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龙图腾网获悉陕西瑞奇生物科技有限公司申请的专利一种基于计算机分子模拟技术进行多抗原表位合并重组的方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN115985383B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-10发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202211568114.7，技术领域涉及：G16B5/00；该发明授权一种基于计算机分子模拟技术进行多抗原表位合并重组的方法是由胡军设计研发完成，并于2022-12-07向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于计算机分子模拟技术进行多抗原表位合并重组的方法在说明书摘要公布了：本发明公开了一种基于计算机分子模拟技术进行多抗原表位肽重组制备的方法。本方法在对多个抗原表位进行合并重组时，要先对各单克隆抗体结合的关键氨基酸组合进行分析，然后在计算机分子模拟技术的指导下对需要重组的各单抗结合的关键氨基酸进行合并重组成成千上万条序列不同的多抗原表位肽；同时分析各单抗的可变区氨基酸序列，并通过计算机分子模拟技术对各单抗的可变区构建三维结构模型，最后用该模型对每条重组多抗原表位肽进行模拟结合，筛选出可能与每株单抗均结合良好的多抗原表位肽，进行生物学实验鉴定；通过生物学实验筛选出与每株单抗结合的亲和力、特异性均良好的多抗原表位肽进行疫苗制备、诊断产品生产或药物研发等后续工作。

本发明授权一种基于计算机分子模拟技术进行多抗原表位合并重组的方法在权利要求书中公布了：1.一种基于计算机分子模拟技术的多抗原表位合并重组的方法，其特征在于，该方法包括如下步骤： S1、确定要合并重组的单克隆抗体结合表位数，分析每株单克隆抗体结合表位的关键氨基酸组合； 所述S1中，分析每株单克隆抗体结合表位的关键氨基酸组合采用丙氨酸逐个扫描替换多肽中的氨基酸，然后合成丙氨酸替换肽，用ELISA阻断方法检测多肽中替换掉的氨基酸对多肽与单抗结合影响的大小；替换的氨基酸对多肽与抗体的结合影响大，说明被替换了的氨基酸在多肽与抗体的结合中发挥较大作用，是发挥重要作用的氨基酸，为关键氨基酸；否者为非关键氨基酸； S2、在计算机分子模拟技术指导下，对计划合并的抗原表位的全部关键氨基酸进行合并重组，重组成含多个单抗结合表位的多抗原表位肽； 所述S2中，通过计算机分子模拟技术、根据重组肽的大小不同、对各抗体结合的关键氨基酸随机重组出成千上万条多抗原表位肽，再基于多肽理化性质和几何片段相似性，进行排名； S3、调取单克隆抗体杂交瘤细胞株的mRNA，逆转录合成cDNA，分别扩增各单抗轻链可变区基因和重链可变区基因，得到单抗可变区氨基酸序列；通过计算机分子模拟技术构建单抗可变区三维结构模型； 所述S3中，通过计算机分子模拟技术构建单抗可变区三维结构模型方法为：在RCSBPDB蛋白质晶体数据库挑选出与各单抗氨基酸序列相似度较好的晶体蛋白，作为同源模建的模板，利用同源建模软件Modeller，构建各单抗可变区三维结构模型； S4、通过计算机分子模拟技术让每株单抗均与每条重组多抗原表位肽进行多肽-蛋白对接，模拟进行结合；将分子模拟结合得到的、重组多抗原表位肽与各单抗之间结合能量进行排名，筛选推荐可能与每株单抗均结合良好的重组多抗原表位肽序列； 所述S4中，利用UCSFChimera软件，构建各单抗靶抗原肽的三维结构；利用Rosetta软件，将各单抗分别与S2步骤所述的排名靠前的多抗原表位肽进行多肽-蛋白对接，筛选出与每株单抗均具有较好结合活性、排名靠前的多肽进行多肽合成和生物学验证； S5、对筛选推荐的多抗原表位肽进行多肽合成和生物学鉴定，以确定是否符合设计要求； 所述S5中，设计要求包括但不限于重组多抗原表位肽与每株单抗的结合活性、对抗体与靶抗原结合的阻断作用、与抗体结合的交叉反应性等设计目的所需要的生物学指标等实验室评价，筛选出评价结果较好、符合设计目的的多抗原表位肽进行进一步研究或应用。

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