杭州碳硅智慧科技发展有限公司曾浩获国家专利权
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龙图腾网获悉杭州碳硅智慧科技发展有限公司申请的专利一种自动化的分子设计方法及装置获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN117133378B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-10发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310975218.8，技术领域涉及：G16C20/50；该发明授权一种自动化的分子设计方法及装置是由曾浩;杨卓;鲍灵杰;宋剑飞;邓亚峰;施慧设计研发完成，并于2023-08-03向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种自动化的分子设计方法及装置在说明书摘要公布了：本申请实施例提供了一种自动化的分子设计方法及装置。所述方法包括：获取待筛选分子；将所述待筛选分子与蛋白质靶点进行对接处理，得到复合物构象；对所述复合物构象进行3D自动筛选处理，得到候选分子。本申请实施例可以高效地设计选中靶点潜在的活性分子。
本发明授权一种自动化的分子设计方法及装置在权利要求书中公布了：1.一种自动化的分子设计方法，其特征在于，所述方法包括： 获取待筛选分子； 所述待筛选分子为基于分子生成方案执行分子生成算法获取； 所述分子生成方案包括：R-基生成、侧链生成、linker生成、骨架跃迁和从头生成中的至少一种；所述R-基生成、侧链生成、linker生成和骨架跃迁为基于特定子结构的分子生成，所述R-基生成指定生长位点，所述侧链生成不指定具体的生长位点； 所述分子生成算法基于蛋白质结晶数据中的结合口袋信息和或活性分子数据进行实时微调训练得到； 将所述待筛选分子与蛋白质靶点进行对接处理，得到复合物构象； 对所述复合物构象进行3D自动筛选处理，得到候选分子； 所述3D自动筛选处理包括：将所述蛋白质靶点的已知活性分子作为参考分子，计算所述参考分子的特定子结构与所述待筛选分子的特定子结构在与蛋白质靶点结合时的空间位置叠合程度； 将所述待筛选分子与蛋白质靶点进行对接处理前，对所述待筛选分子进行自动化属性筛选；所述属性筛选条件包括：分子量、拓扑极性表面积、脂溶性、水溶性、PAINS、Alerts和可合成性中的至少一种。
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