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龙图腾网获悉江苏农牧科技职业学院;泰州丰达农牧科技有限公司申请的专利一种地方鹅T2T基因组组装方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN117802091B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-06发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202311854898.4，技术领域涉及：C12N15/10；该发明授权一种地方鹅T2T基因组组装方法是由王健;孟和;赵洪昌;周浩;孙国波;董飚;朱文奇;穆晓恵;李晓鸣;王军;赵孟丽;杨文豪;张干生;纪荣超设计研发完成，并于2023-12-29向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种地方鹅T2T基因组组装方法在说明书摘要公布了：本发明涉及生物科学领域，具体来说，涉及一种使用多种测序技术手段组装高质量鹅基因组序列的方法。该方法采用太平洋生物科学PacBioHiFi读取、Ont纳米孔超长读取、Illumina短读取以及染色质构想捕获Hi‑C多种测序技术手段，成功组装了高质量的鹅基因组序列。组装完成的鹅T2T染色体水平基因组对未来鹅的遗传改良和遗传机制解析奠定了重要研究基础。

本发明授权一种地方鹅T2T基因组组装方法在权利要求书中公布了：1.一种地方鹅T2T基因组组装方法，包括以下步骤：步骤1：样品采集和测序：1采集太湖鹅保种群中的成年雌性太湖鹅，收集翅静脉血液、胸肌和六种器官组织样本，随后进行样本DNA和RNA的提取； 2DNA文库构建和测序，将步骤1中提取的血液样本，利用三代长读长测序和二代测序相结合获得基因组完整片段； 3Hi-C测序文库构建和测序，将步骤1中胸肌组织在甲醛溶液中进行交联反应，以供Hi-C建库测序； 4RNA文库构建和测序，将步骤1中六种器官组织进行二代转录组测序，为提高基因注释准确性，将六种器官组织等量混合，进行三代全长转录组测序； 步骤2：基因组序列图谱构建： 1利用K-mer法基于二代短片段测序数据对太湖鹅基因组大小进行评估； 2通过联合Hifiasm和NextDenovo软件进行基因组组装； 3使用quarTeT软件，对组装的scaffold序列进行缺口填补； 4使用BUSCO调用metaeuk软件进行基因结构预测，并利用HMMER将预测的基因序列与真核生物鸟类参考数据集进行比对；通过分析预测基因序列与参考序列的对齐程度和覆盖度信息，评估太湖鹅基因组组装的完整性，即基因组中是否包含这些保守基因序列； 5使用RepeatMasker软件对鹅基因组的重复序列进行注释； 6在鹅基因组中鉴定端粒和着丝点的过程中，将动物“TTAGGG”作为鹅的端粒识别序列，并利用quarTeT软件的TeloExplorer功能进行端粒鉴定； 7为研究家禽中鹅与鸭、鸡在核型层面上的相似性，使用NGenmoesyn软件对组装好的鹅染色体基因组数据与鸭和鸡染色体基因组进行共线性比对。

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