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华南农业大学张亚锋获国家专利权

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龙图腾网获悉华南农业大学申请的专利一种植物细胞器RNA末端的分析方法及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120700117B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510815072.X,技术领域涉及:C12Q1/6869;该发明授权一种植物细胞器RNA末端的分析方法及其应用是由张亚锋;陆秀超;陈林渠;林周;欧先艳;钱紫薇设计研发完成,并于2025-06-17向国家知识产权局提交的专利申请。

一种植物细胞器RNA末端的分析方法及其应用在说明书摘要公布了:本发明涉及分子生物学实验技术领域,尤其涉及一种植物细胞器RNA末端的分析方法及其应用。本发明提供了一种植物细胞器RNA末端的分析方法,包括如下步骤:对RNA进行5′多聚磷酸酶处理、体外环化,然后进行双端测序,过滤,得到清洁读长;MeCi算法对鉴定清洁读长进行鉴定;根据鉴定结果以及清洁读长数量判断RNA5′和3′末端位置、末端类型、mRNA和ncRNA的末端位置以及mRNA和ncRNA的5′末端类型。该方法不仅分析细胞器RNA末端修饰以及细胞器RNApolyA长度和来源,还可以用于筛选参与植物细胞器RNA末端加工和稳定的RNase和RBP的底物RNA。

本发明授权一种植物细胞器RNA末端的分析方法及其应用在权利要求书中公布了:1.一种植物细胞器RNA末端的分析方法,其特征在于,包括如下步骤: 1使用RNA5′多聚磷酸酶处理RNA,得到处理后的RNA; 2将处理后的RNA进行体外环化,得到体外环化RNA; 3对体外环化RNA进行测序,得到初始读长;对初始读长进行过滤,得到清洁读长; 4将清洁读长进行拼接,得到拼接读长以及未拼接读长;将拼接读长以及未拼接读长进行合并,得到合并读长; 5根据参考基因组确定重构基因组; 6使用MeCi检测合并读长的体外环化RNA衔接点; 7将体外环化RNA衔接点分别比对参考基因组和重构基因组,得到参考基因组比对的衔接点位置的位置和重构基因组比对的衔接点位置;再将重构基因组比对的衔接点位置转换成参考基因组的位置,并与参考基因组的数据进行合并,得到体外环化RNA衔接点的位置; 8对体外环化RNA衔接点进行筛选,得到高可信度RNA体外环化衔接点并确定其位置;根据高可信度RNA体外环化衔接点的位置判断对应RNA分子的5′和3′末端的位置,并推测RNA分子全长; 9根据含有高可信度RNA体外环化衔接点的RNA分子进行聚类,得到5′和3′末端丰度和读长数量; 10根据清洁读长数量以及5′和3′末端读长数量判断RNA的5′末端类型; 11根据清洁读长数量、5′和3′末端读长数量以及参考基因组的注释信息判断mRNA和ncRNA的末端位置; 12对RNA的5′末端类型进行聚类,得到RNA的5′末端类型的累计丰度;根据RNA的5′末端类型的累计丰度判断mRNA和ncRNA的末端类型; 步骤4中,所述未拼接读长包括未拼接的3′端读长的反向互补序列和未拼接的5′端读长。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人华南农业大学,其通讯地址为:510642 广东省广州市天河区五山路华南农业大学农学院905室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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