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成都佩德生物医药有限公司赖仞获国家专利权

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龙图腾网获悉成都佩德生物医药有限公司申请的专利去除生信组装的氨基酸序列中前肽的方法及系统、存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116364187B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-03发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310316340.4,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权去除生信组装的氨基酸序列中前肽的方法及系统、存储介质是由赖仞;容明强;谷陟欣;黄森;李宗煦设计研发完成,并于2023-03-28向国家知识产权局提交的专利申请。

去除生信组装的氨基酸序列中前肽的方法及系统、存储介质在说明书摘要公布了:本发明公开一种除生信组装的氨基酸序列中前肽的方法及系统、存储介质,该方法涉及生物信息领域,尤其涉及转录组测序的数据挖掘,获取经过生物信息流程生成的多肽序列信息,将多肽序列信息进行分段比对得到符合预设要求的蛋白质文件;对得到的蛋白质文件进行数据清洗:根据得到的蛋白质文件筛选同源性最高的序列,并与多肽序列信息进行整合;根据蛋白质文件中目标蛋白的位置,确定多肽序列信息中保留部分;存储经过数据清洗后的信息。本发明提供的方法易操作、可批量化去除氨基酸序列中前肽,提供了标准分析流程,实现了自动、批量化处理多肽序列中的前肽,解决了当前转录组分析过程中天然活性多肽筛选困难、效率低下等问题,同时具有易于使用、学习成本低的优点。

本发明授权去除生信组装的氨基酸序列中前肽的方法及系统、存储介质在权利要求书中公布了:1.去除生信组装的氨基酸序列中前肽的方法,其特征在于:包括以下步骤: 步骤1获取经过生物信息流程生成的多肽序列信息,将多肽序列信息进行分段比对得到符合预设要求的蛋白质文件; 所述步骤1中蛋白质文件是按照以下方式得到的: 11将经过生物信息流程生成的多肽序列的fasta文件通过Blast算法依据选择的对比数据库将分段后的序列与比对数据库中的蛋白质序列比对,得到各分段的相似性信息; 12在比对数据库中查找相似k-mer序列,对于找到的每一条序列,计算相似性得分,输出每条结果的Evalue值; 13根据Evalue阈值输出对应的蛋白质文件,所述蛋白质文件中包括序列名称、匹配的目标蛋白名称、在目标蛋白中的位置、同源性、Evalue值中任一项或多项组合; 步骤2对得到的蛋白质文件进行数据清洗:根据得到的蛋白质文件筛选同源性最高的序列,并与多肽序列信息进行整合;根据蛋白质文件中目标蛋白的位置,确定多肽序列信息中保留部分; 所述步骤2中的数据清洗是按照以下方式进行的: 21将fasta序列文件转换为数据框格式的多肽序列文件; 22获取Blast算法比对的输出结果,并按同源性进行排序,保留同源性满足预设条件的多肽序列; 23将转化为数据框格式的多肽序列文件与筛选之后的多肽序列整合在一起; 24根据比对的结果中输入序列在目标蛋白中的位置,通过sub函数截掉其余部分,利用nchar函数计算保留部分的序列长度,并计算出保留部分中半胱氨酸个数以及半胱氨酸骨架; 步骤3存储经过数据清洗后的信息; 所述步骤3中输出的文本文件中包括sequenceID、Sequence、Evalue、半胱氨酸骨架、半胱氨酸个数中任一项或多项组合。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人成都佩德生物医药有限公司,其通讯地址为:610219 四川省成都市天府国际生物城(双流区生物城中路二段18号);或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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