河南省农业科学院动物免疫学重点实验室王方雨获国家专利权
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龙图腾网获悉河南省农业科学院动物免疫学重点实验室申请的专利基于结构的肽配基与靶蛋白平衡解离常数评估模型获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115331729B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210993384.6,技术领域涉及:G16B5/00;该发明授权基于结构的肽配基与靶蛋白平衡解离常数评估模型是由王方雨;冯华;张改平;孙雪峰;邢广旭;焦文强设计研发完成,并于2022-08-18向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于结构的肽配基与靶蛋白平衡解离常数评估模型在说明书摘要公布了:本发明提供一种基于结构的针对肽配基分子与靶蛋白的平衡解离常数评估模型,包括:肽配基平衡解离常数数据的获取;肽配基与其受体蛋白相互作用关系特征数据获取;用于算法系统构建的数据集:靶向IgG系列多肽特征库和靶向αβ42系列多肽特征库的构建,独立验证数据集的构建;使用靶向IgG系列多肽特征库构建机器学习算法分类器系统,优化相关参数并用靶向αβ42系列多肽特征库进行测试并评估系统性能;使用构建的相关独立数据集对系统实际预测性能进行评估。本发明利用虚拟筛选的方法对肽配基与靶标蛋白相互作用区域进行研究,将进一步提高药物筛选效率并降低相应成本。
本发明授权基于结构的肽配基与靶蛋白平衡解离常数评估模型在权利要求书中公布了:1.基于结构的肽配基与靶蛋白平衡解离常数评估模型,其特征在于,该评估模型的构建包括以下步骤: 1肽配基与其受体蛋白相互作用关系特征数据获取:以特定蛋白质为研究对象,设计系列肽配基分子,进行肽配基与靶蛋白的分子对接运算,获取肽配基与蛋白结合的特征信息; 2肽配基平衡解离常数数据的获取:借助ELISA和SPR技术测定肽配基与靶蛋白相互作用的平衡解离常数; 3算法系统数据集和独立验证数据集的构建;所述算法系统数据集包括靶向IgG系列多肽特征库和靶向αβ42系列多肽特征库; 根据肽配基平衡解离常数实验可验证性和平衡解离常数的特征数据信息,构建数据集,以此构建靶向IgG系列多肽特征库和靶向αβ42系列多肽特征库,将所述数据集导入机器学习算法构建系统; 4使用靶向IgG系列多肽特征库构建机器学习算法分类器系统,筛选重要特征数据,优化相关参数用靶向αβ42系列多肽特征库进行测试,并评估系统性能; 选择靶向IgG系列多肽特征库中的四个对应的重要特征,按照重要性大小分别选择4、3、2个特征对机器学习系统进行训练,每个系统均建立500个分支;为了防止系统过度拟合,每个分类系统分别进行10次10则交叉验证,并对机器学习算法中每个分支节点上的特征数进行优化; 5使用构建的独立验证数据集对系统实际预测性能进行评估; 以猪流行性腹泻病毒Spike蛋白为研究对象,收集肽配基平衡解离常数类别信息和平衡解离常数的特征数据信息,构建独立数据集,用于优化系统的验证测试。
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