北京诺禾致源科技股份有限公司刘巧获国家专利权
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龙图腾网获悉北京诺禾致源科技股份有限公司申请的专利搜库软件在靶向蛋白组学分析中的应用及分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116434829B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-17发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310450101.8,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权搜库软件在靶向蛋白组学分析中的应用及分析方法是由刘巧;余文祥;周梦妍;赵亚丽;孙修美设计研发完成,并于2023-04-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本搜库软件在靶向蛋白组学分析中的应用及分析方法在说明书摘要公布了:本发明涉及蛋白组学分析技术领域,尤其是涉及搜库软件在靶向蛋白组学分析中的应用及分析方法。本发明提出了一种基于搜库软件的靶向蛋白组学数据处理方法,通过使用搜库软件处理PRM的质谱图数据,实现了只需要导入PRM质谱图数据,设置搜库参数即可自动化运行,最后得到准确可靠的定性定量结果。该方法运行过程中无需人工干预,减少人为误差,弥补了Skyline处理靶向蛋白组学数据中存在的问题,并且搜库软件自动化处理得到的结果在准确性方面也优于Skyline分析。
本发明授权搜库软件在靶向蛋白组学分析中的应用及分析方法在权利要求书中公布了:1. 靶向蛋白组学分析方法,其特征在于,所述分析方法包括,蛋白样品酶解后的多肽溶液经液相色谱串联质谱分析得到质谱图raw文件;所述质谱采集模式为Full MS‑PRM,所述质谱图raw文件包括一级全扫描质谱图和二级PRM质谱图;基于蛋白质组数据库,使用搜库软件对质谱图raw文件进行分析,得到搜库结果,并从搜库结果中挑选出目标蛋白的定性和或定量结果; 所述一级全扫描质谱图的获取参数包括: a正离子模式下,bOrbitrap分辨率大于10000,c扫描范围为100~2000 mz,d自动增益控制目标大于8e3;e10~30 ms的前体离子累积时间进行一级质谱图的扫描; 所述二级PRM质谱图的获取参数包括: a正离子模式下,采用高能诱导裂解方式裂解,bOrbitrap分辨率大于10000,c默认电荷状态大于1,d80~150ms的离子累积时间,e循环次数大于20次,f隔离窗口1~3mz,g碎裂能25~40; 所述一级全扫描质谱图和二级PRM质谱图同时采集获得; 所述搜库软件选自Proteomic Discoverer或MaxQuant; 所述搜库软件Proteomic Discoverer的搜库参数为: peptide tolerance:10ppm;MSMS tolerance 0.02Da;可变修饰:蛋氨酸上的Oxidation+15.995Da ,N‑末端的Acetyl+42.011Da;固定修饰为半胱氨酸上的Carbamidomethyl+57.021Da;Enzyme:Trypsin;Miss Cleavage:2; 所述搜库软件MaxQuant的搜库参数为: Main search peptide tolerance: 4.5 ppm;可变修饰:N‑末端的Acetyl+42.011Da; 固定修饰为半胱氨酸上的Carbamidomethyl+57.021Da;Enzyme:Trypsin;Miss Cleavage: 2。
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