首都医科大学附属北京世纪坛医院;上海科技大学薛新颖获国家专利权
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龙图腾网获悉首都医科大学附属北京世纪坛医院;上海科技大学申请的专利一种利用多重免疫荧光对H&E病理图像进行自动细胞标注的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118918150B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-03发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410706134.9,技术领域涉及:G06T7/30;该发明授权一种利用多重免疫荧光对H&E病理图像进行自动细胞标注的方法是由薛新颖;郑杰;谢梅;杨杨;吕学亨;张鑫;包辛玉设计研发完成,并于2024-06-03向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种利用多重免疫荧光对H&E病理图像进行自动细胞标注的方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种利用多重免疫荧光对H&E病理图像进行自动细胞标注的方法,包括以下步骤:S1、数据获取及预处理;S2图像配准;S3、基于规则的细胞类型标注。本发明的方法能够将同一组织的多重免疫荧光图像与H&E图像进行配准,利用多重免疫荧光自动对H&E图像进行细胞标注。本发明的方法可以自动产生大量的细胞标注,无需人工参与,并且可以标记的细胞类型也十分广泛。
本发明授权一种利用多重免疫荧光对H&E病理图像进行自动细胞标注的方法在权利要求书中公布了:1.一种利用多重免疫荧光对病理图像进行自动细胞标注的方法,其特征在于:包括以下步骤: S1、数据获取及预处理 收集同一肿瘤组织切片对应的染色图像以及免疫荧光染色图像,首先对肿瘤组织进行多重免疫荧光染色,随后,直接对于同一张切片进行Hamp;E染色,无需进行脱色,得到肿瘤组织的图像以及对应的多重免疫荧光图像;进行预处理,包括降采样至相同像素尺寸、去除伪影、灰度值归一化,得到至少一对低分辨率的和免疫荧光图像对和至少一对高分辨率的图像对; S2、图像配准 对S1中预处理后得到的和免疫荧光图像对,先通过低分辨率的Hamp;E和免疫荧光图像对进行全局配准,再通过高分辨率的和免疫荧光图像对进行局部配准,使两张图像达到细胞级的精细匹配; 其中,全局配准时,将图像作为固定图像,免疫荧光图像的DAPI通道作为移动图像,以计算全局配准所需的变换; 局部配准时,将高分辨率的图像和免疫荧光图像切成大小为的图像块,然后对图像进行细胞核识别,将它转化为细胞核分割图,并丢弃细胞数量少于5的图像块;对于免疫荧光图像,将各个通道加起来,形成一张灰度图像,称为通道加和图;随后,利用Hamp;E的细胞核分割图作为固定图像,免疫荧光的通道加和图作为移动图像,以计算局部配准所需的变换;然后,将得到的变换作用于免疫荧光图像的各个通道,以完成局部配准过程;最后,根据使用配准后的互信息减去配准前的互信息得到互信息增益,将互信息增益低于0.001的图像块过滤掉以进行质量控制; S3、基于规则的细胞类型标注 计算上的细胞核在免疫荧光图像上各通道对应的平均灰度值,对于某类细胞对应的通道,平均灰度值比较高的细胞核有很大可能属于这类细胞;并基于规则对细胞类型进行多标签的标注; 所述多重免疫荧光染色是指对肿瘤组织进行多重免疫荧光染色,标记物包括KI67、PANCK、CD3、CD20、CD21、CD23和DAPI; 所述的规则是指: 1KI67和DAPI是无约束的,可以与任意其他细胞类型共存,一个细胞只要大于相应的阈值即可指派为这两个类别; 2PANCK只要大于阈值,就将该细胞指派为PANCK,而不会属于CD3、CD20、CD21或CD23; 3CD3和CD20细胞是互斥的类型,如果这两者同时大于阈值,则选取平均灰度值较高的一个作为该细胞的类别;如果只有CD3大于阈值,则该细胞属于CD3类别;如果只有CD20大于阈值,则该细胞属于CD20类别; 4对于CD23和CD21来说,CD23必须要在CD21出现的基础上,才能出现。
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