天津金匙医学科技有限公司饶冠华获国家专利权
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龙图腾网获悉天津金匙医学科技有限公司申请的专利一种耐药基因物种归属预测的模型构建方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116631501B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-13发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310625501.8,技术领域涉及:G16B15/30;该发明授权一种耐药基因物种归属预测的模型构建方法是由饶冠华;韩朋;高建鹏;陈方媛;蒋智设计研发完成,并于2021-12-30向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种耐药基因物种归属预测的模型构建方法在说明书摘要公布了:本申请涉及生物信息学技术领域,具体涉及一种基于基因测序reads比对的用于检测鉴定耐药基因和预测耐药表型的模型构建方法。本发明结合耐药表型相关重要特征基因,构建实现基于测序read序列直接进行目标病原细菌及其携带的耐药基因的比对检测鉴定,以及耐药表型的预测。
本发明授权一种耐药基因物种归属预测的模型构建方法在权利要求书中公布了:1.一种耐药基因物种归属预测的模型构建方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤: 步骤1:目标病原菌种基因组序列比对及检出序列数、基因组覆盖度和覆盖深度计算; 步骤2:基于BGWAS模型训练集标本耐药基因检出结果,统计目标病原菌种携带的耐药基因拷贝数; 步骤3:基于假定的基因-物种归属关系,进行耐药基因拷贝数计算及物种归属判断: 假定耐药基因-物种对应关系时,依据:a、数据库中参考基因的物种注释是否包含目标物种,如果包含则先接受该基因-物种归属关系的假设;b、如果a不满足,则查看数据库中参考基因的介导方式注释,是否包含质粒介导方式,如果包含则先接受该基因-物种归属关系的假设;c、如果a、b不满足,则根据ARG-likereads的物种注释进行推测其物种来源,并按如下公式计算耐药基因的拷贝数: 如果计算得到的耐药基因拷贝数,落在基于BGWAS模型训练集统计得到的目标基因家族的正常拷贝数范围内,则接受此上述假定的基因-物种归属关系,否则拒绝。
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