北京安百胜诊断科技有限公司;天津市同因生物科技有限公司王贻杰获国家专利权
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龙图腾网获悉北京安百胜诊断科技有限公司;天津市同因生物科技有限公司申请的专利基于迭代最近点的抗原抗体结合构象优化方法与装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120913633B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511429424.4,技术领域涉及:G16B15/30;该发明授权基于迭代最近点的抗原抗体结合构象优化方法与装置是由王贻杰;刘强;李旋;罗绍柳;窦东梅;刘亚宁;孟欣儒设计研发完成,并于2025-10-09向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于迭代最近点的抗原抗体结合构象优化方法与装置在说明书摘要公布了:本公开的实施例公开了基于迭代最近点的抗原抗体结合构象优化方法与装置。该方法的一具体实施方式包括:得到粗粒化抗体文件和粗粒化抗原文件;对抗原结构文件和抗体结构文件进行表面残基提取,得到抗原表面残基信息集和抗体表面残基信息集;生成抗体结合区域残基列表;生成表位模型;对抗原表面残基信息集和表位模型进行空间匹配,得到匹配后表位模型;生成抗体对接构象集合;对抗体对接构象集合中的各个抗体对接构象进行局部优化,得到优化后抗体构象集合;对优化后抗体构象集合中的各个优化后抗体构象进行筛选,得到目标抗原抗体结合构象。该实施方式可以提高抗体构象的准确度。
本发明授权基于迭代最近点的抗原抗体结合构象优化方法与装置在权利要求书中公布了:1.一种基于迭代最近点的抗原抗体结合构象优化方法,其特征在于,包括: 对抗原结构文件和抗体结构文件进行粗粒化处理,得到粗粒化抗体文件和粗粒化抗原文件; 基于所述粗粒化抗体文件和所述粗粒化抗原文件,对所述抗原结构文件和所述抗体结构文件进行表面残基提取,得到抗原表面残基信息集和抗体表面残基信息集; 根据所述抗体表面残基信息集,生成抗体结合区域残基列表; 基于所述抗体结合区域残基列表,生成表位模型; 对所述抗原表面残基信息集和所述表位模型进行空间匹配,得到匹配后表位模型; 根据所述匹配后表位模型,生成抗体对接构象集合; 利用所述粗粒化抗原文件,对所述抗体对接构象集合中的各个抗体对接构象进行局部优化,得到优化后抗体构象集合; 根据所述粗粒化抗原文件,对所述优化后抗体构象集合中的各个优化后抗体构象进行筛选,得到目标抗原抗体结合构象; 其中,所述根据所述匹配后表位模型,生成抗体对接构象集合,包括: 按照预设旋转角度组,对所述匹配后表位模型进行整体旋转和平移操作,得到旋转构象集合; 以抗原表面残基信息集为对齐目标,对旋转构象集合进行迭代最近点空间匹配,得到迭代后表位模型集合; 从所述迭代后表位模型集合中排序筛选出迭代后表位模型,以及将选出的迭代后表位模型中的各个表位候选点作为表位定位点组,得到表位定位点组集合; 将所述表位模型与所述表位定位点组集合中的每个表位定位点组进行对齐,得到对齐后旋转矩阵和对齐后平移向量,以及将每个对齐后旋转矩阵和每个对齐后平移向量应用于所述粗粒化抗体文件以生成抗体对接构象,得到抗体对接构象集合。
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