臻和(北京)生物科技有限公司;臻和精准医学检验实验室无锡有限公司陶威获国家专利权
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龙图腾网获悉臻和(北京)生物科技有限公司;臻和精准医学检验实验室无锡有限公司申请的专利基于NGS的染色体非整倍体检测方法、装置、介质和设备获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114708905B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-06发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210506571.7,技术领域涉及:G16B20/10;该发明授权基于NGS的染色体非整倍体检测方法、装置、介质和设备是由陶威;杨滢;陈维之;何骥;杜波设计研发完成,并于2022-05-11向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于NGS的染色体非整倍体检测方法、装置、介质和设备在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于NGS的染色体非整倍体检测方法、装置、介质和设备,涉及生物医学技术领域。包括接收肿瘤组织和正常组织的NGS测序数据;对所述NGS测序数据进行预处理,获得中间数据文件;利用所述中间数据文件,对性别和胚系SNP进行一致性评估;利用所述中间数据文件获取待测样本基因组上覆盖深度信息及SNP基因型信息;检测肿瘤样本纯度、倍性和SCNV片段;根据单个肿瘤样本和准备好的泛癌队列SCNV数据库,计算每个肿瘤样本染色体臂水平的SCNV;基于样本染色体臂水平的SCNV,计算每个肿瘤样本最终的染色体非整倍体得分。所述装置、介质和设备均基于所述的方法。本发明提高了肿瘤染色体非整倍体检测的准确性。
本发明授权基于NGS的染色体非整倍体检测方法、装置、介质和设备在权利要求书中公布了:1.一种基于NGS的染色体非整倍体检测方法,其特征在于,包括: 接收肿瘤组织和正常组织的NGS测序数据; 对所述NGS测序数据进行预处理,获得中间数据文件;具体地,将肿瘤组织和正常组织测序原始数据进行质控,包括使用Trimmomatic软件去除测序接头序列和低质量序列,然后使用BWA软件将过滤后的cleanreads比对到人参考基因组hg19,经过Samtools软件排序、Picard去除重复序列、GATK4软件局部重比对、GATK4软件碱基质量矫正以及生成索引文件,得到所述中间数据文件; 利用所述中间数据文件,对性别和胚系SNP进行一致性评估; 利用所述中间数据文件获取待测样本基因组上覆盖深度信息及SNP基因型信息; 基于覆盖深度信息及SNP基因型信息,进行肿瘤样本纯度、倍性及SCNV片段检测; 根据单个肿瘤样本和准备好的泛癌队列SCNV数据库,计算每个肿瘤样本染色体臂水平的SCNV; 基于样本染色体臂水平的SCNV,计算每个肿瘤样本最终的染色体非整倍体得分。
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