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龙图腾网获悉河南省水产科学研究院申请的专利一种基于全基因组选择的鲤鱼少肌间骨品系的选育方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN116825190B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-10发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310824051.5，技术领域涉及：G16B20/30；该发明授权一种基于全基因组选择的鲤鱼少肌间骨品系的选育方法是由王延晖;吕军;王冰柯;李泓;冯建新设计研发完成，并于2023-07-06向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于全基因组选择的鲤鱼少肌间骨品系的选育方法在说明书摘要公布了：本发明属于水产遗传育种技术领域，具体涉及一种基于全基因组选择的鲤鱼少肌间骨品系的选育方法。本申请通过测定鲤鱼肌间骨数量建立参考群体、建立候选群体，然后对参考群体和候选群体进行全基因组重测序，获得高质量SNP分型结果；根据高质量SNP分型结果估计目标性状的遗传参数，进一步估算候选群体基因组育种值GEBV，根据GEBV值挑选候选个体作为亲鱼，进行少刺子一代苗种的繁育。实现了在不杀鱼的情况下，仅通过基因测序计算GEBV值就能实现少刺良种的培育的目的。本发明开发一套适用于鲤鱼肌间骨数量性状改良的基因组选择方案，操作清晰，可为鲤鱼少刺良种培育提供一种新的分子标记辅助育种技术。

本发明授权一种基于全基因组选择的鲤鱼少肌间骨品系的选育方法在权利要求书中公布了：1.一种基于全基因组选择的鲤鱼少肌间骨品系的选育方法，其特征在于，步骤如下： 1选取不少于500尾鲤鱼作为测定肌间骨数量性状的鲤鱼群体，打入PIT电子标记，并剪取鳍条置于无水乙醇保存，然后制作鲤鱼群体的肌间骨标本，测定肌间骨标本的肌间骨总数及各部位肌间骨数量作为表型，对已测表型的鲤鱼群体进行分析，建立参考群体； 2选取未知肌间骨数量性状的个体鱼作为候选群体并打入PIT电子标记，并剪取鳍条置于无水乙醇保存； 3步骤1的参考群体和步骤2的候选群体的鳍条样本经提取DNA后，进行低深度基因组重测序，然后对DNA样品进行基因分型，测序数据经群体SNP分型分析后，对获得的原始分型数据进行进一步清洗和质控，再利用beagle软件对缺失基因型进行填充，获得高质量SNP分型数据集； 4利用步骤3获得的参考群体的高质量SNP分型数据集进行单倍型全基因组关联分析，获得每个单倍型的显著性P值，筛选tagSNP建立全基因组选择模型，并计算每个SNP子集下的模型预测准确性，获得最佳标记密度； 5基于步骤3的高质量SNP分型数据集，构建包括参考群体和候选群体中全部个体的亲缘关系矩阵A矩阵或基因组关系矩阵G矩阵，通过平均信息约束极大似然法估计方差组分，从而计算性状的遗传力、性状间的遗传相关； 6在步骤4获得的最佳标记密度下，根据步骤4的G矩阵和遗传力，估计获得候选群体中每个个体的GEBV值，并对其进行从小到大排序； 7按照一定的选择强度，挑选GEBV值小的个体作为亲鱼，进行繁殖，构建家系，这些家系中的个体即为少刺子一代，按照正常的鲤鱼养殖方法培育少刺子一代；连续选育后获得鲤鱼少肌间骨品系； 所述步骤1中制作鲤鱼群体的肌间骨标本的方法为：将活体或冷冻整鱼包裹严实后，高温蒸煮至鱼肉可以完全剥离，待鱼体降温后，于解剖盘去除皮肤组织，小心剔除肌肉，从尾至头依次取出髓弓小骨和脉弓小骨，按其在鱼体中的位置整齐排列，依次粘贴在黑色卡纸上，待全部肌间骨剔取完成后，对卡纸进行过塑固定，制作肌间骨标本； 所述分析指对已测表型群体的表型分布进行正态分布拟合，挑选分型个体，建立参考群体； 所述步骤3中质控的条件为：SNP位点检出率大于0.98，个体SNP检出率大于0.95，SNP最小等位基因频率大于0.05，哈代温伯格平衡；LD过滤条件为滑动窗口100kb，步长2bp，r2大于0.2； 所述步骤4中筛选tagSNP指选择显著性P值排序前50、100、500、1000、5000、10000、50000和全部单倍型的tagSNP； 所述步骤7中一定的选择强度指GEBV排名最小的10%的个体。

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