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博德生物技术(德州)有限公司隗希昱获国家专利权

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龙图腾网获悉博德生物技术(德州)有限公司申请的专利CellRanger单细胞RNA测序数据分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120432008B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-06发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510578637.7,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权CellRanger单细胞RNA测序数据分析方法是由隗希昱设计研发完成,并于2025-05-07向国家知识产权局提交的专利申请。

CellRanger单细胞RNA测序数据分析方法在说明书摘要公布了:本发明涉及单细胞RNA测序技术领域,公开了CellRanger单细胞RNA测序数据分析方法,包括对细胞质量筛选的分级处理以及对基因表达筛选的容忍方式。本发明提供的方法既严格保证了在最终入库的细胞中各项功能指标的完整性,又通过对待定细胞中低表达状态的进一步判断,保留了部分因低整体转录活性而导致候选标记缺失,但可能具有生物学意义的细胞信息。通过这种方法,既能够确保后续分析数据的可靠性,又能尽可能减少因严格一刀切标准而遗漏低表达或罕见细胞的信息。

本发明授权CellRanger单细胞RNA测序数据分析方法在权利要求书中公布了:1.CellRanger单细胞RNA测序数据分析方法,其特征在于,包括: 步骤一,将原始BCL数据转为FASTQ格式,并将测序数据拆分,拆分后,识别细胞条形码和独特分子标记对低质量的reads进行过滤,过滤后,对同一基因的多个reads进行汇总,得到基因与细胞的表达矩阵,得到表达矩阵后,利用细胞呼叫识别得到有效的细胞barcode; 步骤二,获取每个细胞的所有基因的UMI数和线粒体基因UMI数,利用线粒体基因UMI数除以所有基因的UMI数得到线粒体基因比例,同时,设置线粒体基因比例范围阈值,将线粒体基因比例与线粒体基因比例范围阈值进行比较,基于比较结果得出高质量细胞和低质量细胞; 步骤三,对于高质量细胞,基于已经定义的注释选取五个候选基因,分别检测五个候选基因在每个高质量细胞中是否存在并进行标记,标记完成后进行筛选,对于单独一个高质量细胞,必须同时存在一到五的所有标记,才判断为符合的高质量细胞,其他所有情况皆判断为不符合的高质量细胞;获取所有不符合的高质量细胞中,至少存在一个标记的高质量细胞,将其记为待定高质量细胞,对于一个标记不存在的高质量细胞,将其记为非待定高质量细胞,对于非待定高质量细胞,直接排除,对于待定高质量细胞,判断其是否是低表达细胞的方法是:从符合的高质量细胞中随机抽取多个,获取抽取的多个符合的高质量细胞的每一个中的基因种类,对其进行平均化处理,得到符合的高质量细胞的基因种类平均值,同时,获取每一个待定高质量细胞的基因种类,将每一个待定高质量细胞的基因种类分别与符合的高质量细胞的基因种类平均值进行比较,根据比较结果得出不同的应对。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人博德生物技术(德州)有限公司,其通讯地址为:253084 山东省德州市经济开发区袁桥镇崇德八大道3230号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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