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龙图腾网获悉上海交通大学申请的专利一种生物信息分析流程自动化构建系统获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN121148496B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-10发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202511322142.4，技术领域涉及：G16B50/00；该发明授权一种生物信息分析流程自动化构建系统是由韦建文;王星泽;李琛;张仪方;林新华设计研发完成，并于2025-09-16向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种生物信息分析流程自动化构建系统在说明书摘要公布了：本发明公开一种生物信息分析流程自动化构建系统，包括：意图理解与语义解析模块，将用户输入的自然语言文本，解析成符合生物信息分析任务要求的结构化任务描述；知识图谱与检索模块，负责构建生物信息学领域专用知识图谱，以提供知识检索与推荐服务；流程生成核心模块，接收结构化任务描述，主动关联知识图谱与检索模块以补充领域大模型，生成生物信息分析目标流程语言代码；执行与监控模块，保障目标流程语言代码的工作流执行、全生命周期状态监控、实时故障诊断及智能自愈决策。本发明系统能从用户自然语言需求直接生成可执行分析流程，执行前借知识图谱校验工具兼容性与参数有效性，大幅降低用户编程能力依赖，提升流程运行可靠性。

本发明授权一种生物信息分析流程自动化构建系统在权利要求书中公布了：1.一种生物信息分析流程自动化构建系统，其特征在于，包括： 意图理解与语义解析模块，用于将用户输入的自然语言文本解析为满足生物信息分析任务要求的结构化任务描述； 知识图谱与检索模块，用于构建生物信息学领域专用的知识图谱，为意图理解与语义解析模块和流程生成核心模块提供知识检索与推荐服务； 流程生成核心模块，用于接收意图理解与语义解析模块输出的结构化任务描述，并主动链接知识图谱与检索模块作为领域大模型补充，生成经过优化与验证的生物信息分析目标流程语言代码； 执行与监控模块，用于确保目标流程语言代码的工作流执行、全生命周期状态监控、实时故障诊断以及智能自愈决策，还用于结合生物信息分析的工具特性、数据特征及故障类型，构建生物信息学领域专属的执行管控与异常处理体系，确保生物信息分析流程稳定运行且分析结果符合质量要求； 所述流程生成核心模块以领域大模型为基础，包括流程规划与中间表示生成子模块、生物信息流程优化与定制子模块以及编译与多目标优化子模块； 所述流程规划与中间表示生成子模块，接收结构化任务描述，并通过检索知识图谱获取相关的工具链信息、兼容性规则以及历史流程模板，生成一个工具无关的高级流程蓝图；所述高级流程蓝图中包含数据流的逻辑关系，并根据任务目标自动确定所需分析环节； 所述生物信息学流程优化与定制子模块，通过领域大模型根据高级流程蓝图中的生物特征与分析目标对工作流中间表示IR进行深度定制与优化，生成标准化的工作流中间表示IR； 所述编译与多目标优化子模块，接收标准化的工作流中间表示IR，将其编译成多个在工具选择或参数配置上有差异的流程语言代码，并在编译完成后，启动深度静态验证与优化过程，生成生物信息分析目标流程语言代码； 在所述流程规划与中间表示生成子模块中，通过“生物数据类型-分析目标”联合驱动的流程模板自适应机制，生成高级流程蓝图； 所述生物信息学流程优化与定制子模块通过数据规模智能适配、物种特异性适配、用户个性化分析需求支持以及生物版本控制与可复现性保障，对工作流中间表示IR进行深度定制与优化进行深度定制与优化，生成标准化的工作流中间表示IR。

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