青岛极智医学检验实验室有限公司焦成智获国家专利权
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龙图腾网获悉青岛极智医学检验实验室有限公司申请的专利一种杂交种表型的预测方法、设备、介质及程序产品获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118609651B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-03发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410944688.2,技术领域涉及:G16B25/00;该发明授权一种杂交种表型的预测方法、设备、介质及程序产品是由焦成智;顾菊;陶琳娜;荆鑫;王天义设计研发完成,并于2024-07-15向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种杂交种表型的预测方法、设备、介质及程序产品在说明书摘要公布了:本申请提供一种杂交种表型的预测方法、设备、介质及程序产品,涉及育种技术领域,包括:获取待测对象的子代在多个位点上的基因型数据;将待测对象的子代在多个位点上的基因型数据输入给目标表型预测模型,得到待测对象的预测表型数据;其中,目标表型预测模型是非参数预测模型、参数预测模型和半参数预测模型中预测准确度最高的模型,预测模型的训练过程中对训练数据进行针对性的处理,本申请中的目标表型预测模型能够更加准确的对待测对象的表型数据进行预测。
本发明授权一种杂交种表型的预测方法、设备、介质及程序产品在权利要求书中公布了:1.一种杂交种表型的预测方法,其特征在于,包括: 获取待测对象的子代在多个位点上的基因型数据; 将所述待测对象的子代在多个位点上的基因型数据输入给目标表型预测模型,得到所述待测对象的预测表型数据; 其中,所述目标表型预测模型是非参数预测模型、参数预测模型和半参数预测模型中选择的预测准确度最高的模型; 所述非参数预测模型通过第一子代基因型数据矩阵和对应的第一表型数据训练得到,所述第一子代基因型数据矩阵表征多个子代在多个位点上的基因型数据; 所述参数预测模型由第二子代基因型数据矩阵和第二表型数据训练得到,所述第二子代基因型数据矩阵基于所述第一子代基因型数据矩阵与显性矩阵得到,所述显性矩阵为根据同一基因座上不同等位基因之间的互作关系所组成的矩阵; 所述半参数预测模型由第三子代基因型数据矩阵和第三表型数据训练得到,所述第三子代基因型数据矩阵基于所述第一子代基因型数据矩阵与欧氏距离得到,所述欧氏距离表征任意两个子代多个位点上基因数据的相似度; 所述第一子代基因型数据矩阵通过以下方式确定: 获取第四子代基因型数据矩阵; 获取第四子代基因型数据矩阵上各个位点上基因型数据与第四表型数据的相关性;将相关性低于预设阈值的基因型数据所在的位点删除,得到第一子代基因型数据矩阵;相关性表征位点上基因型数据与表型数据相关性大小,与表型数据相关性越大,相关性越大,与表型数据相关性越小,相关性越小;针对不同的预测模型,选用不同的过滤特征方法进行位点删除; 其中,针对参数预测模型选择F检验法进行位点删除、针对半参数预测模型选择互信息法进行位点删除以及针对非参数预测模型选择包裹法进行位点删除; 所述方法还包括:对待测对象的子代在多个位点上的基因型数据进行预处理,如果目标表型预测模型为参数预测模型,预处理包括对待测对象的子代在多个位点上的基因型数据进行筛选、将待测对象的子代在多个位点上的基因型数据与显性矩阵结合;如果目标表型预测模型为半参数预测模型,预处理包对测试基因型数据矩阵进行筛选、将待测对象的子代在多个位点上的基因型数据进行欧氏距离计算和替换;如果目标表型预测模型为非参数预测模型,预处理包括对测试基因型数据矩阵进行筛选; 所述第二表型数据、第三表型数据与第一表型数据一致。
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