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龙图腾网获悉西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;吉林农业大学申请的专利一种核间等位基因表达分析方法、装置及存储介质获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119905148B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-06发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202411973236.3，技术领域涉及：G16B35/00；该发明授权一种核间等位基因表达分析方法、装置及存储介质是由肖世俊;刘飞;张涛;刘海旭;彭美;郭思扬设计研发完成，并于2024-12-30向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种核间等位基因表达分析方法、装置及存储介质在说明书摘要公布了：本发明公开了一种双核体核间等位基因表达分析方法、装置及存储介质，涉及双核真菌的生物信息学转录组分析技术领域。其中，该方法包括：将双核体真菌的测序数据分别与两个核参考基因组进行比对分析；利用SVM模型对测序数据中每个reads进行核来源分类；将核1的所有基因序列作为查询集，核2的基因序列作为目标集，使用BLAST工具构建基因序列之间的相似性得分矩阵；将相似性评分与基因注释信息结合，通过LightGBM模型分析建立核间等位基因关系；生成counts文件，进行FPKM标准化处理，将标准化后的表达量结合核间等位基因关系索引进行分析，得出分析结果。通过本发明，实现了双核体真菌核间等位基因分析。

本发明授权一种核间等位基因表达分析方法、装置及存储介质在权利要求书中公布了：1.一种核间等位基因表达分析方法，其特征在于，包括： 获取双核体真菌的测序数据，对所述测序数据进行质量控制； 将质量控制后的测序数据分别与双核体真菌的两个核参考基因组进行比对分析，生成两个sam文件，所述双核体真菌的两个核参考基因组分别为核1参考基因组和核2参考基因组，所述两个sam文件分别记录了测序数据中每一个reads在两个核参考基因组上的比对信息； 将比对后得到的两个sam文件进行数据融合，生成一个包含所有比对信息的汇总sam文件； 利用训练好的SVM模型，根据所述汇总sam文件中的比对信息，对测序数据中每个reads进行核来源分类，将来自核1的reads归入nucleusl.sam文件，来自核2的reads归入nucleus2.sam文件； 根据双核体真菌的两个核的基因组注释文件，提取每个基因的唯一ID、染色体名称、起始位置和终止位置； 根据基因组注释文件中提供的位置信息，从核1参考基因组和核2参考基因组中分别提取对应基因的序列； 将核1基因组注释文件中所有基因的基因序列作为查询集，核2基因组注释文件中所有基因的基因序列作为目标集，使用BLAST工具对核1基因组注释文件中的基因与核2基因组注释文件中的基因及其对应的碱基序列进行两两序列比对，获得基因序列之间的相似性评分，构建得分矩阵； 将得到的相似性评分与基因注释信息相结合，通过LightGBM模型分析建立两个核间的核间等位基因关系； 将核来源分类后的nucleusl.sam和nucleus2.sam文件转为计算机可读的nucleus1.bam和nucleus2.bam文件； 使用核对应的基因组注释文件分别对nucleus1.bam和nucleus2.bam进行定量表达分析，获取每个基因的表达量信息，生成counts文件； 对生成的counts文件进行FPKM标准化处理，将nucleus1和nucleusl2FPKM标准化后的表达量结合核间等位基因关系索引，分析核1中的基因及其在核2中的核间等位基因的标准化表达量数据，比较两个核间等位基因的表达差异，或根据核间等位基因的标准化表达量判断双核真菌中的核秩序关系，得出不同基因在核间表达的秩序关系。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;吉林农业大学，其通讯地址为：850000 西藏自治区拉萨市城关区金珠西路130号；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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