231435位碱基为T或C,所述第23766644位碱基为A或G,所述第30366330位碱基为T或C,所述第41809741位碱基为T或C,所述第84902618位碱基为T或G,所述第103037600位碱基为A或G,所述第121214812位碱基为T或C,所述第位124925724碱基为A或G,所述第159951197位碱基为T或G,所述第162528814位碱基为A或C,所述第164524282位碱基为T或G,所述第180741651位碱基为A或G; 所述SNP56、所述SNP57、所述SNP58、所述SNP59和所述SNP60分别位于所述玉米的第8染色体的第13775624位碱基、第80844720位碱基、第104001857位碱基、第139410361位碱基和第176473798位碱基,所述第13775624位碱基为A或G,所述第80844720位碱基为A或G,所述第104001857位碱基为T或C,所述第139410361位碱基为A或G,所述第176473798位碱基为A或G; 所述SNP61、所述SNP62、所述SNP63和所述SNP64分别位于所述玉米的第9染色体的第13707254位碱基、第22155950位碱基、第23991241位碱基和第112271967位碱基,所述第13707254位碱基为T或C,所述第22155950位碱基为T或C,所述第23991241位碱基为A或C,所述第112271967位碱基为A或G; 所述SNP65、所述SNP66、所述SNP67、所述SNP68和所述SNP69分别位于所述玉米的第10染色体的第10705997位碱基、第15723458位碱基、第122855713位碱基、第135749532位碱基和第137106570位碱基,所述第10705997位碱基为T或C,所述第15723458位碱基为T或C,所述第122855713位碱基为A或T,所述第135749532位碱基为T或C,所述第137106570位碱基为T或G; 所述SNP1~所述SNP69所在的染色体和位置均基于玉米自交系B73基因组v4版本确定; 将所述玉米穗腐病抗性显著相关SNP分子标记组合作为固定效应加入全基因组选择数据模型中从而构建玉米穗腐病抗性全基因组选择数据模型; 所述全基因组选择数据模型是采用R4.0.2软件的GAPIT包构建的gBLUP随机效应模型,所述gBLUP随机效应模型为:其中表示表型值,表示总体均值,表示元素为1的维向量,表示随机效应,表示与随机效应相关的的设计矩阵,表示个体数,表示分子标记数,表示剩余效应; 所述玉米穗腐病抗性全基因组选择数据模型是采用所述GAPIT包构建的gBLUP固定效应模型,所述gBLUP固定效应模型为:其中表示所述固定效应,表示与所述固定效应相关的设计矩阵,其余同所述gBLUP随机效应模型。
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