中山大学田德朝获国家专利权
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龙图腾网获悉中山大学申请的专利用于单细胞Hi-C调控尺度染色质条带分析的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121617480B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-31发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202610147292.4,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权用于单细胞Hi-C调控尺度染色质条带分析的方法是由田德朝;李玲;廖文滔;高文静设计研发完成,并于2026-02-03向国家知识产权局提交的专利申请。
本用于单细胞Hi-C调控尺度染色质条带分析的方法在说明书摘要公布了:本发明涉及生物信息数据处理技术,为用于单细胞Hi‑C调控尺度染色质条带分析的方法,包括步骤:对单细胞Hi‑C数据进行预处理,生成伪批量Hi‑C数据;对伪批量Hi‑C数据归一化处理,以提取每个染色体的Hi‑C接触矩阵;从Hi‑C接触矩阵中识别检测伪批量条带;将伪批量条带投影到原始单细胞Hi‑C数据上,获得单细胞条带;在原始单细胞Hi‑C数据中对单细胞条带进行定量分析。本发明能够稳定识别具有明确端点和方向性的调控尺度染色质条带,并输出统计显著的条带集合。
本发明授权用于单细胞Hi-C调控尺度染色质条带分析的方法在权利要求书中公布了:1.一种用于单细胞Hi-C调控尺度染色质条带分析的方法,其特征在于,包括以下步骤: S1、对单细胞Hi-C数据进行预处理,生成伪批量Hi-C数据;对伪批量Hi-C数据归一化处理,以提取每个染色体的Hi-C接触矩阵; S2、从所提取的Hi-C接触矩阵中识别检测伪批量条带; S3、将伪批量条带投影到原始单细胞Hi-C数据上,获得单细胞条带;在原始单细胞Hi-C数据中对单细胞条带进行定量分析; 步骤S2包括: S21、通过预设窗口对Hi-C接触矩阵沿主对角线方向进行滑动切分,提取一系列窗口子矩阵; S22、对每个窗口子矩阵进行特征分解,将特征分解获得的特征值按绝对值大小进行降序排序,得到一组降序排序的特征向量;保留降序排序的特征向量中的前r个特征向量; S23、对每一个保留的特征向量,引入变点检测机制,识别沿基因组坐标发生显著变化的位置,以确定候选条带的端点位置,得到候选条带的端点列表; S24、根据候选条带的端点列表,选取相邻端点对,并根据相邻端点对确定候选条带在锚点处的宽度区间,再结合条带方向在候选条带的单侧搜索相邻端点对之外的第三个端点作为远端端点,根据远端端点确定候选条带的长度,从而依据相邻端点对和远端端点确定方向性候选条带矩形,以构建候选条带; S25、对候选条带进行统计检验得到显著条带;多条显著条带形成显著条带集合,并作为伪批量条带。
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