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青海大学田洁获国家专利权

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龙图腾网获悉青海大学申请的专利一种基于转录组和代谢组筛选大蒜果聚糖逆境响应关键酶基因和代谢物的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN113113084B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-03发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202010021897.1,技术领域涉及:G16B25/10;该发明授权一种基于转录组和代谢组筛选大蒜果聚糖逆境响应关键酶基因和代谢物的方法是由田洁;边海燕;钟启文;杨世鹏;王丽慧设计研发完成,并于2020-01-09向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于转录组和代谢组筛选大蒜果聚糖逆境响应关键酶基因和代谢物的方法在说明书摘要公布了:本发明公开一种基于转录组和代谢组筛选大蒜果聚糖逆境响应关键酶基因和代谢物的方法,本发明通过转录组和代谢组联合分析的方法,将转录组测得的果聚糖相关的差异表达基因与代谢组测得的果聚糖相关代谢变化明显的物质进行联合分析,可以构建基因‑代谢物网络互作图,更好地解析基因和代谢物的关系。

本发明授权一种基于转录组和代谢组筛选大蒜果聚糖逆境响应关键酶基因和代谢物的方法在权利要求书中公布了:1.一种基于转录组和代谢组筛选大蒜果聚糖逆境响应关键酶基因和代谢物的方法,其特征在于,通过转录组筛选出大蒜果聚糖响应逆境后差异表达的关键基因,通过代谢组筛选大蒜果聚糖逆境响应相关代谢物,最后构建基因--代谢物相关性网络图,筛选出大蒜果聚糖逆境响应关键酶基因和代谢物;具体步骤如下: 1转录组测序获得果聚糖逆境响应关键酶基因 采用TRNzol法,分别提取逆境响应前后的大蒜样品的总RNA,纯化后作为试验模板进行转录组文库的构建,将构建的文库进行IlluminaHiSeq测序,转录组数据采用两倍的差异值作为表达差异显著性,即p-value|log2FoldChange|=1,且FDR0.05,进行筛选逆境响应前后的的差异unigene,基于KEGG数据库筛选得到大蒜逆境响应涉及的差异表达基因及通路; 2代谢组测序获得逆境响应的糖类差异代谢物 将逆境响应前后的大蒜样品真空冷冻干燥,研磨至粉末状,置于提取液中溶解和过滤处理后,使用超高效液相色谱和串联质谱系统进行数据采集分析;基于数据库MWDB及代谢物信息公共数据库进行代谢物定性分析;利用三重四级杆质谱的多反应监测模式完成定量分析;在对所检测到的代谢物进行定性和定量分析后,比较逆境响应前后代谢物定量信息发生的差异倍数变化,结合单变量分析的差异倍数值,差异倍数值≥2和差异倍数值≤0.5来筛选出差异代谢物; 3转录组和代谢组联合分析 将步骤2获得的差异代谢物进行KEGG通路数据库映射,选择步骤1获得的与果聚糖相关的差异表达基因和步骤2代谢组测得的与果聚糖相关的差异代谢物,选出基因和代谢物相关系数,即皮尔森系数大于0.8的进行联合分析,并用R语言构建互作网络图,即获得大蒜果聚糖逆境响应关键酶基因和代谢物。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人青海大学,其通讯地址为:810016 青海省西宁市城北区宁大路251号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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