山东师范大学王红获国家专利权
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龙图腾网获悉山东师范大学申请的专利用于药物发现的分子生成方法、系统、介质及设备获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN121281695B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-31发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202511861180.7，技术领域涉及：G16C20/50；该发明授权用于药物发现的分子生成方法、系统、介质及设备是由王红;李仕平;胡涛;庄鲁贺;盛卸晃;梁成;郭菲;徐梓涵;赵云;仇士东;孙志峰;路岳设计研发完成，并于2025-12-11向国家知识产权局提交的专利申请。
本用于药物发现的分子生成方法、系统、介质及设备在说明书摘要公布了：本发明涉及计算机辅助药物设计技术领域，提供了用于药物发现的分子生成方法、系统、介质及设备，包括：获取配体的SMILES字符串和靶点蛋白质的氨基酸序列，分别提取配体特征向量和蛋白质特征向量，拼接融合后，通过多层感知机预测结合亲和力值；以蛋白质特征向量为条件，通过条件扩散模型的反向去噪过程生成新的分子潜在表征；其中，在反向去噪过程的每一步，对纯噪声进行图级读出操作，输入多层感知机预测亲和力值，将亲和力引导损失的梯度回传至噪声预测网络，指导新的分子生成朝向高亲和力区域；通过预训练的分子语言解码器将新的分子潜在表征解码为SMILES字符串。够快速产生具有高结合潜力的新颖分子结构。
本发明授权用于药物发现的分子生成方法、系统、介质及设备在权利要求书中公布了：1.一种用于药物发现的分子生成方法，其特征在于，包括： 获取配体的SMILES字符串和靶点蛋白质的氨基酸序列，通过双分支特征编码网络分别提取配体特征向量和蛋白质特征向量； 将配体特征向量和蛋白质特征向量进行拼接融合后，通过多层感知机预测结合亲和力值，基于结合亲和力值计算均方误差损失，对多层感知机进行训练优化； 以蛋白质特征向量为条件，通过条件扩散模型的反向去噪过程生成新的分子潜在表征；其中，在反向去噪过程的每一步，对纯噪声进行图级读出操作，将读出向量输入多层感知机预测亲和力值，计算预测亲和力值与真实值之间的均方误差作为亲和力引导损失，将亲和力引导损失的梯度回传至噪声预测网络，指导新的分子生成朝向高亲和力区域； 通过预训练的分子语言解码器将新的分子潜在表征解码为SMILES字符串。
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