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龙图腾网获悉中国农业科学院作物科学研究所;三亚中国农业科学院国家南繁研究院申请的专利一种高通量基因型智能分析方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN120656541B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-03发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510990937.6，技术领域涉及：G16B25/00；该发明授权一种高通量基因型智能分析方法是由李慧慧;冯英伟;高尚;何坤辉;张治梁设计研发完成，并于2025-07-18向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种高通量基因型智能分析方法在说明书摘要公布了：本发明公开了一种高通量基因型智能分析方法，包括数据采集与预处理、分子标记识别和亲缘关系与杂交优势预测；对高通量基因型数据进行标准化处理，建立覆盖率、转换颠换比率和错误率三重质量评估标准，并通过位置效应指数校正批次效应；然后基于预处理数据计算样本间的遗传相似度矩阵，通过连锁不平衡网络分析识别具有高度中心性的标签SNP作为分子标记；利用这些标记估算群体亲缘关系并构建系统发生树，同时基于杂合度与遗传距离的关系指数预测杂交优势。本发明显著提高了基因型数据质量、优化了分子标记筛选、精确估算了群体亲缘关系并准确预测了杂交优势，为现代育种提供了高效的生物信息学解决方案。

本发明授权一种高通量基因型智能分析方法在权利要求书中公布了：1.一种高通量基因型智能分析方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤： 步骤S1，采集高通量基因型数据，标准化样本数据格式，并对样本数据进行质量评估并去除批次效应，得到预处理后的基因型数据； 所述对样本数据进行质量评估的方法包括：计算样本基因型覆盖率，计算基因型数据中转换颠换比率，计算基因型错误率；基于质量评估结果进行样本筛选，剔除基因型覆盖率的样本；剔除转换颠换比率异常偏离种群的样本，和分别为种群转换颠换比率的期望和方差；剔除基因型错误率的测序批次数据； 所述去除批次效应的方法包括：构建位置效应指数，其中表示批次中位点的基因型平均值，和分别为位点在所有批次中的均值和标准差，为批次的测序时间，以天为单位，和分别为所有批次测序时间的均值和标准差； 对的位点进行批次校正，校正公式为：，其中为位点的批次效应系数，通过最小化校正后的批次间方差估计得到：，表示位点在所有批次中的基因型值向量； 步骤S2，利用预处理后的基因型数据，计算样本间的遗传相似度矩阵和进行连锁不平衡分析，识别标签SNP作为分子标记； 基于连锁不平衡分析构建SNP位点网络，其中顶点集V表示所有SNP位点，边集E表示连锁不平衡关系，当两个位点之间的大于阈值时，这两个位点之间存在一条边； 计算每个SNP位点的度中心性：，其中为示性函数； 对每个连通分量，选择度中心性最高的SNP位点作为连通分量的标签SNP； 如果多个位点的度中心性相同，则选择次等位基因频率最接近0.5的位点作为标签SNP； 计算标签SNP的捕获率：，其中T为标签SNP集合，为总SNP位点数； 步骤S3，基于获得的分子标记估算群体亲缘关系和进行杂交优势预测； 所述杂交优势预测的方法具体为：计算亲本基因型的预期杂种F1杂合度：，其中为标签SNP数量，和分别表示亲本和亲本在位点上的基因型值； 计算亲本间的遗传距离与杂交优势的关系指数：，其中为亲本和之间的遗传距离； 构建杂交优势预测模型：，其中为预测的杂交优势值，，，和为回归系数，通过最小二乘法基于已知的杂交组合表型数据和对应的分子标记数据进行估计。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人中国农业科学院作物科学研究所;三亚中国农业科学院国家南繁研究院，其通讯地址为：100081 北京市海淀区中关村南大街12号；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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