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北京诺禾致源科技股份有限公司康玲获国家专利权

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龙图腾网获悉北京诺禾致源科技股份有限公司申请的专利批量更新基因组组装和注释文件ID的方法和装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116230096B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-27发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211712048.6,技术领域涉及:G16B50/30;该发明授权批量更新基因组组装和注释文件ID的方法和装置是由康玲;周勋;彭珍;赵勇;王龙;陶琳娜;马策设计研发完成,并于2022-12-29向国家知识产权局提交的专利申请。

批量更新基因组组装和注释文件ID的方法和装置在说明书摘要公布了:本发明提供了一种批量更新基因组组装和注释文件ID的方法和装置。该方法包括:S1,使用mummer软件与已知的近源物种的参考基因组进行比对,将基因组的原ID更新为与参考基因组上染色体顺序及方向顺序一致的新ID;S2,利用预设的基因命名格式对各基因在相应染色体上的位置进行排序,从而获得各基因新ID的注释文件。本申请的方法批量更新方式简单快速、且更新后的ID格式统一,易于后续分析。

本发明授权批量更新基因组组装和注释文件ID的方法和装置在权利要求书中公布了:1.一种批量更新基因组组装和注释文件ID的方法,其特征在于,所述方法包括: S1,使用mummer软件与已知的近源物种的参考基因组进行比对, 将所述基因组上的染色体的原ID更新为与所述参考基因组上染色体顺序及方向顺序一致的新ID,获得染色体新ID与原ID的对应关系文件; 根据所述染色体新ID与原ID的对应关系文件,对所述基因组上各染色体的ID进行更新替换; 如果染色体的方向是反向的,则输出反向互补序列,如果是正向的,则序列则不做任何处理; S2,利用预设的基因命名格式对各基因在相应染色体上的位置进行排序,从而获得各基因新ID的注释文件; 预设注释文件中基因ID的命名格式; 根据各所述基因在染色体上的位置排序,获得各基因新ID与原ID的对应关系文件; 根据各所述基因新ID与原ID的对应关系文件,对注释文件中的原ID进行替换,从而获得具有各所述基因新ID的注释文件; 按如下顺序预设所述注释文件中基因ID的命名格式:物种拉丁名称简写、染色体ID以及基因在染色体上的位置排序; 根据各所述基因在染色体上的位置排序,获得基因新ID与原ID的对应关系文件包括:根据染色体的方向为正向还是反向, 若所述染色体为正向,则按照所述参考基因组上各基因的排序,顺序排列各基因原ID,并从小到大输出基因新ID与原ID的对应关系文件; 若所述染色体是反向,则按照所述参考基因组上各基因的排序,逆序排列各基因原ID,并从小到大排序输出基因新ID与原ID的对应关系文件。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人北京诺禾致源科技股份有限公司,其通讯地址为:102200 北京市昌平区回龙观镇生命园路29号创新大厦B258室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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