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广州大学刘文斌获国家专利权

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龙图腾网获悉广州大学申请的专利融合GO功能注释与PPI网络信息的细胞浸润推断方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121075448B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-27发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511190160.1,技术领域涉及:G16B50/10;该发明授权融合GO功能注释与PPI网络信息的细胞浸润推断方法及系统是由刘文斌;易芊贝;叶正;方刚;陈智华;许鹏;石晓龙设计研发完成,并于2025-08-25向国家知识产权局提交的专利申请。

融合GO功能注释与PPI网络信息的细胞浸润推断方法及系统在说明书摘要公布了:本发明涉及一种融合GO功能注释与PPI网络信息的细胞浸润推断方法及系统,所述方法包括:收集基因表达数据,GO功能注释数据以及PPI网络数据;分别构建细胞×细胞功能关联网络和细胞×细胞物理相互作用网络;将二者进行加权融合处理,获得综合细胞关系网络;通过重启游走算法计算最终细胞浸润分数,根据所述最终细胞浸润分数推断得在肿瘤微环境中的浸润程度。本发明创新性地融合了GO功能注释信息与PPI网络数据,全面考虑细胞间的功能相似性与物理或信号相互作用,使模型既能从生物通路层面理解细胞协同性,又能从蛋白质互作层面解析细胞直接交互,避免单一视角的片面性,为肿瘤微环境分析提供更立体的认知框架。

本发明授权融合GO功能注释与PPI网络信息的细胞浸润推断方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种融合GO功能注释与PPI网络信息的细胞浸润推断方法,其特征在于,包括: S1:收集数据集,并进行预处理,其中,所述数据集包括基因表达数据,GO功能注释数据以及PPI网络数据; S2:根据基因表达数据和GO功能注释数据,构建细胞×细胞功能关联网络; S3:根据基因表达数据和PPI网络数据,构建细胞×细胞物理相互作用网络; S4:将所述细胞×细胞功能关联网络和细胞×细胞物理相互作用网络进行加权融合处理,获得综合细胞关系网络; S5:基于所述综合细胞关系网络,通过重启游走算法计算最终细胞浸润分数,根据所述最终细胞浸润分数推断得在肿瘤微环境中的浸润程度; 所述步骤S2,包括: S21:根据基因表达数据和GO功能注释数据,计算Jaccard系数和加权基因表达数据; S22:根据Jaccard系数和加权基因表达数据,计算关联综合权重;根据所述关联综合权重构建GO×细胞的二分网络; S23:根据所述关联综合权重和二分网络,构建细胞×细胞功能关联网络; 其中,所述细胞×细胞功能关联网络中的每个元素表示两个细胞类型之间的关联强度; 所述步骤S3,包括: S31:根据基因表达数据和PPI网络数据,计算基因表达与网络权重综合贡献值; S32:通过Floyd算法计算基因间最短路径距离;对基因间最短路径距离进行基因间距离稳定性修正; S33:根据所述基因表达与网络权重综合贡献值和基因间距离稳定性修正的结果,构建细胞×细胞物理相互作用网络。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人广州大学,其通讯地址为:510006 广东省广州市番禺区广州大学城外环西路230号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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