湖南中医药大学严承获国家专利权
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龙图腾网获悉湖南中医药大学申请的专利基于图神经网络和多重注意力机制药物相互作用预测方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119560178B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411264351.3,技术领域涉及:G16H70/40;该发明授权基于图神经网络和多重注意力机制药物相互作用预测方法及系统是由严承;侯超设计研发完成,并于2024-09-10向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于图神经网络和多重注意力机制药物相互作用预测方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于图神经网络和多重注意力机制药物相互作用预测方法及系统。该方法包括:将药物对的SMILES序列转化为图数据,利用多层GIN操作,得到药物对的嵌入矩阵;通过自注意力机制编码器从药物的嵌入矩阵中提取药物对的自注意力特征矩阵,计算药物对的余弦相似度矩阵,经过拉平操作以后获得药物对的自注意力特征向量;通过交互注意力机制编码器处理药物对的嵌入矩阵,获取具有交互注意力系数特征矩阵,分别对两种药物的交互注意力系数特征矩阵进行平均池化操作后再进行标准化,再得到药物对的交互特征向量;将药物对的自注意力特征向量和交互特征向量进行拼接操作,输入多层感知机预测药物对之间的相互作用。本发明可更好地预测药物之间的相互作用。
本发明授权基于图神经网络和多重注意力机制药物相互作用预测方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于图神经网络和多重注意力机制药物相互作用预测方法,其特征在于,包括以下步骤: 将药物对的SMILES序列转化为图数据,利用多层GIN操作,得到药物对的嵌入矩阵; 通过自注意力机制编码器从药物的嵌入矩阵中提取药物对的自注意力特征矩阵;计算药物对的余弦相似度矩阵,经过拉平操作以后获得药物对的自注意力特征向量,计算公式如下: 其中,当药物对的特征嵌入矩阵分别为和时,对于特征嵌入矩阵和,其中是药物1的第i个的代表向量,是药物2的第j个代表向量,为药物对的自注意力特征向量,为药物对的余弦相似度矩阵; 通过交互注意力机制编码器处理药物对的嵌入矩阵,获取具有交互注意力系数特征矩阵;分别对两种药物的交互注意力系数特征矩阵进行平均池化操作后再进行标准化,再得到药物对的交互特征向量,包括以下步骤: 对经过交互注意力机制处理的得到的交互注意力系数特征矩阵和,分别进行平均池化操作后再进行标准化操作,首先计算均值1,2,计算公式如下: 计算药物对分别的均值和标准差:mean1,std1,mean2以及std2,计算公式如下: 最后标准化后得到药物对的交互特征向量inter1,inter2,其计算公式如下: 其中,inter1之间和inter2之间表示不同药物的相互作用向量表示;mean1和mean2分别表示和的平均值;std1和std2分别表示和的标准差; 将药物对的自注意力特征向量和交互特征向量进行拼接操作,输入多层感知机预测药物对之间的相互作用。
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