珠江水资源保护科学研究所;国家电投集团广西长洲水电开发有限公司;大唐岩滩水力发电有限责任公司;广西平班水电开发有限公司熊芳园获国家专利权
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龙图腾网获悉珠江水资源保护科学研究所;国家电投集团广西长洲水电开发有限公司;大唐岩滩水力发电有限责任公司;广西平班水电开发有限公司申请的专利一种基于DNA条形码及流域生态数据库监测和优化鱼类物种的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120296463B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-06发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510298159.4,技术领域涉及:G06F18/24;该发明授权一种基于DNA条形码及流域生态数据库监测和优化鱼类物种的方法是由熊芳园;王丽;朱远生;叶长青;李善忠;柳志会;周宗安;王月;王超;罗毅;覃杰;梁添;陈一竹;李淼;俄泽琛设计研发完成,并于2025-03-13向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于DNA条形码及流域生态数据库监测和优化鱼类物种的方法在说明书摘要公布了:本发明涉及一种基于DNA条形码及流域生态数据库监测和优化鱼类物种的方法,通过原始数据收集,收集鱼类的Cytb基因序列信息原始数据以及水质参数、生境参数和生物参数原始数据;构建树形结构数据库,以收集的数据为节点形成树形结构数据库,并将原始数据保存到对应节点;待测样本采集与处理,得到Cytb基因序列信息均值数据以及生态参数数据;数据库数据获取与处理,得到同种鱼类不同年份的Cytb基因序列信息均值数据;初步判定本土鱼类,将待测鱼类数据与数据库中鱼类数据对比;生态参数分析与预测,从数据库获取生态参数均值数据并预测本年的生态参数数据;最终判定与优化措施,根据采集的生态参数数据与预测的生态参数数据对流域内鱼类物种进行判定和优化。本发明能够提升监测结果的可靠性和准确性,而且本发明能够适用各种流域,具有广泛的应用前景。
本发明授权一种基于DNA条形码及流域生态数据库监测和优化鱼类物种的方法在权利要求书中公布了:1.一种基于DNA条形码及流域生态数据库监测和优化鱼类物种的方法,其特征在于包括以下步骤: 1收集不同年份、不同季节目标流域内不同区域、不同水层鱼类的Cytb基因序列信息原始数据Anijk,n表示年份,i表示季节,j表示鱼类种类,k表示样本数;在采集鱼类样本时同时收集在该目标流域对应时间、对应区域和对应水层的水质参数原始数据Bnisk、生境参数原始数据Cnisk和生物参数原始数据Dnisk;s表示参数种类; 2以鱼类Cytb基因序列信息、水质参数、生境参数和生物参数为数据节点形成树形结构数据库;将步骤1中收集的原始数据保存到树形结构数据库的对应节点; 3在目标流域内不同区域、不同水层采集待测鱼类样本,同时采集水质参数原始数据B0isk、生境参数原始数据C0isk和生物参数原始数据D0isk;从采集的鱼类样本中提取基因组DNA,采用通用的引物对Cytb基因的DNA条形码区域进行PCR扩增,然后对扩增产物进行测序,获得每个采集的鱼类样本的DNA条形码序列,得到采集的鱼类样本Cytb基因序列信息原始数据A0ijk; 4根据待测鱼类种类,从步骤2的数据库中获取同种鱼类Cytb基因序列信息原始数据Anijk,对原始数据Anijk进行处理,得到同种鱼类不同年份Cytb基因序列信息均值数据Anij; 5将步骤3中采集的鱼类样本Cytb基因序列信息原始数据A0ijk与步骤4中不同年份Cytb基因序列信息均值数据Anij分别比较,若A0ijk与不同年份Anij的差值都在阈值范围内,则判定待测鱼类为该目标流域内的本土鱼类,本次监测完成;否则,记录A0ijk与不同年份Anij的差值不在阈值范围内的鱼类样本Cytb基因序列信息原始数据,进入步骤6; 6从步骤2的数据库中获取目标流域内与待测鱼类同种鱼类不同年份的原始水质参数数据Bnisk、生境参数数据Cnisk和生物参数数据Dnisk;s表示参数种类,对获得的原始参数数据进行处理,得到不同年份的水质参数均值数据Bnis、生境参数均值数据Cnis和生物参数均值数据Dnis;将相邻两年水质参数均值数据Bnis、生境参数均值数据Cnis和生物参数均值数据Dnis分别进行对比,获得对应参数的变化量B1is-B2is、B2is-B3is、……、Bn-1is-Bnis,C1is-C2is、C2is-C3is、……、Cn-1is-Cnis,D1is-D2is、D2is-D3is、……、Dn-1is-Dnis;对上述变化量取均值,得到均值变化量ΔBis、ΔCis和ΔDis;根据均值变化量ΔBis、ΔCis和ΔDis确定目标流域本年水质参数均值数据Bn+1is、生境参数均值数据Cn+1is和生物参数均值数据Dn+1is;然后进入步骤7; 7对步骤3中采集的水质参数原始数据B0isk、生境参数原始数据C0isk和生物参数原始数据D0isk进行处理,得到采集的水质参数均值数据B0is、生境参数均值数据C0is和生物参数均值数据D0is;将采集的水质参数均值数据B0is、生境参数均值数据C0is和生物参数均值数据D0is与本年水质参数均值数据Bn+1is、生境参数均值数据Cn+1is和生物参数均值数据Dn+1is对比,得到差值Xis=B0is-Bn+1is、Yis=C0is-Cn+1is和Zis=D0is-Dn+1is 若Xis、Yis和Zis全在阈值范围内,一年后,重复步骤6和步骤7,若水质参数均值数据、生境参数均值数据和生物参数均值数据的差值全在阈值范围内,则将待测鱼类判定为该目标流域内的本土鱼类,本次监测完成,然后将步骤5中记录的鱼类样本Cytb基因序列信息原始数据添加到步骤2中的数据库中;否则,若Xis中有不少于4项数据、Yis中有不少于1项数据以及Zis中有不少于两项数据表现为目标流域整体生态环境变好,则将待测鱼类判定对该目标流域整体生态环境有益的鱼类,同时记录待测鱼类的数量,本次监测完成,若该待测鱼类数量在整个鱼类群落中占比低于1%,对该待测鱼类进行人工增殖;若Xis中有不少于4项数据、Yis中有不少于1项数据以及Zis中有不少于两项数据表现为目标流域整体生态环境变差,则将待测鱼类判定对该目标流域整体生态环境有害的鱼类,本次监测完成,然后对该待测鱼类进行人工清减。
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