海南大学崔菲菲获国家专利权
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龙图腾网获悉海南大学申请的专利基于掩码机制可控长度的多肽序列生成方法及系统获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119339809B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-13发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202411369961.X，技术领域涉及：G16B40/20；该发明授权基于掩码机制可控长度的多肽序列生成方法及系统是由崔菲菲;罗振杰;耿奥运;张子龙设计研发完成，并于2024-09-29向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于掩码机制可控长度的多肽序列生成方法及系统在说明书摘要公布了：本发明涉及一种基于掩码机制可控长度的多肽序列生成方法及系统。所述方法包括：在多肽序列数据集中添加起始符、结束符、填充字符后输入至蛋白质语言ESM2模型中，提取多肽序列潜空间嵌入；基于扩散模型进行加噪，结合掩码机制训练去噪器预测未加噪潜空间嵌入；对潜空间嵌入进行加噪结合掩码机制训练引导模块，预测含噪潜空间嵌入的类别；计算得到不含噪数据，并对不含噪数据进行解码得到多肽序列。由于去噪器中使用了掩码机制，结合了蛋白质语言模型和扩散模型的优点，不仅可以达到控制生成的序列的长度，而且能够使扩散模型很好地契合蛋白质语言模型的特点，从而使扩散模型生成更符合蛋白质语言模型的潜空间嵌入。
本发明授权基于掩码机制可控长度的多肽序列生成方法及系统在权利要求书中公布了：1.一种基于掩码机制可控长度的多肽序列生成方法，其特征在于，所述方法包括： 从多肽数据库中收集多肽序列，并对所述多肽序列进行数据处理后划分为各个多肽序列数据集； 通过向量化文本工具对所述多肽序列数据集进行编码，并添加起始符、结束符、填充字符；将添加字符后的多肽序列数据集输入至蛋白质语言ESM2模型中，提取多肽序列潜空间嵌入； 基于扩散模型对所述潜空间嵌入进行加噪，基于加噪后的潜空间嵌入结合掩码机制训练去噪器，并通过所述去噪器预测未加噪潜空间嵌入，计算预测的未加噪潜空间嵌入与实际未加噪潜空间嵌入之间的均方差损失； 对所述潜空间嵌入进行加噪，基于加噪后的潜空间嵌入结合掩码机制训练引导模块，并通过所述引导模块预测含噪潜空间嵌入的类别，计算预测类别与实际类别之间的交叉熵损失； 基于所述均方差损失、所述交叉熵损失得到不含噪数据，并对所述不含噪数据进行解码得到多肽序列。
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2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
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